BGIOSGA015066
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015066 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015066, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_15968 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015066-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015066-PA |
| Length |
14214 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:19558435..19572648 |
| Sequence Coding Region |
19572260..19572648,19572061..19572158,19570812..19570901,19570241..19570293,19569852..19569905 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:19558435..19572648 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:19558435..19572648 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGTCGTCGTCGAGGCCGGGGCGGGCCAGCATCTCCCCGTTCCGATCCCGCCGCACGTCGGCGGCGGGGGGCGGGGCGGGGGTGGCGGCGGCGGCGCATCCTCCTCCGGCGAGGACGTCGTCGGGGGGGCGACCCTCGACGCCTTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGGCGGTGGCCGGCCCACCACCCCGTCGTCGTCGTCCGCCGGTGGCCGGCCCACCACCCCCTCCGCGGCGTTCGCGCGGTCCACCACCCCGTCCTCCGGGAGGCCGACGACGCCCTCGTCGGCCTCCTCGAGGGCGGCCGGGAGGGCGCCGCCCGTCGCGGCGGTGGACGCGGCCAATGCCAAGGAGAACATCATGGTCACCGTCCGCTTCCGGCCCCTCAGTCCTAGAGAGATCAACAAGGGGGACGAGGTGGCGTGGTACGCCGACGGCGACAACATGGTGCGCAACGAGTACAATCCGAGTATCGCCTATGCTTTTGATAAAGTTTTTGGCCCTGCTACTACTACTCGTCATGTATATGATATTGCTGCTCAGCATGTTGTAAGTGGTGCTATGGAAGGAATCAATGGCACTGTTTTTGCGTATGGTGTAACTAGTAGCGGTAAAACTCACACCATGCATACACCTGGACGAGAATTTCTTCTACGAGTTTCATATCTTGAAATATACAATGAGGTTATCAACGATTTACTTGATCCAATTGGACAAAATCTCAGAATTCGAGAAGATGCACAGGGAACTTATGTGGAAGGGATAAAAGAAGAGGTTGTTTTATCACCTGCACATGCACTCTCTCTAATAGCATCTGGCGAAGAGCATAGACATGTTGGCTCAAACAACTTCAATCTTGTCAGCAGTCGGAGCCATACTATCTTCACATTGACTATTGAGAGTAGCCCCTCTGGTGAGAATGATGAAGGAGAAGTCAAATTGTCTCAGTTGAATTTGATTGATCTTGCTGGGTCTGAGAGTTCCAAGACTGAAACAACTGGATTACGACGCAAAGAAGGTTCATACATAAACAAAAGTCTGCTCACCCTTGGAACTGTAATTGCTAAACTTACAGATGGTAAGGCTACCCATATTCCTTATAGAGACTCAAAGCTCACACGCTTACTTCAGTCCTCTCTTAGTGGGCATGGGCGCATTTCTCTTATTTGCACAGTTACCCCTGCTTCCAGCAACAGTGAAGAGACACATAATACATTAAAATTTGCCCACAGGAGCAAGCATATAGAAATAAAGGCTTCTCAAAATAAGATAATTGATGAGAAGTCTTTGATAAAGAAGTATCAAAAAGAGATAACCTGCTTGAAAGAAGAGCTGCAGCAACTAAGACGTGGTATGATGGGTAATGGGTACATTCCTCCAACAGATCAAGAGGATCTTGTTAGCTTAAAACTGCAGCTTGAAGCTGGTCAAGTGAAACTCCAGTCAAGGCTAGAAGAGGAGGAAGAAGCAAAAGCTGCATTGATGGGTAGAATTCAGAGGTTAACAAAATTGATATTGGTATCAACGAAAAGTTCCATATCCTCAAATGTTTCAGGAAAGGCTAGCCTCCGTCGACGGCATTCATTTGGGGAAGATGAGCTTGCTTATTTGCCTGATCGGAAGCGGGAGTACTCCATGGAGGATGATGATGTTAGTCTCGATTCAGAGTTTTCTGTTGAAGGAAAACTTGATTCTAACAATCCTGATGAGTCACTGAGGTTTGATAGAAGGAATCGCAGACGGGGAATGCTTGGTTGGTTCAAACTAAAGAAGTCAGATCAACTGTCAGGACTGTCGACTAGTGTAGACAGTGAAAGCACAGCCAGCGGCTCACCTTCCTTTTCTAGATCATCGCAACAAAAACACCCGCTTCTTGACCTGAAGGATGGTCGAAGAAAATCTATGACTAGGAAAGGAGATGACCCAGCACTTACTGATTCTTTTCCAGGGAGGACTCAAGCAGGTGATTTATTTAGTGCTGCATCTAGAGCACGGCACCATCTTCCGAGTGGAACAACTATCGTGGATCAAATTGATCTTCTTCAAGAGCAGGTTAAAATGCTGGCTGGGGAAGTTGCACTTTGTACAAGCTCACTCAAAAGGTTGTCAGAGCAAGCTGCAAACAATCCTGATGATTCACAAATTCAGGAACAAATTGAAAAATTGAAAAATGAAATTGACGAAAAGAAATCGCATATACGTGTGCTGGAGCAGCGTATGGCGCAATCATTGGAAACTACCGAAGACCCAGCTATTAGGACTGAAATGTCCCAGACCTTTTCAAAGTTAAGCACACAATTGAGCGAGAAGACATTTGAGTTGGAGATCATGTCTGCAGATAATAGAATTCTTCAGGACCAGCTACAAGCAAAGGTATCAGAAAATGCAGAACTCGTAGAAACAGTTGCTCAACTGAGGCAAGAAATTGATAATCTGTTGAAGACTGCCAAAAACGAGGATAATGTGGCTAGTATGCAGTCAAGTGAGCCATCAAGTACAAGCAGCAATCCTAGGGATCTGGCAAATGAAGTTGCAAGTCATTCAAAAATGCCCTCTAGAACAACTGAAGATCATACGGAGTCACCACTGAAATCTCAAGTGCTCTTGCAGGCTGCAGAAATCGAGAATTTGAAGCTAGACAAGCTGAGGTTGGCAGAAGAGAAAGATGGGCTGGAAATTCACAGTCAAAAGCTGGCTGAAGAATCATCCTATGCTAAAGAATTGGCAGCTGCCGCTGCAGTTGAACTAAAGAACTTGGCAGAAGAAGTTACGAGGCTTTCTTATGAAAATGCAAAGCTGAATGCAGATTTAGCTGCAGCAAAAGATCAAACAAGGAGCAGTATCCAGAGTGACACAAAACGCCGTGATCAGGAGAATGGAATCTTTGTAGAGGAGCTGCAGAAAGAGTTGGTTGCTAGCTGTCAGAGGGAGGCTGTGTTAGAGGACACATTGTCCCAAAGGGCCCGAAGAGAGAGTGAACTTCTAAAGGTTATTGAAGATGCAAAATGCCGTGAGCATGATTTGGAAAATGAACTGGCAAACATGTGGATGCTTGTTGCAGAGTTAAAGAAAGAAAATTCTCAGGAGGACTTGTTCCAATTCAAGGCAACACAAAATGGCTATCATTCATCGAAGAGTGATACTGGCAGGATGATGAGTGGAATGGAAGCTTCAGATAATAGGAACTGGGATGGTGTCAGTGTCAGCACTTATGAAGAAGCAAAAGCGGCATACAATGTTCAAAGAAGGCGCTGCAAAGAGTTGGAAGGCATTGTTTCCAGATTGAAGGGCGAGGATCTAAGAGGCTTAGATGTCAAAGTCCTGGAAGAGTTACAAAATTTTCATGTAGAAGCGTTGTCAAAGATTTGCCAAGAAAAGATTTGGGCTGGTCGCAGCCGCAACAAGCACTACCGATCAGATCCAAAGATAAAGCTAAAAGCACGAGAAACAAGAAAACTATTAGCGTATGATTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSSSRPGRASISPFRSRRTSAAGGGAGVAAAAHPPPARTSSGGRPSTPSSSSSAAGGGRPTTPSSSSAGGRPTTPSAAFARSTTPSSGRPTTPSSASSRAAGRAPPVAAVDAANAKENIMVTVRFRPLSPREINKGDEVAWYADGDNMVRNEYNPSIAYAFDKVFGPATTTRHVYDIAAQHVVSGAMEGINGTVFAYGVTSSGKTHTMHTPGREFLLRVSYLEIYNEVINDLLDPIGQNLRIREDAQGTYVEGIKEEVVLSPAHALSLIASGEEHRHVGSNNFNLVSSRSHTIFTLTIESSPSGENDEGEVKLSQLNLIDLAGSESSKTETTGLRRKEGSYINKSLLTLGTVIAKLTDGKATHIPYRDSKLTRLLQSSLSGHGRISLICTVTPASSNSEETHNTLKFAHRSKHIEIKASQNKIIDEKSLIKKYQKEITCLKEELQQLRRGMMGNGYIPPTDQEDLVSLKLQLEAGQVKLQSRLEEEEEAKAALMGRIQRLTKLILVSTKSSISSNVSGKASLRRRHSFGEDELAYLPDRKREYSMEDDDVSLDSEFSVEGKLDSNNPDESLRFDRRNRRRGMLGWFKLKKSDQLSGLSTSVDSESTASGSPSFSRSSQQKHPLLDLKDGRRKSMTRKGDDPALTDSFPGRTQAGDLFSAASRARHHLPSGTTIVDQIDLLQEQVKMLAGEVALCTSSLKRLSEQAANNPDDSQIQEQIEKLKNEIDEKKSHIRVLEQRMAQSLETTEDPAIRTEMSQTFSKLSTQLSEKTFELEIMSADNRILQDQLQAKVSENAELVETVAQLRQEIDNLLKTAKNEDNVASMQSSEPSSTSSNPRDLANEVASHSKMPSRTTEDHTESPLKSQVLLQAAEIENLKLDKLRLAEEKDGLEIHSQKLAEESSYAKELAAAAAVELKNLAEEVTRLSYENAKLNADLAAAKDQTRSSIQSDTKRRDQENGIFVEELQKELVASCQREAVLEDTLSQRARRESELLKVIEDAKCREHDLENELANMWMLVAELKKENSQEDLFQFKATQNGYHSSKSDTGRMMSGMEASDNRNWDGVSVSTYEEAKAAYNVQRRRCKELEGIVSRLKGEDLRGLDVKVLEELQNFHVEALSKICQEKIWAGRSRNKHYRSDPKIKLKARETRKLLAYD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..389#491..588#1748..1837#2356..2408#2744..2797#2975..3034#3288..3366#3663..3730#3855..3914#4023..4127#4527..4631#4763..4870#4938..5084#5299..5481#6253..6423#7833..8069#8537..8677#8807..8932#9189..9239#9338..9385#9462..9698#9802..10479#10669..10758#14119..14214#ATGTCGTCGTCGTCGAGGCCGGGGCGGGCCAGCATCTCCCCGTTCCGATCCCGCCGCACGTCGGCGGCGGGGGGCGGGGCGGGGGTGGCGGCGGCGGCGCATCCTCCTCCGGCGAGGACGTCGTCGGGGGGGCGACCCTCGACGCCTTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGGCGGTGGCCGGCCCACCACCCCGTCGTCGTCGTCCGCCGGTGGCCGGCCCACCACCCCCTCCGCGGCGTTCGCGCGGTCCACCACCCCGTCCTCCGGGAGGCCGACGACGCCCTCGTCGGCCTCCTCGAGGGCGGCCGGGAGGGCGCCGCCCGTCGCGGCGGTGGACGCGGCCAATGCCAAGGAGAACATCATGGTCACCGTCCGCTTCCGGCCCCTCAGGTGCGCTGCTGCTGCTGGTTCGATCGCTCTGTGGGTATGGGAGTCCCCTGGGCTTTGTTGGGTTTTTGGTCGTCACGGTGTCTCCGTGTTTCGTGGTGTAGTCCTAGAGAGATCAACAAGGGGGACGAGGTGGCGTGGTACGCCGACGGCGACAACATGGTGCGCAACGAGTACAATCCGAGTATCGCCTATGCTTTTGGTTAGTGATCTTCAACTCATCCTATATAAAACATTCGAAATGATGATAAGCAGTTGTACTCCATAAAAGGAGGGAAGGAAGCAATCTAATATGGGATTTCCTTTTGGAAATGAGGATGACATTACTTGGCAATTAAAAGCTGGCTCTAGTGGAATCGAGGCATACCGTAAATGAGTATTATCAGTTTCAGCGGTAGATTGTTACAGCAATATATTCTGGTAGTACAACATAGAAAAACTACTTAGGCTGCACATGGGAAGAATGACATGGCGGCATTGTAGCTGTATAATATGTCTTACTTTGGTTGGTCAAGGTTGCTATATAGAATGCAAGATTAAGAGCACCAGATCATGATGAAACTTGCATGATCGTTATGTTATTGTTTTGAATCTGAGTGTTATGATACTGAGGGTCTGTTTGGGAATATGTGCAGTCCTTTTCATGGTCTGCATGATTGCCCACACCAAAGTGATCCCTTGGGTCGCAATATTCCATCCACGCGTCCCCCAAGCCCTAATCTACCTGACACATCGGACAATAGAATTCTCATGTAGGAGTACCTATCAGCTCCTTTCTCACCTTTCACTTTTCTTTTGCAGGAAGAAGATCATATCAGCTTATCAGGTCATGGTCAGGGCTCACATGTATCTATTATCTATTTATCTATCTATTATATACTAAAAATCCATTAAACTTCCTACAAACACTACTAAGTTGCCACGTGTACCCTACAAACGCTCTCAAGCTGCCACTTGGCGCTATGATAAATTATAAAACTTCTTAAATTTCTAAGAAAAAAAGCAAAACATTCAACCATTGATTTTCATTTAATCCGGTGGACCCAGTATTTTTAACCATTACATCAATCTATAAAAAAACAATCCTCCAATCCCTACCAAGACTGTACGTGGAGTCGTAGTGCGTACTTACTTGGACAGCCCGTATGCCTAATCTCTTCCTCCTCTGTTTCCTCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCCCCAAACAGGCCAGACTCTGTTCCCAACAAAAGGATGAGAGCCCTAGAATTTACAAGTTACAACTGGTGACATGTGATATCTCTGCAGTTTATTAAAACCATTTTTGTTGTATGTGTTCACCTTTTCAGATAAAGTTTTTGGCCCTGCTACTACTACTCGTCATGTATATGATATTGCTGCTCAGCATGTTGTAAGTGGTGCTATGGAAGGAATCAATGGTACTTTCAAGTCTCCTTTTGGTTCTTAAAACATAGTACTAAATACTTTCAAACCGTAAGTGCAAAGTTACTGAACTAGGAACTGTCCATTGTTACATAGCTATGAACATTTCCAAGTCGTAAATATCAGGATTCCGATGCCACCTTTACCCCCTCCTCTTTGAAAGAAATCATCTCCCAAGGCTGCTGAGATGAGGGCCCTAGGTAGGATTATTTTTGTGTTGGTAGGATCAGATTATAGTTACAATGGCAGGAATGCAAGATAATTTGATAACGTCGTTATATGAAGATTGTAACACATAGGAACATCATTATACCATTCTGTGCCTAAGTATCATCAGAACCAGAATTCACTGATAATATTTTAGGATATTATGAGACAGATCATAATCCTGACAAACTTGGCCTCTACTTTTTGCTAGGACTTAAAGCATTGGTAGTTGATGATGTTTATTTTTGTCTCTTACTCTAGTATATGTAGTTTATTCAGTTCAGTAATATTGTTCTGTTCCTTGTAGGCACTGTTTTTGCGTATGGTGTAACTAGTAGCGGTAAAACTCACACCATGCATGTAAGTATCAGTACCGTTGTTATGCTTATGCATCTGTTCTCTTTCATGCATCTAATACATGCCAATGTGTTCTTATTCATTAAACGCGAGACATCTCTATTTCATATAGCTAGTATCCTGTGTATATTTTTTTAATGACTATCGCTTCAATTTAATTACCAATTATTTTTTTTACGACACACTCGAATTACAGGGGGAACAAAAATCACCTGGAATTATCCCATTGGCAGTGAAGGATGTTTTCAGCATTATTCAAGATGTAATCTGTTCATTTCTCTGTGAACAATTAAAATGGTTGGGATCGTATGACAATATTATTTTTTTGTTCACCTCAGACACCTGGACGAGAATTTCTTCTACGAGTTTCATATCTTGAAATATACAATGAGGTACTTCTATTGCCAAGCCCTGTCTTTGTTTCACACTAATGTGCAAAGATGTGTTACCTATTTAGTACTTACTTACCCTGTAGAAGCCAATATGTTTCCAATCCGTATTCGTATAAGTTTGAAGTCATGTGATCCATAACTTGCGCTCACTCTTTTTGTTGCCTTGATCACTTCTAGGTTATCAACGATTTACTTGATCCAATTGGACAAAATCTCAGAATTCGAGAAGATGCACAGGTACCTAACGTTTGATGCAATATATTTTATGATCACACAATCATGTCCATTAATGTTACACAGAAAAACAAGTCAAACTATATGATTTTTTATTTTACGTTCTTAACACTGATTGTTGCATATTTCACTTAAAAGTTCTTGGTTTACTACGCCTATTGATTGATTTGTTTCTTTTTTTTAACTCATTTCTGATTCCTCTCTAAAAAGAGTGTTGTAACCAATACACTGTACCCTCATTCTTTTATTCACTCAGGGAACTTATGTGGAAGGGATAAAAGAAGAGGTTGTTTTATCACCTGCACATGCACTCTCTCTAATAGCATCTGGCGAAGGTACTTATTTCTTTCTACTGTACATCCTTTTTTCGTTCCCTCAAATATCATTAGTTGCACCCCAATGATTTATTCAGTTACATGGAGATAACTTTTTGCTATTTTTTATCTTGCATAAATTTCAAACCCACAGTATAAGGTGCTCTCCAAGAATGCATTTATATATTTTTTTTCTCCATGTGTGCGTGCCATGTTATTTTTTTTGGACTCCTGGCATTTCCTTGAATGTTATATCTTCATATACGTTGAAATTGTTAAACTTGAACTTAGTTACAGATGCCATTGCTTTCTGGCAGAGCATAGACATGTTGGCTCAAACAACTTCAATCTTGTCAGCAGTCGGAGCCATACTATCTTCACATTGGTACCCTCCCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGGTGGTGGTGTTAGGTTGCTCCATTCATACATAAAATTTTTGCTGAGGTAGAATTGCTTAACTTTAGACTCTAACACTACGCAGACTATTGAGAGTAGCCCCTCTGGTGAGAATGATGAAGGAGAAGTCAAATTGTCTCAGTTGGTAATGCCTCTTTCCAGTTTACTTATAGTTTCATTCAATCGTCTTAAGCATTGTCTATAGGTATATGATACTTAGGTTGAAACCTCTGTATCTTCATGCTTTCATCAGAATTTGATTGATCTTGCTGGGTCTGAGAGTTCCAAGACTGAAACAACTGGATTACGACGCAAAGAAGGTTCATACATAAACAAAAGTCTGCTCACCCTTGGAACTGTAAGTATTTCATGCTGTTATGGAGTTCCTTTTTGAACGATTTTATGAACTTTATGACCTATTTCATTGAGCTTTACCAAGTCTCCCTGGATTAACTTGCAGGAAATGGCCCGTTTCACAAATATTGCTACCATTTTTCCATGCATTTTTTACCTGATTGCTAGCTATATATATTTTTACTAGTTCCAGTAGGAATGATGCCATGCCTTAAAAATGATACTTTCAACTAATTCCAACATCCAGAAGGTGGCAAAATGTGCATTTGAAAAACACTGCCATGTGAAACAGCACTTTAGTTGTCAAATATGATTAGCTTCCAGGAATTGATAAGAAATGTTCACATTTTTGTTCACTTAGTTTTTGTTCTTGTCCTAAATTAACAATGGAATTTTCCTGCAGGTAATTGCTAAACTTACAGATGGTAAGGCTACCCATATTCCTTATAGAGACTCAAAGCTCACACGCTTACTTCAGTCCTCTCTTAGTGGGCATGGGCGCATTTCTGTGAGTGATTCTTTAATTCTTTGTGAAGTTTCCACATATATCCTGCCATAAAGAGTTCCCACATATTTGTGTGGGGCCACAAACCTACAGAA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