Os07g0575100
| Gene Name |
Os07g0575100 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001066612.2 GI:297607495 GeneID:4343696 |
| Length |
10908 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0575100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:23914545..23925452 |
| Sequence Coding Region |
23914545..23914646,23914902..23914951,23916089..23916120,23916672..23916703,23917017..23917067 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:23914545..23925452 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgtccggggatgaccaggcggccgccgcggcgctcctgggaggggacccggcggcgttcgacgcgctgctctcgacgctgatgtcctcgtcgaacgccgaccgcgccgccgccgaggcggcgttccaccgcctccgggggtcccacccggagccgctcgcgctccgcctcgcctcgtcgctgtcgtcgcccgccacgcccgccgacctccgcgccatggccgccgtcctcctccgcaagctcctctccccgacgccctcctccgacgcgtccagcgccgccgcggcgccggtgtggccccacctctcccccgcggggcaggccgcgctcaagcagcacctcctctcggcgctccagtccgacccgcccaagcccatcgcgaagaaggtatgcgacgccatatccgagctcgccgcgctcctcctgccggagaacgcgtgggccgagctgctccccttcctgttccgcgcggcgtcgggacccgaggctcccaatctgcaggagtccgcgcttctcatcttcgcgcgcctggcggattacatcgctgaatcgcttctagaccatctgatgacaatccacaacctgctcgcctccgccctggcgcacccgacatctcctgatgtgcgcatcgccgcgttgagcgctgcggttaacctcgtccagtgcttgcccaccaacgctgaccgggataagatgcaggatttgcttcctgcaatgatgagggcgctcacggattgcctaaactctggtcaggaggcctctgcacaggaggcgctggagctgcttgtggaactggctggtgcagagccaaggttcctgcggcggcagattgcagatgttgtaggtgcaatgctgcagatagctgaggctgcacagctggaggatgggactaggcacctcgctgtagagtttgtgattactctcgctgaggccagggagcgtgcaccaggaatgatgcgtcgcctcccgcagtttgttggcaggttatttgcagtgctcatgcagatgttgcttgatgtcgaggatgatcctgcttggcacactgcagagacagaggatgaagatgcgggtgaaggaaataactatggagtagcacaggagtgccttgaccgtctagccattgctattggtgggaatgcaattgtgccaattgcatctgagctgctcccgcagtacctttccgctcctgagtggcagaagcaccatgctgcactaatcacacttgcacagattgcagaaggatgtgcgaaggtgatgcttaaaaatctggagcaggttgtttcgatgattttgaatggatttcaacatcctcatgcacgtgtgcgttgggctgcaatcaatgcaattggtcagctatctactgatttgggtccagacttgcaagttaattatcaccagcaggtgctgcctgcattggcaaacgccatggatgattttcagaatccacgggtgcaagcacatgctgcatcagctatcttgaatttcagtgagaattgcacgcctgaaattctgacaccttacctggatggaattgttaccaaattacttgttcttcttcagaacggcaagcaaatggtgcaagagggagcattgacagctttagcatcagtagctgattcatcgcaggagcacttcaaaaaatactatgatgcagtgatgccatacctgaaagctattttaatgaatgcaactgataagtccaataggatgcttcgtgccaagtctatggagtgtataagtctggtcggaatggctgtaggcaaggataagttcagggatgacgcaaagcaggtcatggaagtacttatgagtttgcaaggaactacaatggaaaatgatgatccaataacaagctacatgcttcaggcttgggccaggttatgcaaatgtctcgggcaggattttcttccgtacatgaacgttgttatgccaccactgcttcagtctgctcaactgaagcctgatgtcacaattacttcagctgaatctgatgatgatatagaatcagatgatgatagcattgaaacaattacgcttggcgacaaaagaataggtatccgaactagtgtactagaagagaaagcaacagcttgcaacatgctatgctgttatgctgatgaactcaaggaggggttcttcccatggattgatcaggttgctcctacattggttccactccttaaattttactttcatgaggaagtgaggagagctgctgttgcagctatgcctgaactactacgttctgcaaaattggctgttgagaaggggctggctcaaggacgcgatgaatcttatgttaaacaattatctgactacataattccagctcttgttgaagcgctgcacaaggaaccagaaactgagatgtgttcatccatgcttgattcattaaatgagtgcatgcagctctctggtcgactccttgatgaaaaccaagtaagagctgtttcggatgagataaaaaatgttattatagccagcgctaccaggaaaagagaaaggtcagagagatcaaaggcagaagattttgatgctgatgaaggagaactactcaaagaagagaatgagcaggaggaggaagtgtttgatcaggttggagagtgccttggtactttaattaagaccttcaaagcttcttttctgccattctttgatgaactgtctgtatacatcacacctatgttgggaaaagataagactgctgaagagagaaggatagctatctgtatatttgatgatattgcagagcaatgtcgtgaatctgctctcaagtattatgatacatacctaccttttctgctggaggcatccaatgatgagaactcagatgttcggcaggctgctgtctatggtgtgggtgtatgtgctgaatttggcggtcatgttttccgcccacttgttggagaggcgctgtcaaagttgaacaatgttatcacacatcctgaagcaaagcatgcagacaatataatggcatatgacaatgctgtttcagcgcttggtaaaatatgccaattccatcgtgatggtatcgatgcagctcaggtcattcctgcctggcttggttgcttgcctataaaagatgacaagattgaagcaaaagttgtacacgatcagctctcctcaatggttgaaagatcggatgcagatattcttggtcctcatagccaatatcttccaaaaattgtttcaatttttgcggaggttttatgcaacggaacagagcttgctacagatgaaacaaccaagcggatgatatggttttgggatgtgctgcatcagaggttgttggaatcagccaaaacaaaatactcaaaagatactcaaaagttagctttcgaactagagaccttttacggtgtttgcgagaaagatcgcatctcctttcttctctcccttcgcttcgttcttgatttagggtttgaacggttccccagaaggagacagaggaaaaagcgtctgcatggttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASGDDQAAAAALLGGDPAAFDALLSTLMSSSNADRAAAEAAFH RLRGSHPEPLALRLASSLSSPATPADLRAMAAVLLRKLLSPTPSSDASSAAAAPVWPH LSPAGQAALKQHLLSALQSDPPKPIAKKVCDAISELAALLLPENAWAELLPFLFRAAS GPEAPNLQESALLIFARLADYIAESLLDHLMTIHNLLASALAHPTSPDVRIAALSAAV NLVQCLPTNADRDKMQDLLPAMMRALTDCLNSGQEASAQEALELLVELAGAEPRFLRR QIADVVGAMLQIAEAAQLEDGTRHLAVEFVITLAEARERAPGMMRRLPQFVGRLFAVL MQMLLDVEDDPAWHTAETEDEDAGEGNNYGVAQECLDRLAIAIGGNAIVPIASELLPQ YLSAPEWQKHHAALITLAQIAEGCAKVMLKNLEQVVSMILNGFQHPHARVRWAAINAI GQLSTDLGPDLQVNYHQQVLPALANAMDDFQNPRVQAHAASAILNFSENCTPEILTPY LDGIVTKLLVLLQNGKQMVQEGALTALASVADSSQEHFKKYYDAVMPYLKAILMNATD KSNRMLRAKSMECISLVGMAVGKDKFRDDAKQVMEVLMSLQGTTMENDDPITSYMLQA WARLCKCLGQDFLPYMNVVMPPLLQSAQLKPDVTITSAESDDDIESDDDSIETITLGD KRIGIRTSVLEEKATACNMLCCYADELKEGFFPWIDQVAPTLVPLLKFYFHEEVRRAA VAAMPELLRSAKLAVEKGLAQGRDESYVKQLSDYIIPALVEALHKEPETEMCSSMLDS LNECMQLSGRLLDENQVRAVSDEIKNVIIASATRKRERSERSKAEDFDADEGELLKEE NEQEEEVFDQVGECLGTLIKTFKASFLPFFDELSVYITPMLGKDKTAEERRIAICIFD DIAEQCRESALKYYDTYLPFLLEASNDENSDVRQAAVYGVGVCAEFGGHVFRPLVGEA LSKLNNVITHPEAKHADNIMAYDNAVSALGKICQFHRDGIDAAQVIPAWLGCLPIKDD KIEAKVVHDQLSSMVERSDADILGPHSQYLPKIVSIFAEVLCNGTELATDETTKRMIW FWDVLHQRLLESAKTKYSKDTQKLAFELETFYGVCEKDRISFLLSLRFVLDLGFERFP RRRQRKKRLHG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10807..10908#10502..10551#9333..9364#8750..8781#8386..8436#8023..8089#7854..7945#6760..6896#6600..6666#6438..6504#6275..6360#5563..5655#5194..5379#4344..4400#4134..4261#3985..4054#3766..3901#3187..3338#3036..3110#2787..2951#2588..2653#2383..2487#1584..1787#1..1254#atggcgtccggggatgaccaggcggccgccgcggcgctcctgggaggggacccggcggcgttcgacgcgctgctctcgacgctgatgtcctcgtcgaacgccgaccgcgccgccgccgaggcggcgttccaccgcctccgggggtcccacccggagccgctcgcgctccgcctcgcctcgtcgctgtcgtcgcccgccacgcccgccgacctccgcgccatggccgccgtcctcctccgcaagctcctctccccgacgccctcctccgacgcgtccagcgccgccgcggcgccggtgtggccccacctctcccccgcggggcaggccgcgctcaagcagcacctcctctcggcgctccagtccgacccgcccaagcccatcgcgaagaaggtatgcgacgccatatccgagctcgccgcgctcctcctgccggagaacgcgtgggccgagctgctccccttcctgttccgcgcggcgtcgggacccgaggctcccaatctgcaggagtccgcgcttctcatcttcgcgcgcctggcggattacatcgctgaatcgcttctagaccatctgatgacaatccacaacctgctcgcctccgccctggcgcacccgacatctcctgatgtgcgcatcgccgcgttgagcgctgcggttaacctcgtccagtgcttgcccaccaacgctgaccgggataagatgcaggatttgcttcctgcaatgatgagggcgctcacggattgcctaaactctggtcaggaggcctctgcacaggaggcgctggagctgcttgtggaactggctggtgcagagccaaggttcctgcggcggcagattgcagatgttgtaggtgcaatgctgcagatagctgaggctgcacagctggaggatgggactaggcacctcgctgtagagtttgtgattactctcgctgaggccagggagcgtgcaccaggaatgatgcgtcgcctcccgcagtttgttggcaggttatttgcagtgctcatgcagatgttgcttgatgtcgaggatgatcctgcttggcacactgcagagacagaggatgaagatgcgggtgaaggaaataactatggagtagcacaggagtgccttgaccgtctagccattgctattggtgggaatgcaattgtgccaattgcatctgagctgctcccgcagtacctttccgctcctgagtggcagaagcaccatgctgcactaatcacacttgcacagattgcagaaggatgtgcgaaggttagctaaataagttcatgcttattgtgactactatgcaatagaatcactacaaaaaccagttgaaaagctgaaggtattttattttgctgcactgggtaaaataaaatatacaatagctcgtttaattaggtaattcgaatcggtgtgatgtgataatgaatcaattgccttcattgatttctcatgttcaagtgattataaacactgaattttaggtgcacaagagcttttggcgagtattaagacacaaaaatgctacccattgtttcattcatttgcaagaagcagccaaaatagctatttactcaactgtttgttctttgcaggtgatgcttaaaaatctggagcaggttgtttcgatgattttgaatggatttcaacatcctcatgcacgtgtgcgttgggctgcaatcaatgcaattggtcagctatctactgatttgggtccagacttgcaagttaattatcaccagcaggtgctgcctgcattggcaaacgccatggatgattttcagaatccacgggtgcaagtgagtgttcaaatattagtgctagacttgatctagcacacccttttacacatgttctttgctttatttataacatcttttgtggcctacaatgttcataaggacaacgcttattgactcacttacctgttagactttatgaagaaaatgcttcaaagtagatagtgggctttacataaaagataatgctccattgatctacttagacatctaggagtgttcttcaattagttaaattattttatctatccatgttctagttgggctaagtttactttcgtggggttagatgaacatcaacacgaactatccctgtctttcagattttgtttctatccttgttaaataagataatttggcattatattcaaaaaatatgtaacacgtcaatggcatgaagtatgatttataaacacattaattcaggttttttaatgaacttttgttccatatacaattttcaagtgttactttttgatatacagttttcaaggttttggcagttttggggtgcctattatacatacaaacttaacctacttttattatgcttattaggaaataatatgtctggctgtgttactatcattcacaggcacatgctgcatcagctatcttgaatttcagtgagaattgcacgcctgaaattctgacaccttacctggatggaattgttaccaaattacttgttcttcttcaggtatccacctccctcaccagttaaatatattttattgtcttttagtgttatttttttgaactagtagaacatgtgctaatatattgtacttatgctttagaacggcaagcaaatggtgcaagagggagcattgacagctttagcatcagtagctgattcatcgcaggtaatttgtccatgtataagttagcttaatttcttatagggggagggggacgcaacattaccttttatacttatcttgatggttaatgagagtttataatattgtgttaaattttggtgtacttgtcttgcaggagcacttcaaaaaatactatgatgcagtgatgccatacctgaaagctattttaatgaatgcaactgataagtccaataggatgcttcgtgccaagtctatggagtgtataagtctggtcggaatggctgtaggcaaggataagttcagggatgacgcaaagcaggtaattgtgtcttctccactgtaattttgttctgtatgctatgttctatgcatgcacttttctaatctacacattgattgataggtcatggaagtacttatgagtttgcaaggaactacaatggaaaatgatgatccaataacaagctacatgcttcaggtacacataaaacctattatgaattaatcataataaaattcagatcctttgtaacattttctcctttatgtgacaggcttgggccaggttatgcaaatgtctcgggcaggattttcttccgtacatgaacgttgttatgccaccactgcttcagtctgctcaactgaagcctgatgtcacaattacttcagctgaatctgatgatgatatagaatcagatgatgataggtttgtgcatcttcttcaattgctatgttttatccactgaattaaatatgcccttaatattgatgctgtgtcagaggcattctatttaaatttatctatggttcattctttcttaagaagtactatttgtttctataccatactgaatgtaattacatacacttcgttcatagaaggttcctttttttcgtgaaactcgtgcctgtttatatttccgttatcaacctttttttttttgggttagtgggactgcaacttgcaatagctaccttatgcttgtaatatgtttccctattgattatcttttttcttttgcaatttgatttgttcagaaatatatcatccttttttatgtgaggtgtggtggttgtttttagcttcttgttggttctgcaatattgcccctaatctttttcactcaatacagcattgaaacaattacgcttggcgacaaaagaataggtatccgaactagtgtactagaagagaaagcaacagcttgcaacatgctatgctgttatgctgatgaactcaaggaggggttcttcccatggattgatcaggtttgatatcataccagcatgttaaatgtctaatttctcaattgccactcagtgtcatatgttggtggtcaaattccacgtaggttgctcctacattggttccactccttaaattttactttcatgaggaagtgaggagagctgctgttgcaggtatttgatgttttagtatgattttatcttttgccttatggatttgcattttaaaagtatagttccaacaacaatgcagctatgcctgaactactacgttctgcaaaattggctgttgagaaggggctggctcaaggacgcgatgaatcttatgttaaacaattatctgactacataattccagctcttgttgaagcgctgcacaaggtctatgcaaaatcttctctatacatgtggatggtttttctattcaacgctaacagctgttttcttttgaattactatacaggaaccagaaactgagatgtgttcatccatgcttgattcattaaatgagtgcatgcaggtttgttctccttttcatatttttatttgaatgggatggtatttttctatgaaattgtaatgcttctggagcatattgaggcagtgcactggtgtatacagctaactgggttatgtttgttgtctgcctatgcatcttagagagatcattcagctgtagaaacgtatacctggtgtcttttcttgttgagtttttagttatctattggatgaagctgaaatatcttcagttggatgaaccatgtatgaccagtttgttcaccatgaattttgtttggttggaatattgtttggtccaaaattgccatcaatagatagtggt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| External Link(s) |
