BGIOSGA014228
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014228 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014228, complete gene. |
| LocusTag |
H0821G03.5 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014228-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014228-PA |
| Length |
12860 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:31920016..31932875 |
| Sequence Coding Region |
31931142..31932875,31929896..31930073,31920016..31920788 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:31920016..31932875 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:31920016..31932875 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACTCCTGGCAAAAGCAGCCAATCTGATTTAGTAGATATGGAGAAGATGGTGAATTCTATCACTAGAGAAATAGATCTGTACTGGTCTGCGGTTGAGTCTGATGAAGGAAATAAGCTATGCTCAATCCACAAAGTGCCGCAACATATTCTTGAGGTTGATAGGAATGCTTATGAGCCAATAATTCTATCAATCGGCCCATATCACCATGGAGCTCCTAAGCTGACAGCCATGGAGAGAGAAAAATGGAAGCGTTTAGACTTTATTCTCAAGTTGAATTGTGAATTAAGTTTGCAGGATTACATAAGAGCAATTCATAAACTGGAGAAGCAAGCAAGATGTTATTACTCTGAGGAGATACCAATGGAAAAAATGATGTTTGTGAGGTTGCTTTTGCTTGATTCATGCTTCATCTTAGTAAAAGTTGATAGAACTGTTGTAGCAGCAATGCAATTAAAAGAGGTGCCAACAGATGTTACTCCGGGAAGTATTGCTGTTAAAGATGGTCTAAACTCTGGTCAAGAAGTTGAAAGCAACTGTCCTATGCAAAGACGTGAAACTGAGATTGCGGTGCATGAAATTGAACTAACTAAATCTCATTTTGATCATATTGAGTCCAAAAGTAATAGAACGGAGCATGAGCAAAATGCTGACTATGCATCTGGTTGCAATAATTCTGGAGATTGGTATGCTAACTATGCTTGGCATGATTTGTTCTTGCTGGAAAATCAAATGCCTTTCTTCATTGTTGAGGCAGTATACAATTTAGCTTTAAGCAAACAGAGAGCAAAGGCCTTTCTTAGAGACAAAATTGTTGAATGTGTAGAAGATATCCTGCGTCAATTTCCAAAAGGCATTGAAGAATCTAAAAAGCCTAAGAATTTTTATCATTTGCTGCACTTATGTCATATGTACCTGCGGCCAACCCATAAGTGTGTTGGGACTAATCAAAATCACTCAAAGGTACGGTTTTTTCATCATCTAGTTTATTTAGGACAGAGGTATGTTGGTTCTAACCAAAAGGAAAATGAGGAATCCCGACTGCTAACTCGCCAGAAGGATTGCTTCCAAGATGAGCAATTACCAATTCGATGGCGTCAAGCAGTACAATACCATGAAATAGGAGTTCAACTGAAGAAAAGGGTATACAGCATCTATGAGAAACATTCTCTCTTGGACATAAAGTTCAGTAATGGAGTTCTAGAAGTCCCATGTCTTACTATCGATGAGAATACCGAGTCTCTGTTCAAGAATTTAATTGCATTTGAGCAAATGGATTCTCAATATGAAAACTATATCACAGCTTATATCGCTTTTATGTCTCAGCTTGTAAGCACTTCTGAGGATGCCACTCTACTTATTGAGAGAGGGATAATTGTTCATATGCTGGATAATGACGATGAAGTGTCAGCTATGTTCACCAGGCTCAGCACACATTTGATATTTGGTTCTGATACCTACCACTACCTTCAAACTTTATCCTATGTTTTGGAGGACCATTACCAAAGCAGGCTGAACAGATGGATGGCTTGGCTCTGGCGTAATCACTTCAGCAATCCATGGTTAGCATTAGGTGTGTTGGCTGCAGTGGTCGTCCTACTCTGTACCATTGTTCAGACCATATTTACAGTCCTAGCCTACAGCAATCCCAGTGATGATGGCATTTTTATTCTCTTTCTAAGTGAACACATTCCTATTTCTTGTTCAATTTGGTACTGGTATATATGTTATCTGCGAAAGATGGTTGTCAAAGCAGCGTTCGCAGTTGCCATGTTTTTGCTCACAACCAATATGCTCGTTTCTGTTGCCACACGGTCTCCGGATAACCTCCTAAACTCTTTTCCTGAAGAAACGGGTCACGTCTACTCAGCGTCAACTGTGCAGAAGATGACCGAATACAAGCCCACGACTGATAATTGTGCTTCATCACAATGTTTGACAGATGACCTTGCTAAGTATGTCGAGGCTGCTTTGCGTTGGTATCCAAAAGCAATTACTGATTCTGACAGACCGATAGACTTTCACCATTTGCTTCACCTGTGTCATATTTACTTCCAACCGAGTCAGAAGCTGGAGGAAGATCACAACTATAAATTTGTGCCTCAGTACATTCACAGTTTCCTCAGTTTTGGACGGAAGTATTTCAGAATCAACTACTACCTAGAAAACAATAGACATGATTCATCATTCCAGAACGAAGTGGATCTGGCACAAGGAGGGGATCAGCTTAATCGTTGGCGACGAGCTGCACAATATCTAGAAGCCGGAATAAAGTGTAAGAAACGGGAATATGATAAATTAAAACCCCATTCTCTGCTAGACATTTGGTTTAGCAATGGTTCCATGGACATTCCGTGTATTGTTGTTGATGAGTACACAGGGAGTCTTTTCAGGAACCTTATTGCGTTTGAACAAACCTGCCCTCAATTTGGAGATGACTTCACTGCTTATATTGTTTTCTTGTCTCAACTTATAAGCATGCCAGAGGACGTTACGCTGCTTATTCAGAGAAAAATCATTGTGCACCAGCTTGATAGCGATGAAAGGGTGTCTGATCTCTTCACCACGCTCAGCAAAGACGTGGTTTTTGATTTCAATGGTAACTACTACTTAAAACTCTGTGCCAGACTATGGAAGCTCACTATCAAAGTCGCATCAATCGGTGGATGGCATGGCTCTGGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTPGKSSQSDLVDMEKMVNSITREIDLYWSAVESDEGNKLCSIHKVPQHILEVDRNAYEPIILSIGPYHHGAPKLTAMEREKWKRLDFILKLNCELSLQDYIRAIHKLEKQARCYYSEEIPMEKMMFVRLLLLDSCFILVKVDRTVVAAMQLKEVPTDVTPGSIAVKDGLNSGQEVESNCPMQRRETEIAVHEIELTKSHFDHIESKSNRTEHEQNADYASGCNNSGDWYANYAWHDLFLLENQMPFFIVEAVYNLALSKQRAKAFLRDKIVECVEDILRQFPKGIEESKKPKNFYHLLHLCHMYLRPTHKCVGTNQNHSKVRFFHHLVYLGQRYVGSNQKENEESRLLTRQKDCFQDEQLPIRWRQAVQYHEIGVQLKKRVYSIYEKHSLLDIKFSNGVLEVPCLTIDENTESLFKNLIAFEQMDSQYENYITAYIAFMSQLVSTSEDATLLIERGIIVHMLDNDDEVSAMFTRLSTHLIFGSDTYHYLQTLSYVLEDHYQSRLNRWMAWLWRNHFSNPWLALGVLAAVVVLLCTIVQTIFTVLAYSNPSDDGIFILFLSEHIPISCSIWYWYICYLRKMVVKAAFAVAMFLLTTNMLVSVATRSPDNLLNSFPEETGHVYSASTVQKMTEYKPTTDNCASSQCLTDDLAKYVEAALRWYPKAITDSDRPIDFHHLLHLCHIYFQPSQKLEEDHNYKFVPQYIHSFLSFGRKYFRINYYLENNRHDSSFQNEVDLAQGGDQLNRWRRAAQYLEAGIKCKKREYDKLKPHSLLDIWFSNGSMDIPCIVVDEYTGSLFRNLIAFEQTCPQFGDDFTAYIVFLSQLISMPEDVTLLIQRKIIVHQLDSDERVSDLFTTLSKDVVFDFNGNYYLKLCARLWKLTIKVASIGGWHGSG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..1734#2803..2980#12088..12860#ATGACTCCTGGCAAAAGCAGCCAATCTGATTTAGTAGATATGGAGAAGATGGTGAATTCTATCACTAGAGAAATAGATCTGTACTGGTCTGCGGTTGAGTCTGATGAAGGAAATAAGCTATGCTCAATCCACAAAGTGCCGCAACATATTCTTGAGGTTGATAGGAATGCTTATGAGCCAATAATTCTATCAATCGGCCCATATCACCATGGAGCTCCTAAGCTGACAGCCATGGAGAGAGAAAAATGGAAGCGTTTAGACTTTATTCTCAAGTTGAATTGTGAATTAAGTTTGCAGGATTACATAAGAGCAATTCATAAACTGGAGAAGCAAGCAAGATGTTATTACTCTGAGGAGATACCAATGGAAAAAATGATGTTTGTGAGGTTGCTTTTGCTTGATTCATGCTTCATCTTAGTAAAAGTTGATAGAACTGTTGTAGCAGCAATGCAATTAAAAGAGGTGCCAACAGATGTTACTCCGGGAAGTATTGCTGTTAAAGATGGTCTAAACTCTGGTCAAGAAGTTGAAAGCAACTGTCCTATGCAAAGACGTGAAACTGAGATTGCGGTGCATGAAATTGAACTAACTAAATCTCATTTTGATCATATTGAGTCCAAAAGTAATAGAACGGAGCATGAGCAAAATGCTGACTATGCATCTGGTTGCAATAATTCTGGAGATTGGTATGCTAACTATGCTTGGCATGATTTGTTCTTGCTGGAAAATCAAATGCCTTTCTTCATTGTTGAGGCAGTATACAATTTAGCTTTAAGCAAACAGAGAGCAAAGGCCTTTCTTAGAGACAAAATTGTTGAATGTGTAGAAGATATCCTGCGTCAATTTCCAAAAGGCATTGAAGAATCTAAAAAGCCTAAGAATTTTTATCATTTGCTGCACTTATGTCATATGTACCTGCGGCCAACCCATAAGTGTGTTGGGACTAATCAAAATCACTCAAAGGTACGGTTTTTTCATCATCTAGTTTATTTAGGACAGAGGTATGTTGGTTCTAACCAAAAGGAAAATGAGGAATCCCGACTGCTAACTCGCCAGAAGGATTGCTTCCAAGATGAGCAATTACCAATTCGATGGCGTCAAGCAGTACAATACCATGAAATAGGAGTTCAACTGAAGAAAAGGGTATACAGCATCTATGAGAAACATTCTCTCTTGGACATAAAGTTCAGTAATGGAGTTCTAGAAGTCCCATGTCTTACTATCGATGAGAATACCGAGTCTCTGTTCAAGAATTTAATTGCATTTGAGCAAATGGATTCTCAATATGAAAACTATATCACAGCTTATATCGCTTTTATGTCTCAGCTTGTAAGCACTTCTGAGGATGCCACTCTACTTATTGAGAGAGGGATAATTGTTCATATGCTGGATAATGACGATGAAGTGTCAGCTATGTTCACCAGGCTCAGCACACATTTGATATTTGGTTCTGATACCTACCACTACCTTCAAACTTTATCCTATGTTTTGGAGGACCATTACCAAAGCAGGCTGAACAGATGGATGGCTTGGCTCTGGCGTAATCACTTCAGCAATCCATGGTTAGCATTAGGTGTGTTGGCTGCAGTGGTCGTCCTACTCTGTACCATTGTTCAGACCATATTTACAGTCCTAGCCTACAGCAATCCCAGTGATGATGGCATTTTTATTCTCTTTCTAAGTGAACACATTCCTATTTCTTGTTCAATTTGGTACTGGTATATATGTTATCTGGTGAGAATACTACTGACAGGTATGTATCCAATTGAAATATGATGCTAGAGTAAAGTGCAACTCACCTTAAATCATCCCGGTATAAAGTGAAACACGATGTAATTTACCTGGTGCGAAGTATAATGTACTAGAAAAACATTAATTTGCATGGTCTTCGATTAGTAATGTGAAACCTATCCTACTTAACATTCTTTTCAAATAATGAGAATTCCCTTTGCAATTGCGTGACTTGACACCATTACATGTTTGTATTTAGAGTTAGAATTATAATGTGTGCAATTACTGTGTTTGTTGTTTAAAATAAAATTGTACTTCTTTCAACCTTTTTGTATCAATCAATACCACTGGAATCTAGGCCACTACAATCAACAGTGTAGAACTAATTTTTGCTCATAACCTTCGTAATTTCTAATCCTTGAGAGCAAACTTGATGATTTCTTTTAACCTTTTATGTACTTTAGTTTAATATAACAAACATAAGAAGTCTTTTAGGAATATATAGCTCTCTTGTGCAGCATTGCAATAGAAACTACTCACAATTTTACATGATGGTATGCTTGCATGTGTAATATTTGTACTAAATTTACTACCCTCCATTGAAACTAACATCATTTTCTGGGACTTCTATTCTACATATTAAGCAACAGGACAAATTATTTATTTAGCAATAGTGAACTAAAGGGTTTGTTCAGATTGATACCATTTAAAACTATATCATTTTTTTTTGGGTAGAATTGCCAAATATGCGCATCCATTTAGTTTTTTTTTGTCAAACTTTGATAAATACATAACAAATTCTGCCAAAATTTTGGCAATTTGAAAATTTGGTAAGGTTTATTTTGGCAACAATCTGGACAGCCCCTAAGAATATTGTGGGGGTCCCTTTATTTTCCCACGTGCATGCTTTAAATAGAACCTACTAGATATTTGATTCCCCCTAGTTCGCTATGCTAAGTGCATTTGATCGAAACTATACCATGTGACTAGAGTTGGGATCACATTTTACATTACTATATAAATAGGCATGCGAGCTGCTTATTTCATCATCTCGTTTTCACTTCCTTGCAGCGAAAGATGGTTGTCAAAGCAGCGTTCGCAGTTGCCATGTTTTTGCTCACAACCAATATGCTCGTTTCTGTTGCCACACGGTCTCCGGATAACCTCCTAAACTCTTTTCCTGAAGAAACGGGTCACGTCTACTCAGCGTCAACTGTGCAGAAGATGACCGAATACAAGCCCACGACTGGTTAGCATTTCATTGTTCTATTACAATCGCTTAATCTTTTTTTTTCTGATTCTTTCGACTCGCTTAAATGTTAGAGTATTTGCACACCTCATACCTGACGCTGGACTCTCTTTTTCTTGACAGCTCAAGGTCCCGGATTCAGTTCCGAAGAGAAAATAGTCATGACTGGGCCCAATAATTTTGTCTGGCCGACGCGCCCTGCACCGTGCAGCTCACGAACCTGCTAAATCAACCACAGCTTTTGCTGCATGCGACGTCGCTGAGATGATCAAAATATCTTTCTATATCTGCCATTTTCTCTGTATTGTCGAACTGCTGATGAACTATGCTCGGAACGCTTAAATAAAAAGCAAAGGAAGAGTGAGAGAGACACAAAATTCTTGTTTTACGATCTTATCACCACTCGTTTACTATGTTTCCGTTTAATTAAATGTGGTATTGCGATGGATGATAAAACTAGTTATAACCCAACGATGCCTCCTGGATGATCCATGTAATGGACCGAATGGTAGCCATCCAATGCAGAAAAAACTGGCAAAATAGAGTTGAACAATCGTAGATTCGTAGTCAAACTGGTGATTGAACCGTTTTTACGGTAGCGCTAAATCGCTAATCGCGCAGTGCTACGCTCGATTAGTAGCGCGCCTCATGGAGCCCGGTTTCTCGTTTTTTTTCTGTTTTCCAACACGCACAACACCGTTTTATTATTTTTCCGCCGCACTCCACTCTTCTTCACATAATAACAGAGTAAAACAATTGCTCCAATCCCCTCTAGCACTCTCCAACACCGTTAGGCTGTGTTCTTTTATCCATTTCCTAACTTCTTCTTCCTCATTTTTCGCATGCGTGCTTTTTAAATAATTGAACGATATGTTTTTTTAAAAAAAAACTATAGAAAACTTGTTTTAAAAATAATACTAACATATTTTTCAAGTTATTTTAGTTTATGTGTAATTAATTATACACTAATCCCCAGAGGTATGGGTTGGGAATCACCCATACCTCTCAACACCAAAATCCCTATTTCGCGCATAGGAATGTGTCACGCTCACCATGCGACCACCCACGTGGCACGCTGGGAGAGGCGAGTGGGTCGGCGTGCACTTGGGCGAGGGGAGATGGAACGACACATCTTTTTATACATTGTATATGTATATATTTTTATACGTAAAAAATTATGTATGTATATAAAATATATATACACTTCACATACATACATACGTATATATTTTGTATACGCGTATGTAAAAGTTATACCTATGAATATAAAATATATACATATGTACAGTACCAGAGAGGGGATGCGCGGGGGAGGGGTGTTTGCGCAGGCACACATTAGAGCAGGTACAATAGCAAGCTATAAGCCAGTTATAACCACATATCGAGAAGAAAAGATAAAAGAGAGAGAAGAAAGCGGCTACAGATTTGTAGCTGGCTGTAACACGGACTCCAAAACGTTATGTGTGTATGATAGGTGTGACCGGTATTAATGGTGTAGTATATTTTTATAGTTAACAATTGTATGAATGTGCTATTAGATTAATTATAGATGATTTAGAGTCAGTAATTGGCTATAGTATTATACTTGCTCTTGGCACCCTCTCCCCAGTCCCCACACCCCACAGCCTTATTAATTATGCTCCCACGAAGGAGGTATGGAGTATTCGGTTCAATCGTTTTCTATAATCTTGGAATTTAACCAGACCAGACTGAAATTAAGGGTGGAGCTCATTGGTCCGGAGGACGACTAGTAAAATATGTTTTCTAAAAGGCCTATAGTGTAACGCGTGTCGGGATTTGGCCTGCTAATATCTCCGCCTCTTCGCGAGCTCTAAACGGGACGAAATATATTTTGCAAAACCTGATAAAATTTGCTCTATGAAACTATATATTTGTGACATTTACGACATGACACTATAATTTTTTAGAAACATGGTACAAATGCAGGCGTTTATAACACGTGTACACTCACAC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