BGIOSGA014597
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014597 |
|---|---|
| Description |
SKIP interacting protein 20 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014597, complete gene. |
| LocusTag |
SIP20 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014597-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014597-PA |
| Length |
7813 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:26356986..26364798 |
| Sequence Coding Region |
26364676..26364798,26362913..26363074,26362745..26362832,26361975..26362199,26361571..26361738 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:26356986..26364798 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:26356986..26364798 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGAGCACGGGGGAGCCCGACCGGAAGCGGCGGCTCAGTAGCTCCGTCGCGCCCGGCGGCGGGGCCCCTGTTTCTCCTGCCAAGCGGCTGGCGGTTGCACCCACCTCCGAAGATAAGAAGCTCGATTTTACTGTACTCAAATACAAAAACCAAAAGCTCTCAGAGCAACTAGAAGCCCACAAGTTTGAGTATCGTGCTCTTGAAAATAAATTCGCTGGGCTAAAAGAGAAGCAGAGGACTCATAATGAGACACTTTCCTTGGTCAACAGTTCTTGGGAACAACTTGTGGCAGACCTGAAGTCAAGATCTTTTTGCAAAAGTGGATCTCCTAATTCCAGCCCTGGTTCAGGGCACAACAATGTACAAAAGGATGGTACTTGTGCACCCATAGAGAGGGACACTCTTAGAAGTCTTGTGGAATCTGGTGCAACTGAAAGTTCAGGTTGTTTGCCTGGTTGCCACTTGGGAAGTGATGCCCCTCCATTACATCTATCCACAGCTAATGCACTTGGGGATATCTTTTTTCCATCAAGTGATCTTTTGCAAGCAAATGAGGAGTGTGCTTTGGCTGCTCTCACTAAATTACCAGAAAATGACCGCAGTAAGCAACTACAGAGTACTAGTAGCAACCTGTTGTCCAGCCTCAATAATGTTGTACAAGCATTAAGTAATCTTCAGTTGAAGCACAAGCAGTTAGCAGAGGATTATCAAAATCAAAGAGATTCCAGTGCCCGAAAAAGAGCTGAACATAGACGTCTAAAAGAGGAGTTGGCCAGTGCTGCTTCTGAGTTGGAAGAAACTAACTACAAACTGGCAGCACTTAAAGCTCAAAGAGATAATACACAAGGAGCTCGAATCCCATATCCTACATTAGGAAACAAAAGTATGCCTGAAGATAAGGTCAGAGATAAACAAAGAGAGATGCAGGATCTTGAAGCTACTCACAAGGAATTATCGGAATTGATTTCAAAGCGGTTGGTGGAAATTAAGAGATTACATGAAGAGAGAATTGAAATTTTGAACAAAATAGCAACTTTTCAGAATATCTTGATGGATTTCAAGAGCATTCGTTCTTCAAAAGCTTTTCAGCTTGTTAATGATCGACTTCAGAAGTCACAAGCAGAATTGGATCACTACCAGACATTATTAGAGAAATTACAGGTTGATAAGGATAAGTTCGTGTGGCAAGAAAGGCAATTTAATTTGAAAGTTGATCTGGCTGAGATTCCTGAGAGGGTTTCTACATATTGTGAGTCTAGCATTGCTGATCTCAAGAAGGATATTCAGAAACTACGTGATGAAAAAAACATGCTTATTCTCAAACTTGAAGAGGCTTCAAGAGAACCTGGTCGGAATCAAGTTATTACAAAATTTAAAGCTTTAGTGTCATCGATACCAAGGGAAATGGGCGCGATGCAGAGTGAAATGACCAAACACAAGGAGGCTTCCTTGGAGTTGAATTCTTTGCGAGCAGAAGTCCATTCACTTTCTCGCATTCTGTCCAGAAAGGAACGTGATAATGAAGAAGCATCATGCAGATCTGCCCGTGCGGGATCTGATATAACACAACTTCAATCAGTGATTTCTGATCTGAAGCAAACTAATAAGGAGCTTAAGTTGTTCGCGGATATGTATAAGCGCGAATCCACTGATTCCAGGGAAATAATGGAATCCAGAGATAGGGAATTCCTTGAATGGGCTCATGTTCATGCCCTGAAATCATCTCTTGATGAAAGTAAGCTAGAGCAGCGTGTTAAGGCTGCCAATGAAGCTGAAGCAATCACACAGCAGAGGCTAGCAACTGCAGAAGCTGAGATTGCTGAATCAGGGCAGAAGCTTGGGACTTCTAGAAAGGATCTAGTCAGTTTATCCCATATGCTGAAGTCTAAACAGGAAGAATGTGAAGCTTACAGAGTGGAGGTCGAGTGTATCGGGCAAGCATATGAGGACATACAGGCACAAAACCAACAATTGCTACAGCAGATTATTGAAAGAGATGATGATAATACCAAGATTTTTATGGAGGGTGTTAAAGCAAAACAGACACAAGATGCTTTGCATTTGGAAACATATTCTTTGCGCAGAAACTTGCAGCAGGAAAGCTCTTTGATGGATCTGTACAACCAGAAAATTGTTTCCTTAGAAGATCAGCTTAAAATGTGGTCTGATCGGGTTGGGAAACTTCAAGAGGATGGATGGCAACAATCTGTTTCATTGAGTAATTACCAAAGAAAGCTGGTTGATGTGCACAGAGATGCTCAAAAGCTTATGCAATCATTGGATGGAATACAAGCTAATGTTGGAAGCAGTCGTTTGGAAGTCGCTGATCTGCTTATAGAACTTGAGAAAGAGAGGTTTAGTAAGAAGAGAATAGAGGATGATTTGGAGGTTATGTCAAGGAAAGCTAGCTCTCTTAGAGCCAAGGCACGTGAATCAGCAGTCCTGGAAAAGCTTCGTCATGAGGTCAAGGAGTATAGGGGGATATTGAAGTGTGGTATCTGCCATGATAGGCAGAAGGAGGTTGTGATTACCAAGTGCTACCATCTCTTCTGCAATCAGTGCATACAGAAGTCCCTTGGGAACCGACAGAGGAGATGTCCTTCATGTAGCTTGAGTTTTGGGGCTAATGACGTGAAACCTATCTACATATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSTGEPDRKRRLSSSVAPGGGAPVSPAKRLAVAPTSEDKKLDFTVLKYKNQKLSEQLEAHKFEYRALENKFAGLKEKQRTHNETLSLVNSSWEQLVADLKSRSFCKSGSPNSSPGSGHNNVQKDGTCAPIERDTLRSLVESGATESSGCLPGCHLGSDAPPLHLSTANALGDIFFPSSDLLQANEECALAALTKLPENDRSKQLQSTSSNLLSSLNNVVQALSNLQLKHKQLAEDYQNQRDSSARKRAEHRRLKEELASAASELEETNYKLAALKAQRDNTQGARIPYPTLGNKSMPEDKVRDKQREMQDLEATHKELSELISKRLVEIKRLHEERIEILNKIATFQNILMDFKSIRSSKAFQLVNDRLQKSQAELDHYQTLLEKLQVDKDKFVWQERQFNLKVDLAEIPERVSTYCESSIADLKKDIQKLRDEKNMLILKLEEASREPGRNQVITKFKALVSSIPREMGAMQSEMTKHKEASLELNSLRAEVHSLSRILSRKERDNEEASCRSARAGSDITQLQSVISDLKQTNKELKLFADMYKRESTDSREIMESRDREFLEWAHVHALKSSLDESKLEQRVKAANEAEAITQQRLATAEAEIAESGQKLGTSRKDLVSLSHMLKSKQEECEAYRVEVECIGQAYEDIQAQNQQLLQQIIERDDDNTKIFMEGVKAKQTQDALHLETYSLRRNLQQESSLMDLYNQKIVSLEDQLKMWSDRVGKLQEDGWQQSVSLSNYQRKLVDVHRDAQKLMQSLDGIQANVGSSRLEVADLLIELEKERFSKKRIEDDLEVMSRKASSLRAKARESAVLEKLRHEVKEYRGILKCGICHDRQKEVVITKCYHLFCNQCIQKSLGNRQRRCPSCSLSFGANDVKPIYI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..123#1725..1886#1967..2054#2600..2824#3061..3228#3576..3769#4000..4083#4222..4341#4445..4631#4720..4880#4972..5043#5161..5237#5498..5692#5810..5882#5980..6066#6882..7019#7099..7301#7381..7546#7682..7813#ATGGGGAGCACGGGGGAGCCCGACCGGAAGCGGCGGCTCAGTAGCTCCGTCGCGCCCGGCGGCGGGGCCCCTGTTTCTCCTGCCAAGCGGCTGGCGGTTGCACCCACCTCCGAAGATAAGAAGGTATTTGCGCATCTCGAGCCAGCTCTGTATCGTTTTGAGTTAATGTTTATGGTGGTACCGTGTTAGTACTGTTTGTTTGAGTTCATGTTTATGGTGGTAGTACTGTTTGATATGTTGTTGTATGATAGCTAGATGGTGGCATGGTGACTGATTTTTAGCTGTTTTGTTATGTCATGGAATCCATACATCCGCTAAAAGATCTATTGTGGACTGTTTGAGTATAGATCGATGAGTTTATTCTTGACAAGTGTTTGATGCTTTTGTACTTATGCTGAGCTCTATGCAATTGCAAGTCTTGCTGTGTTGTGGTCGTTAGTGGAAGAAGCCCTATGTATATTGCCTCCTGTCAGAGTGAAAACAAAAATACTAGTAGGAATGAGCTATGCATTATCCGTTTCGGATTCTGCAACTATTGCACGATTGTTTATGGTTCTTTAGAGCAATTGATGTATTCTATAATTATTACTCGGTGATAGATGGGAGGCTGACTTGTGAAATTGTTACTTGACTTACATTGCATTCTTGTTTTCCCGTGTTCATGATAGCAGAAAGTGGCAATTCCTTGGTAAACCTTCGTATTTTGAGTTTTTTAAATGATCTTAGTTTTTTGTGGCTACATTTATGGATATTGAAATGGTTAACTTTGGACTAGTAGCGGATCTAGAAGTTCTCTTGAGCTTGGGCAAACCTAAACGAATGGGCTAGATTATAGGATTAATAAGTATTATTTTTTTGTTAAAAGTAGATAATGGCTGTTGGAGAACTGTGTAGCTTTGGCCTTAGGCTGATGGCAGCAAACATTGGTGTGAGGCTGTGTCTTGACTCCTTTGTTGCTTGCATAGCTGATTTAGCCTCTATTAAAAGAAGCAGATTAAGCAGGGGCATTAAGTGGTAATCCACTGGCTAATACGGTGGAGCCCGGGCACCTGCCCGTGGTGGCCGGGCCCGAGCTCCACTGCTGCTTTGGACAAATTTAATTTTCTTGCTGGCAATGATACCATAATGTGCCAATGCTTATTTACAATCATAGCGCCTTTTATTTTTCCATAGCATATGCTATTGTTTTTTGATATAGATAAAGGTCTAAATTGGGTCGTTAAATTAATATTAATGAAATTTGTCACCAAGTTACTACTGGTGACAACTGACAATTAATCGCTGTTACTACCGGTGACAACTGGCAATTATTCGCCTACTTTGTTATTTAATTTTACAAGAGGGAAATATGGGAAAAGATTGGTTAAATTTTGGGAGGGATAGGTCAAGGGTATAATGGCATGTTGGATGATACCTTTTATGCGTTTACTCATGTGTTACCGTATTTGGTCCAATATGGAATATCCATGCACAAAACCTTTTTTTCTTTTGTCCTGTAGCATGAAATGAACCTATTTATCATGTTGGTGATATCATCAGTACGACTCCTTTTGTGTTTATGTTCTGTTTTGGCTCTGCTCTTCTTCAAGTTGTAAATAAAAGATACTTGAATGTTGGTTCAGCTTTTCTTTTTATGCTTGAATTAGTGATTTCTCTTTGTTGCCAAACACATATCTTTAGTTTTGATTTCGCACACTGCCTACTTATATTGTCTTGTTTGGCAGCTCGATTTTACTGTACTCAAATACAAAAACCAAAAGCTCTCAGAGCAACTAGAAGCCCACAAGTTTGAGTATCGTGCTCTTGAAAATAAATTCGCTGGGCTAAAAGAGAAGCAGAGGACTCATAATGAGACACTTTCCTTGGTCAACAGTTCTTGGGAACAAGTAAGCTATTATTTTGTGCATGTTTTACCAAAAAAGACAGACTTTATAATGTTTCTTCCTGAATCCCTTTATTTGATCAGCTTGTGGCAGACCTGAAGTCAAGATCTTTTTGCAAAAGTGGATCTCCTAATTCCAGCCCTGGTTCAGGGCACAACAATGTACAAAAGGGTATGACTTCCTTTATTTTCTAAAAACATCCCAACTACATTTTCCTAGACAGGTTTTGAAATATGGGAGTGCCATCTACTCCCTCTGTCTCCTCATATAAGGGATTTTGACATTTTGCTTGCACTGTTTGACCATTCGTCTTATTCAAACATTTTTGGAATTAGTTTTTTTGTGACTTATTATCCAAAGTACTTTAAGCACAACTTTTCGTTTTTTATATTTGCACAAATTTTTGGAATAAGATGAGTGGTCAAACAGTGCAAGCAAAATGTCAAAATCCCTTATATGAGGAGACAGAGGGAGTATTTAAGTAGCAAATGATTATCACTATGGAAAAACCTTTTGATCTGGTCATCTTTGTGGTCCATTGCTCTTGTGGCAATGTTTAAGATAATGCTGCTTGGTTGCAAAAACTGCACTTTTCAGATTATGTAATAAGTTATAAGTTATTTATGTTAATGAGCTTGATATGCATTTTAACGATGGCCGCTCCTATTCTTTTCCATAGTTGCCTGTCAGGTTAACTATAAACCTTCTCTTTTCAGATGGTACTTGTGCACCCATAGAGAGGGACACTCTTAGAAGTCTTGTGGAATCTGGTGCAACTGAAAGTTCAGGTTGTTTGCCTGGTTGCCACTTGGGAAGTGATGCCCCTCCATTACATCTATCCACAGCTAATGCACTTGGGGATATCTTTTTTCCATCAAGTGATCTTTTGCAAGCAAATGAGGAGTGTGCTTTGGCTGCTCTCACTAAATTACCAGAAAATGGTTCGTCTTCTAGTTCATATATTCTGTTAACTAGTACTCCCTTCGACCCATAAAAAACCAACCTAGTTTTGGATGTGACATATCCTAGTACAACGAATTTGGACATATCTCTGTCTAGATTTGTTGTACTAGAATGTGTCACATCCAGTCTAGATTCGTTTTTTGTTGGACGGAGAGAGTATAGCTTTCAGTTGTACTAATACAAAAGAAGTACTAATTTCATTCATGTTCTGTAGACCGCAGTAAGCAACTACAGAGTACTAGTAGCAACCTGTTGTCCAGCCTCAATAATGTTGTACAAGCATTAAGTAATCTTCAGTTGAAGCACAAGCAGTTAGCAGAGGATTATCAAAATCAAAGAGATTCCAGTGCCCGAAAAAGAGCTGAACATAGACGTCTAAAAGGTATCTTGTTTAGAGATTGTGCTGATGTTTCTTTACAGTTGTTTTAACTTTCAAATAAGCATCCATGCCATTTAAAGGAACATGTTTCGCAACATTTGAGACCTGCTATACATCTTGAATTATCAAACATGTTGCCATCAACTCCTATCTATCCTCCCTACGCATTAACCAGCAATCTTCTGGAGAGCATTCTTGCGATAATAGGCTGTACTGTTGCAGTACTCTTATATTTACTGCGCCAGCGCTTCAGACTTGTACCATATTTTCCCTATACATTTTTTTACCTAGATACGTTGTCCTAATACATTGGGTAAAACTAACCAGATGTTTTGGTTTACTTTGTCAAGAGGAGTTGGCCAGTGCTGCTTCTGAGTTGGAAGAAACTAACTACAAACTGGCAGCACTTAAAGCTCAAAGAGATAATACACAAGGAGCTCGAATCCCATATCCTACATTAGGAAACAAAAGTATGCCTGAAGATAAGGTCAGAGATAAACAAAGAGAGATGCAGGATCTTGAAGCTACTCACAAGGAATTATCGGTAACTGCCATCGTTCATTTTTAAAGTTCCAAATTACTACTTCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTCCCACATTCATATTGATGTTAATCGAATCTAGATAGATATATATGTCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACCGGAGGGAGTACCTGTGATATGTATGATCTGACCCAATTATCAACCAGGAATTGATTTCAAAGCGGTTGGTGGAAATTAAGAGATTACATGAAGAGAGAATTGAAATTTTGAACAAAATAGCAACTTTTCAGGTTTGTTGATTGGTCAAGCACAGAATGCATCCTTGCTTAGCCTTGAAGGCCCATGCTTGATATTTATTTCATGGGAGAATTTTTTAGTATCAGAACCTGTATGACTAACTTTGTGTGTGTGTTTTTAATCTCCTCCAGAATATCTTGATGGATTTCAAGAGCATTCGTTCTTCAAAAGCTTTTCAGCTTGTTAATGATCGACTTCAGAAGTCACAAGCAGAATTGGATCACTACCAGACATTATTAGAGAAATTACAGGTGGTTACTGGTCAGTGGATTTGTTGGATTCCAGAGTTGTATAGCAAAAATGTCTCGCTAGAGCATTTGATCTTTTGTTGAATTCCTATTTGATATGTTTCAGGTTGATAAGGATAAGTTCGTGTGGCAAGAAAGGCAATTTAATTTGAAAGTTGATCTGGCTGAGATTCCTGAGAGGGTTTCTACATATTGTGAGTCTAGCATTGCTGATCTCAAGAAGGATATTCAGAAACTACGTGATGAAAAAAACATGCTTATTCTCAAACTTGAAGAGGCTTCAAGAGAACCTGGTGCAGTAGTTACTATTCACTTTACCAAGAGTAACTTTCAAACTTGTCTTGCTAAAGCAGGTAATAAGGAATTGTTTGCACTTGTCAGGTCGGAATCAAGTTATTACAAAATTTAAAGCTTTAGTGTCATCGATACCAAGGGAAATGGGC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