BGIOSGA015214
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015214 |
|---|---|
| Description |
cDNA, clone: J075004H10, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015214, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015214-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015214-PA |
| Length |
5626 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:16211911..16217536 |
| Sequence Coding Region |
16217237..16217536,16212502..16212621,16212231..16212261,16211911..16212029 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:16211911..16217536 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:16211911..16217536 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGTGATTCTGAATATGACTCTGATGCGACTCTGACAGACAATCCTTTCGTAGGGATTGATGCAGATTCAGAGGATGAAGAAAATACATCTGCTATGACCCTTCCGCTTGGCAATCAACCACTAGATGTTGTGCCTTTGAATGCCATTCCATTCAGTCAAGTGCAGGCTTTAAATCGGAAAGTGGTTTCGGGTAAAGAAGAGGTTTCTGTTCCTCATTGGTTGAAGGTACACAAGCTCTACAAAGATGGAGACTGGAAGGTTTCGATTTCTATTAGGGCTAATGGACACAAAGATTGGTTCTACAATCATCGGGAATACAAAAAAACATTCCGCTCCAAGCCTGAAGTTGAACTATTTATGGAAAGAACCCTGCTGCACGGGACAGATATATTCAACGGACGTAAACTACATAAGAAGAAGGCAATGGGTTCCTATGGTGAAGGCAGTGGTGGAAGTACATCTTCCATGGGAGAGAAAAAGAATACCAATACTAAAAGACAGAAGCCCTCGAGTATTGGAGATGACCCTATGATGCTGAAGCCAACTCTGCCTCACGGTTTTGTTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSDSEYDSDATLTDNPFVGIDADSEDEENTSAMTLPLGNQPLDVVPLNAIPFSQVQALNRKVVSGKEEVSVPHWLKVHKLYKDGDWKVSISIRANGHKDWFYNHREYKKTFRSKPEVELFMERTLLHGTDIFNGRKLHKKKAMGSYGEGSGGSTSSMGEKKNTNTKRQKPSSIGDDPMMLKPTLPHGFV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..300#4916..5035#5276..5306#5508..5626#ATGAGTGATTCTGAATATGACTCTGATGCGACTCTGACAGACAATCCTTTCGTAGGGATTGATGCAGATTCAGAGGATGAAGAAAATACATCTGCTATGACCCTTCCGCTTGGCAATCAACCACTAGATGTTGTGCCTTTGAATGCCATTCCATTCAGTCAAGTGCAGGCTTTAAATCGGAAAGTGGTTTCGGGTAAAGAAGAGGTTTCTGTTCCTCATTGGTTGAAGGTACACAAGCTCTACAAAGATGGAGACTGGAAGGTTTCGATTTCTATTAGGGCTAATGGACACAAAGATTGGGTAAGAGAGTCAATCTTACTTTACTTTATGATATTTGCTATGTATGGTTCACTTTCTTTCTGCTTTTGATATGTCTAGAGAGAATGTTTATATGCTCTTGAAAAATAACTGTTTGGATATCTCAAGATCTGCGGTAGATTTGGTTCAATCAATTGTGTTTGTGCTTCTTAATTTTCTTTCAAAATATATGGCATACTAACAATTAATAAATCTTATATTTTATTTTATATATTTTTTATATTGACTTGTACATAACTTCCTTTTCTCCTGAATCCATTGATGATTATGATGTATATTTGAGCTAACCTTGCCGAATCATCGCATTTGTAATATCTAACAAAGCAAGGTCGGAAGAAACTAAATCTATTCTTGTAGTACCATGTGAAAATTTTCCTGGAGAAATTTGCACCTCATTGCAGTGCAATCATTTCTACTATTAATAGATTTTTTGTCATCTATTTAGTAGTTGCACACTTGTAAGATGCTTGCATTTACTATAAAATTGAACAATACAATTGATACATGATTATTCAAAATTTGAAAGCTTTGTTGGTATTTGAATAAGTACAATGCAATTATAATACTTACATGACAAAGACAACCTTTTTAAATATATATGCATTTATTGTCATGTCAATCTAGGTTAATAGAAATACACCAAATGATATAGTGGAATGACTAATCCAGTCTAGGCTGAGAAGTAGGACCAACACTTTGGGTATAATATTATTGACAAACCATTAAAAGGTTCTTGATTTGTTTTGTATGAATCAAGTAGCATGTTAACTAGGTACATATAGCAATATATGTGGGAGAAGTCATCTGTTACTGATATCCATGTCTATGGGAAATATATATTAGGATGTTTTGATAATAACATCTGTGTGCTATGTTTGACTGTATCTAATATGGGCATCTATGTATAGAAACTACTAGCTGCGGATAGATAAGCATACGAGGGATGGAGGATTGGTCATTAACTAATACCTATTTATGCAGAAAAAGTCATTTTTTAATACAATTTCACTTTTTATTCCCATTGAAAAGTGGGCCAGTGTAAACTATACATCTCCATTTTTCAAATGGAAACTTCCCAATGTATTATATGCTTTAGTATCGACTAACTAGTTGTAAAATTAGATCAAAGAATTATATAAGGTCGTAGAAATTATTCATAGATATTTTCTTTATTTAGGCTGTGTTCTTTTGGAGGGGTTGGGAACCGCCCTCCGCACGCAAAACAGAGCGATGGATTAACACACGTCTAATTAAGTATTAGCTAAAAACACTCAAAAAATGAATTAATATGATTTTTAACAGCAACTTTTCTATAGAACCTGCACACATTCTCTTTCCCATTAACACCACATCAGAACCTCCCTATTTGTGATGTATGCAATCACTCTTTTCCTATTTATGGTAGAAAATCACAATGACCTCTAGCCTTCTCTACCATGGAGTGGTTTGTTGTTTGATATGCCATTTGACTGTTGATTGAAGACCCTCGACAATAACTCGGATAATGCTGACATTTCTGGGCTGAGCCAATGAACTATATTATTTCACCCTAAAGAATAGTCCCATGATAATACTGCCACTAGAATTCCATGTAACTGTTTGCTACAGTATGTATCAGGATAAGGAAAGATCGTTTGCAACAAAAATCACCAGAGAACTGACACGTTGCAGACTAGACAAGACAACTCAAAATCCTTACTGAACCCTAGATGATCCAACTAGTGGTGATATCTGGTTGAAAAACATACCTTTGGTCTACCATCAACCTAGATGCCAGAAGTAGTGTCACAAACTGGCTTGTGTGCTGATAGCCAAAACTACATGGCCTTGTGAGGCTCCATCGTCGTCATGGACTTGAAGTGCCTAGTGGATGGTAGCTAGTGGTGGCAATGATCTTTCCATAAAATGGATCTCTTCTTATACATCTAGAATGTGGGGATGTAAAAGCTGACATGATCAGCCTTGTTGAGGTTACACACTAACGCATGCTACTATAAGAGCATACACATTAGATGTTCTCCGATTTCTTACTAGTCTAGAAACTATTGATTTCTCATTGGCAAATGGGCTTGCCTGTAGGGCTATGGTATGCATGGCTACTGCTTTGCCATGCCTGCCACACCCAATTGTCATCCCTGCTAGTATTTGGCATTCAAATGTATAATCCGGCATAGACGCACAGTGATATAGGCACTTGGTGGCCCATCATGTGGTGTTGGTGGGATTATTCTCATATGAGAATTAGGTTAGGGCCGTCATGAAACCCACACGCTCCAACCATAATATCTCCCGGTTAATCCTTGTACATGAATCGAGGAAAAAAGTGTAAGCGGGGTGCTATGTGTATGTTGTATTGTTCCTCGGAAAAGTTGGGCTACGATTTTGAATCTGAGTGCTATCAGGTTTTAGGAGCTTTTTATAATTAAGCTAATAGCTATAAAGCTTGCTCTTTTGGTTAGTGCGTTTACTATTGGCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGCCCTAGATAGTTACTTATACTTCTCAAAGAGGTTCCTCCCTTTTGGTATTTTTTTACCATATATTTGACACCAAAGCTATTGTGGAACTACGAAGTTTCCACTAGCAAAGAAGGTTAGTTCCTCTTACTATCCTGAATTTACGAGTCTTGTCCTCTAACTCCCTCTTTAATTGCACTAGTATCAGTGTGAGGAACCCAAAGTTAAGTGCTTTAATTCCTAAGCTTCTCAATTTTTAAAGCTCCCAAGGAAGATCAAATGGCAAAGATTAACCCTATATACAACGTCCGAGAAAAGTCAACTAATACACACTTACTTCCTAGTGAAACAATATCTTGTGAAGCATTTCTTGCTCATGTTGTAAATCAAAGACGGTGATGTGATACATCAATTCATGCTGTTCTCCTATTAGTGTTTTTAAAAATCTTTGAATAATCTCTCAAGCTTTTTGGGTATTTTGTGTTGATATAATATGTGACAGTTGTTGCAACTTGGGTCCAAAATTTTTAAAAGGCATCTATGTTTGGAAACCACAACCAAAACTATATTTGGAGTGCTGGTAGTATTCATCCTGTTTTTTTTTTGTTGGTTAGAATTGCAAACTTCATTTTCCAGATGCAAGGTTTTATTTGTTGTTCCCGAATTCCAAAATTTTCTATGTTACTAAAATCATCACGCGCAACAAACATTTGACATCATTATGAATGTTCCAAAGAAAATGTTCTTGTTAACATTTGACATATACTTTATCAACTAAATCCATAGAGAAACCAGAACACATAGATGAAGGCTCCCCCCAAACTAAAGTGAGAAATAGCCCCTAATTCAAATTGGGGGCAATAAAGATGCATAAAACATAGCGTTCAAAAATCAGATAATTGATCCACCCAATGAACAAGTATGGTCAATGCTTGCAGTCTATACCACGGATCCAATTGCAAAGCTTAACTAGATTCTTTTGCAATTGATGGCATTGTCGACAGGAACACCCACTTACGCTGTCTAATGTATCAAGTTCAAAGCTTCAAATATAATACCCTCAAGTGCAATATTTTTTCATTCAAGTTCAACATGGTTTAGTTCGACCATATTTGTGTTGTCAACAATATACAAGCATAAGCATCCTCTATTATGAATGTAAACCATGCTTAACACTGGTTCTTTGTTTTTTTATGGTTAATCTGCTGATTGCTTAGCCTTTGATCAACTGTGTGTTAGGAAGGTTGCCTCTGGACTTGCAATATAAGGAACAAAACTAATGTATGGCCTTACAGTGGGTCTTGTGATTTCATTGCATTAGGTCAAGTGGCTGAGGAATTGACCTAGCTAGGCCCATGGAAAAGTGTGATGCTGCTACAGATAGAGTTGCAACATGCCATTTCATCCCGCATCACATATTTTAAAAAAAGTACTGTAGCATAATGGATACAATTTTAGATGACGATGAACATTACTGGGTTGAGTTGTCTACAAGTATATCATCTAAAATTGTATCCATTAAATTATTCGGATTGCTTAAAAATATCTCCTTGATAGCATGCATATTTTTCTCTACTAGTCCTGGTGCAGGTGCCAAGACTACCGAAATGACTACCCTATTGGAATAAACAAGTTTTGTGCTTCTCACATGAAAAATACATATTATAGAAAAATATGAAATTATATGCATCGGTCTGATTTAACCTAGTCATTGGAAAGTTAAGTATTAAAAAACCTAGATGGAGTATAAACTGTATAGCACATTGGCTTCTAATTTCGGATAGTTCATTCTTCGGACACCTGCATCATCCTAATGAAGTTCATATGGTATCCACATATTATGAGAAAAGTTTTGTTTTAAAGACAAGCTTGTTCTAAATTTTCTCTGAAGCCATGGTAAACAAGTAGAGTATGTTGCACATAATTTCATGATCGATGTGCTTTTGTTTGTTTGGTTTTGCCTTTTCCATTTATCCCCGCTTCTCTTCTCAGAGCTTTATAATGTTGAACACATACATGATTATCTCATGCATTATTTTTCTTTTTTACGCCAATTTATTGGTCCTTGAAGTCTCCCTTATAATACATGAATTGCGATTTCATAATACCTTTTATTGTAGTTCTACAATCATCGGGAATACAAAAAAACATTCCGCTCCAAGCCTGAAGTTGAACTATTTATGGAAAGAACCCTGCTGCACGGGACAGATATATTCAACGGACGTAAACTACATAAGAAGGTAGGCGAACACTTATTTTATGCTCATACTAATAATATATAAGACATGTTTTAGTACATTGTATGATTTACATGTTGCCAGATAAAAATATAAGTACTAAGTCCAAACATCCACCTATTATAGTATAATTAGGTATTTCCAAAAAAAAAAACTTGGCCACTTTACGTGCTTGTATACATATTGTACTAATTTTTTTTTGTAGAAACTCTAATGTTGATATATATTTATTTTTCTTTACAGAAGGCAATGGGTTCCTATGGTGAAGGCAGTGGTATGGATTTGAAATATACTATTTCAGAAGCTTACTTCATAAACTAATTAACATTATATACATGTTGTCATTTGGTTTTGTAACATGGTTTTGGAGAATTTACCTCACTCTGTATTACTTGTGTAATTGCATTTGAAATGTTCTATTTTCAACATAGCACTGAAGCTAGTGTTTTGTTTTTACCCAATATTTTGCAATCAGGTGGAAGTACATCTTCCATGGGAGAGAAAAAGAATACCAATACTAAAAGACAGAAGCCCTCGAGTATTGGAGATGACCCTATGATGCTGAAGCCAACTCTGCCTCACGGTTTTGTTTAG</dnaseqindica> 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