BGIOSGA013396
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA013396 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013396, complete gene. |
| LocusTag |
OS03G0701000 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013396-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013396-PA |
| Length |
7958 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:32272462..32280419 |
| Sequence Coding Region |
32272462..32273880,32274648..32274752,32274838..32274903,32274978..32275142,32275310..32275384 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:32272462..32280419 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:32272462..32280419 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCCGCAGGCGGAGGGCGATGCGGCGGCGGTGCTGGGGGCGGACCCGGCGGGGCTGACGGCGCTGCTGGGGGACCTGACGTCGCCGGCGAACGAGGCGAGGTCGAGGGCGGAGGGGATGTTCCACGCGCTCAGGGCGTCCCACCCGGACGCGCTCGCGCTCCGCCTCGCGCACCTGCTGCTCTCCCCGGCGCACCCCTCCGCGCCCATGGCGGCCGTGCTCCTGCGCCGCCTCATCTCCCCGGGGTCGCAGGCGTTCGTCTACCCGGGGCTCTCCCCCGCCACGCAGTCCTCGCTCCGCGCGCTCCTCCTCTCCGCGGCGTCCGCGACGGGGCTCTCCAAGTCCATCTCGAAGAAGCTCTCCGACGCCGTCGCCGAGCTCGCGTCCTTCCTGCTGCCGTCCAACGCGTGGCCCGACCTCCTCACCTTCCTCTACAAGTCCATCGCCTCCCCATCCTCGCCTCCGGCGCTGCAGGAGTCGGCGCTCAACATCCTAGCCCGGCTGGCCTCCCATCTCGCCGCTGGCTTCCCCAACCTCCACGCCCTCCTCCTCTCCGCGCTCTCGCACCCGTCGTCCGCAGATGTCCGCGTCGCGGGGCTCAACGCCGCTATCAGCCTCATACAGTCTCTCCCCTCTGCCGCCGACCGTGACCAGTTTCAGGATCTCCTCCCAGCCATGATGCGCGCCCTCGCTGAATCGCTCAACTGTGGGAACGAGGGCTCTGCACAGGAGGCGCTTGAGATGATGATCGAGCTTGCAGGTGCAGAACCACGGTTTCTCCGCCGCCAGCTGCCTGACGTGGTTGGTTCTATGTTGCAAATTGCTGAAGCCCCTGGATTAGAGGATGGTACGCGACACCTTGCTGTCGAGTTTGTTGTTACCCTTGCTGAGGCAAGGGAGCGCGCGCCCGGGATGATGAGAAAGCTGCCACGGTATGTGGGCCGGCTATTTGCGGTGCTCATGACAATGCTGCTCGATGTCCAGGATGAACCTGCGTGGCATGCAGCGGTGTCGGAAGAAGAGGATGCTGGGGAGACTGGGAGCTATGTTTTCGCACAGGAATGTCTTGATCGGCTTGCGATTGCTGTTGGTGGGAATACGATTTTACCTGTGGCAGCTGAGTTGCTCCCATCATTTTTTGCTTCTGAAGAGTGGAAGAGACGACATGCGGCACTGGTTACGATAGCGCAGATTGCAGAGGGCTGTGCTAGAGTAATGATTAAGAATCTGGAGCAGGTAGTTGGTATGGTGCTGAATTCCTTCCGGGATCCTCATCCTCGGGTGAGATGGGCAGCTATCAATGCAATTGGGCAGCTTTCGACGGACCTGGGGCCTGAGTTGCAAAATAAACTGCACCATGTTGTCCTGCCTGCATTGGCTTCATCCATGGATGATTTCCAGAACCCGCGCGTACAGGCACACGCAGCTTCTGCGATTCTAAACTTCAGCGAAAACTGCAGGCCTGATATTTTGACACCATACTTGGATGGGATAGTTGGGAAACTACTGTCATTGCTTCAGACTGGAAACCAAATGGTGCAAGAAGGTGCTTTAACTGCTTTAGCATCAGCTGCAGATTCTTCTCAGGAACACTTCCAAAAATATTATGATGCAGTCATGCCATATCTCAAGTCTATACTCATGAATGCAACTGACAAATCAAATAGAATGTTGCGGGCCAAATCGATGGAATGCATTAGCTTAGTTGGTATGGCTGTTGGAAAGCAAAAATTTAAGGATGATGCTAAGCAGGTGATGGAAGTTTTGATGACATTGCAAGGATCTCAGATGGAGGCTGATGACCCTATAACAAGTTACATGCTGCAAGCATGGGCGAGATTGTGTAAATGCCTTGGTCAGGACTTCTTACCATACATGAATGTTGTTATGCCTCCTCTGCTCCAGTCTGCTCAGCTTAAACCAGATGTGAGTGTCACATCTGCTGGGCCAGAAGATGAAAATGGTGAATCTGATGATGAGGGTGTTGAGACTATTACGCTAGGAGACAAGAGAATTGGCATCCGAACCAGTCTGCTGGAGGAAAAAGCAACGGCATGTAATATGCTATGTTGTTATGCTGATGAGCTCAAGGAAGGGTTTTTCCCATGGATTGATCAGGTTGCAACTACTCTGGTTCCTCTCCTCAAATTCTATTTTCATGAAGAAGTTAGGAAGGCAGCCGTTTCAGCAATGCCTGAGCTTCTACGTTCAGCGAAGTTGGCAATAGAGAAGAGCCAATCGCAAGGTCGGGATGAATCTTATCTTAAGCAACTGTCTGATTACATAGTTCCAGCTCTTGTAGAGGCTATACATAAAGAACCTGACACACAAATATGTGCAAGCATGCTGGAATCGCTGAATGAATCAATACAGTTATCTGGAACACTTCTTGAGGAAGGCCAGGTCAGATCTATAGTGGATGGAATTAAAGAAGTAATAACAGCGAGTGCTCTCAGAAGGAGAGAACGAACAGACAGGGCAAAAGCTGAAGATTTTGATTCAGAAGAAGAGGATCTACTCAGAGAAGAAAATGAACAGGAGGATGAAATCTTCGATCAAATTGGTGATTGTTTGGGCACTCTTGTTAAGACGTTCAAGACTTATTTCCTTCCATTCTTTGATGAACTTTCCGTCTATTTGACACCTATGTTGGCCAAGGACAAAACAGTAGAGGAACGAAGGATTGCCATATGCATTTTTGATGATGTTGCAGAGCACTGTCGCGAAGCAGCTGTCAGATATTATGATACATATCTTCCTTCTTTATTAGAAGCCTGCACAAGTGAAAATCCAGATATTAGACAGGCTGCAGTTTATGGTATTGGCATTTGCGCTGAGTTTGGTGGCTCTGCATTTAGGCCTCACACTGGTGAGGCCCTGTCCAGACTATACAATGTAATCAAACATCCCAATGCGTTGGACTTGGATAATGCGATGGCATATGACAATGCTGTTTCTGCTCTTGGGAAAATATGTCAGTTTCATCGTGATGGCATTGATGCATCTCAGGTTGTTCCTGCTTGGTTAAGTTGTTTGCCAATAAAAAATGACTTAATCGAGGCCAAGATAGTTCATGAACAACTCTGTACGATGCTTGAGAAGTCAGATAGGGAGCTTTTGGGTCATAACAACCAGTATCTTCCAAAGATTGTCTCTATTTTTGCGGAGATATTATGTGCGGGTAAGGATCTGGCAACAGAACAAACTTTTAGTAAGATGGTTAATTTGCTAAGACAGCTTCAGACTACATTGCCTCCTTCAGTACTGGCGTCAACATGGTCTTCTTTGCAGCCGCAGCAACAGCTTGCCCTACAGTCTGTGTTGTCATCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPQAEGDAAAVLGADPAGLTALLGDLTSPANEARSRAEGMFHALRASHPDALALRLAHLLLSPAHPSAPMAAVLLRRLISPGSQAFVYPGLSPATQSSLRALLLSAASATGLSKSISKKLSDAVAELASFLLPSNAWPDLLTFLYKSIASPSSPPALQESALNILARLASHLAAGFPNLHALLLSALSHPSSADVRVAGLNAAISLIQSLPSAADRDQFQDLLPAMMRALAESLNCGNEGSAQEALEMMIELAGAEPRFLRRQLPDVVGSMLQIAEAPGLEDGTRHLAVEFVVTLAEARERAPGMMRKLPRYVGRLFAVLMTMLLDVQDEPAWHAAVSEEEDAGETGSYVFAQECLDRLAIAVGGNTILPVAAELLPSFFASEEWKRRHAALVTIAQIAEGCARVMIKNLEQVVGMVLNSFRDPHPRVRWAAINAIGQLSTDLGPELQNKLHHVVLPALASSMDDFQNPRVQAHAASAILNFSENCRPDILTPYLDGIVGKLLSLLQTGNQMVQEGALTALASAADSSQEHFQKYYDAVMPYLKSILMNATDKSNRMLRAKSMECISLVGMAVGKQKFKDDAKQVMEVLMTLQGSQMEADDPITSYMLQAWARLCKCLGQDFLPYMNVVMPPLLQSAQLKPDVSVTSAGPEDENGESDDEGVETITLGDKRIGIRTSLLEEKATACNMLCCYADELKEGFFPWIDQVATTLVPLLKFYFHEEVRKAAVSAMPELLRSAKLAIEKSQSQGRDESYLKQLSDYIVPALVEAIHKEPDTQICASMLESLNESIQLSGTLLEEGQVRSIVDGIKEVITASALRRRERTDRAKAEDFDSEEEDLLREENEQEDEIFDQIGDCLGTLVKTFKTYFLPFFDELSVYLTPMLAKDKTVEERRIAICIFDDVAEHCREAAVRYYDTYLPSLLEACTSENPDIRQAAVYGIGICAEFGGSAFRPHTGEALSRLYNVIKHPNALDLDNAMAYDNAVSALGKICQFHRDGIDASQVVPAWLSCLPIKNDLIEAKIVHEQLCTMLEKSDRELLGHNNQYLPKIVSIFAEILCAGKDLATEQTFSKMVNLLRQLQTTLPPSVLASTWSSLQPQQQLALQSVLSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..1419#2187..2291#2377..2442#2517..2681#2849..2923#3007..3161#3412..3547#3632..3701#3780..3907#4016..4072#4531..4716#5237..5329#5694..5779#5874..5940#6080..6146#6223..6359#6825..6916#7056..7122#7794..7958#ATGGATCCGCAGGCGGAGGGCGATGCGGCGGCGGTGCTGGGGGCGGACCCGGCGGGGCTGACGGCGCTGCTGGGGGACCTGACGTCGCCGGCGAACGAGGCGAGGTCGAGGGCGGAGGGGATGTTCCACGCGCTCAGGGCGTCCCACCCGGACGCGCTCGCGCTCCGCCTCGCGCACCTGCTGCTCTCCCCGGCGCACCCCTCCGCGCCCATGGCGGCCGTGCTCCTGCGCCGCCTCATCTCCCCGGGGTCGCAGGCGTTCGTCTACCCGGGGCTCTCCCCCGCCACGCAGTCCTCGCTCCGCGCGCTCCTCCTCTCCGCGGCGTCCGCGACGGGGCTCTCCAAGTCCATCTCGAAGAAGCTCTCCGACGCCGTCGCCGAGCTCGCGTCCTTCCTGCTGCCGTCCAACGCGTGGCCCGACCTCCTCACCTTCCTCTACAAGTCCATCGCCTCCCCATCCTCGCCTCCGGCGCTGCAGGAGTCGGCGCTCAACATCCTAGCCCGGCTGGCCTCCCATCTCGCCGCTGGCTTCCCCAACCTCCACGCCCTCCTCCTCTCCGCGCTCTCGCACCCGTCGTCCGCAGATGTCCGCGTCGCGGGGCTCAACGCCGCTATCAGCCTCATACAGTCTCTCCCCTCTGCCGCCGACCGTGACCAGTTTCAGGATCTCCTCCCAGCCATGATGCGCGCCCTCGCTGAATCGCTCAACTGTGGGAACGAGGGCTCTGCACAGGAGGCGCTTGAGATGATGATCGAGCTTGCAGGTGCAGAACCACGGTTTCTCCGCCGCCAGCTGCCTGACGTGGTTGGTTCTATGTTGCAAATTGCTGAAGCCCCTGGATTAGAGGATGGTACGCGACACCTTGCTGTCGAGTTTGTTGTTACCCTTGCTGAGGCAAGGGAGCGCGCGCCCGGGATGATGAGAAAGCTGCCACGGTATGTGGGCCGGCTATTTGCGGTGCTCATGACAATGCTGCTCGATGTCCAGGATGAACCTGCGTGGCATGCAGCGGTGTCGGAAGAAGAGGATGCTGGGGAGACTGGGAGCTATGTTTTCGCACAGGAATGTCTTGATCGGCTTGCGATTGCTGTTGGTGGGAATACGATTTTACCTGTGGCAGCTGAGTTGCTCCCATCATTTTTTGCTTCTGAAGAGTGGAAGAGACGACATGCGGCACTGGTTACGATAGCGCAGATTGCAGAGGGCTGTGCTAGAGTAATGATTAAGAATCTGGAGCAGGTAGTTGGTATGGTGCTGAATTCCTTCCGGGATCCTCATCCTCGGGTGAGATGGGCAGCTATCAATGCAATTGGGCAGCTTTCGACGGACCTGGGGCCTGAGTTGCAAAATAAACTGCACCATGTTGTCCTGCCTGCATTGGCTTCATCCATGGATGATTTCCAGAACCCGCGCGTACAGGCAAGTTATTATTGAGGATTTACACTTAAGTCATCTGCTGCACTTCTTTCAATATTCGTTATCGTATTTTATAGTGTAAACTATAAAGCATTGGTGGCCCTGTAACCCACAAGTATCAAGCTCAGAGGAACTTGGAAGTTAAAAAGATATTATCTTGACATATATGCATTCTAAGGAATGAGTAGAAATTGCTGGAAACTAAAAATTATATTTAAAGAGAAGTTCGTAGACTGATTAAGGTCTAATGCTCAAAGCTGTCGTACTTTTAATAGAATAGTACATGGAAATTTTCTCAATTATATTACATATGTATCAGTAAGGAATGGGTCTATTTAACCCCTCAACTATCGTGTTGGTCTAATTTCAACTCTCCAGTTATGCAAGTATGCAACCTTGTAAAACACAATTCTTGAATATCAATACCCAACAATCTACAACCCTCAACCTCACCCTAGTTGTTTGATGTTTGAAGTACCATACAATGTGAGTGATTATGCTAGCCTATGTGCACAGGTTATTGTCGTGATCAAGTTTCATGATGCAATGATTTAGAGAGGTTTGATGAGACTGCTATTAATGCCTAAATTGTTTGTAGTGTGTCCTCATCTGAGATCACAACTGGTTACACGTTTTTTTAGTTAGTGGCCATTAGTTTGTGCCACTTGCTTTTTCTTTGACATATACTTACAATTGACTTGTCATTAATACCCATCAAGTTATCAGCTAGACATGCTCTAATCATTGTTTTATATTCCGAATGAGTTCAGGCACACGCAGCTTCTGCGATTCTAAACTTCAGCGAAAACTGCAGGCCTGATATTTTGACACCATACTTGGATGGGATAGTTGGGAAACTACTGTCATTGCTTCAGGTAATCCTTGCATTTGATCATGGAGCCTTCATTTTGTGCAGCATAAATATGAACCTTTTCGGAAATTTTGTTTGTTTTCTGATAGACTGGAAACCAAATGGTGCAAGAAGGTGCTTTAACTGCTTTAGCATCAGCTGCAGATTCTTCTCAGGTACAAGAGGAAATATTTTTGAAGGTTTTCGGGCCAGCATTCTTGCTCAAAGTTTTGCAATCTTATTGTTTCAGGAACACTTCCAAAAATATTATGATGCAGTCATGCCATATCTCAAGTCTATACTCATGAATGCAACTGACAAATCAAATAGAATGTTGCGGGCCAAATCGATGGAATGCATTAGCTTAGTTGGTATGGCTGTTGGAAAGCAAAAATTTAAGGATGATGCTAAGCAGGTAATAATTTGCTAGTTGCTCTGATACATTGTAATACGTTTGAAGAAAATGTCAAAGCACACTGTATAAATGTTATTTATGACGTTCTGATTGTATTGCTGATGGGCTTATTTGAATGCTGTTTGCTGAATTCGTTGTTTCTTTGGCTAACATATTTCTCTTGCTAGGTGATGGAAGTTTTGATGACATTGCAAGGATCTCAGATGGAGGCTGATGACCCTATAACAAGTTACATGCTGCAAGTATGTTGTAGCTTAAATACTATTGCCATTTTATGCCATCACTAGTTTGCTTCAGTTTTGCTTATTCTAATTGCATTTTCTAGGCATGGGCGAGATTGTGTAAATGCCTTGGTCAGGACTTCTTACCATACATGAATGTTGTTATGCCTCCTCTGCTCCAGTCTGCTCAGCTTAAACCAGATGTGAGTGTCACATCTGCTGGGCCAGAAGATGAAAATGGTGAATCTGATGATGAGGGGTACGTTTTTGTTACGCTGGCAACTTACCATAATGTTGTCACATTCCCATGATAGAATATTGAAATTGATGAATTGTTATCATTGTAGGCATGATATTAGTTTGTTGCCCTGTTTCAAATTTGCATGTATTTGTCAGATCCATAACAGAGCATTTAATTTGAATGTTGATATCCTGTTGTTGTCTGATTCTATGATCTTATGATATCTGTAAAATTTTGTGTTTTACCTGGCTGCCTGCATAAAATGCAGTGTTGAGACTATTACGCTAGGAGACAAGAGAATTGGCATCCGAACCAGTCTGCTGGAGGAAAAAGCAACGGCATGTAATATGCTATGTTGTTATGCTGATGAGCTCAAGGAAGGGTTTTTCCCATGGATTGATCAGGTTATGTTATGATTTTTTGTGAACTCTATGTGTACACGCACGCGCCTATGTGAAGAGCTTCAACTGAACCTTGAATCTGTACAGGTTGCAACTACTCTGGTTCCTCTCCTCAAATTCTATTTTCATGAAGAAGTTAGGAAGGCAGCCGTTTCAGGTCTGCAACTACCCTTTTCAGTGTATTCTCCATTATTTTTAGCATTTTTCTCAAAGTGACATTGTGTTATCTCCCTAGCAATGCCTGAGCTTCTACGTTCAGCGAAGTTGGCAATAGAGAAGAGCCAATCGCAAGGTCGGGATGAATCTTATCTTAAGCAACTGTCTGATTACATAGTTCCAGCTCTTGTAGAGGCTATACATAAAGTAAGCATAGCATGCTAACTGAAACTCCTTACTTTTCCTTAGTACTTGTTTTGTTGATCACTGTTGTTCTGTTTAAGCATGTTATTGAAAGTTTGAAACTTTATGCAGGAACCTGACACACAAATATGTGCAAGCATGCTGGAATCGCTGAATGAATCAATACAGGTCTTGTATTGCTGTACCCTAAGTTTTTGTGATATTACACTGAGCTTAATTTAGGTGATAAGCTTCAATATCTTAATTTAGGTGATAAGCTTCATATAGCTTCAACTCTTGTTTGTGCAACCTATATGATTTTTAGTACTTAAAAACCTCTGTGAAATGTGCGACACTTATGGCTTAAACTATGCTCCATCCAATGGTAAAACACAAATAAATTGTGGTTTGAGGTACTACCTGGGTTTGAATGAATTTAGTATTAACTACTTTGTACTGTATTGCTAACAAAACTGACATGTTTACATTTATAGCATCGTGTTGATTGCCTCTTTCTGGAAAATCTGACCTTTAGTGATGAAATCTGTGACAAATAATTTTTATTTGCTCCTTTTTATTTCCATGCTGTATCCATGTTTACTCCATACAGGACACCATAATAATCTGAACTCTGTTTCTTCACTTAGTTATCTGGAACACTTCTTGAGGAAGGCCAGGTCAGATCTATAGTGGATGGAATTAAAGAAGTAATAACAGCGAGTGCTCTCAGAAGGAGAGAACGAACAGACAGGGCAAAAGCTGAAGATTTTGATTCAGAAGAAGAGGATCTACTCAGAGAAGAAAATGAACAGGAGGATGAAATCTTCGATCAAGTAAGCTATTGAAAACTAGACTGCTAATATTTCTGGAAAAAAAATAGTATATTTAGATGTACCT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|
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