BGIOSGA015478

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Structured Information

Gene Name	BGIOSGA015478
Description	cDNA clone:J023064M18, full insert sequence
Definition	Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015478, complete gene.
LocusTag	'
Ensembl Transcript ID	BGIOSGA015478-TA
Ensembl Protein ID	BGIOSGA015478-PA
Length	30335
Source	Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 4
Location	Chromosome 4:7555790..7586124
Sequence Coding Region	7585778..7586124,7585527..7585664),complement(7584395..7584548,7584004..7584139),complement(7582925..7583070 ,7582324..7582419),complement(7582176..7582228,7581266..7581397),complement(7581126..7581177 ,7580923..7581039),complement(7578746..7578886,7578121..7578246),complement(7576692..7576769 ,7575841..7575960),complement(7574231..7574325,7572964..7573157),complement(7571651..7572423 ,7571438..7571518),complement(7571293..7571358,7570155..7570232),complement(7569275..7569505 ,7568780..7568908),complement(7568514..7568687,7564114..7564299),complement(7560284..7560469 ,7556875..7557242),complement(7555790..7555904
Genome Context	<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:7555790..7586124 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:7555790..7586124 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>ATGAGCTACGCGGCTTACAAGATGATGCACTGGCCCACCGGCGTCGACCACTGCGCCGCCGGCTTCGTCACCCACTCCCCCTCGGACGCCGCCGCCTTCTTCACCGCCGCGACGGTGGGCCCCGGGCCCGAAGGCGACATCGACTCGGCGGCGGCGGCGTCGCGTCCAAGGCGCTTAGGCCCCTCGCCCAACCTGGTCGTGGCGGCCGCGAACGTGCTCGAGGTGTACGCCGTGAGGGCTGAGACGGCGGCCGAGGATGGAGGCGGTGGCACCCAACCGTCCTCTTCGTCCGGTGCCGTGTTGGACGGTATCTCCGGGGCGCGCCTGGAGCTGGTGTGCTATTACAGGCTCCATGGGAACATTGAGTCCATGACCGTGTTGTCAGATGGAGCGGAGAATAGGCGAGCCACTATTGCACTTGCATTTAAGGATGCAAAAATAACTTGTTTGGAGTTTGATGATGCTATCCATGGCCTGCGTACTAGTTCAATGCACTGCTTTGAGGGCCCAGAATGGCAGCATCTGAAGAGAGGCAGGGAATCATTTGCTTGGGGTCCTGTTATAAAGGCTGATCCTCTTGGAAGATGTGGTGCTGCACTTGCTTATGGACTTCAGATGATTATTCTAAAAGCTGCCCAGGTTGGCCACAGCTTAGTTGGAGAAGATGAACCCACCTGTGCATTGAGTTCTACTGCTGTTCGTATTGAGTCGTCATATTTGATTGACTTACGAGCTTTAGATATGAACCATGTCAAAGATTTTGCTTTTGTACATGGTTATATTGAGCCTGTGTTGGTCATACTTCATGAGCAAGAGCCTACATGGGCTGGGCGTATCTTATCAAAGCACCATACATGCATGATATCTGCATTTAGCATCAGCATGACTCTAAAGCAACATCCAGTGATATGGTCTGCAGCTAATCTGCCCCACGATGCATACCAACTTCTTGCAGTGCCTCCCCCTATTAGTGGTGTTCTTGTGATCTGTGCAAATTCCATCCATTACCATAGTCAGTCCACATCGTGTTCTCTTGACCTGAACAATTTCTCATCACACCCTGATGGCAGCCCAGAAATTTCTAAGTCAAATTTCCAAGTTGAGCTTGATGCAGCTAAAGCAACTTGGTTCTCCAATGACATTGTAATGTTCTCGTCAAAGGCTGGAGAGATGCTGTTACTTACAGTGGTTTATGATGGGCGAGTTGTGCAGAGATTAGATCTTATGAAATCAAAAGCATCTGTCCTCAGTTCGGCTGTGACATCTATTGGAAACTCATTCTTCTTCCTTGGTAGTCGTCTGGGGGATAGCCTTCTTGTGCAATTTTCCTACGGTGCATCAAAATCTGTTTTGCAAGATTTAACAAATGAGCGCTCTGCTGATATTGAAGGTGATCTGCCTTTCTCCAAGCGCCTAAAGAGGATTCCTTCTGATGTTCTACAAGATGTGACCAGTGTTGAGGAACTTTCCTTTCAGAATATCATTGCACCAAACAGTTTAGAATCAGCACAGAAGATATCATACATTGTGAGAGATGCATTGATCAATGTTGGTCCACTGAAAGATTTTTCATATGGTTTAAGAGCCAATGCAGATCCCAATGCAATGGGAAATGCGAAGCAAAGCAATTACGAGTTGGTGTGCTGTTCTGGTCATGGTAAAAATGGTTCACTTTCTGTCCTTCAACAATCTATCCGTCCTGATTTAATTACTGAGGTGGAATTACCAAGTTGCAGAGGTATTTGGACAGTTTACTATAAGAGTTACCGTGGACAAATGGCAGAAGATAATGAATATCATGCATATCTGATAATAAGTCTGGAGAATCGGACAATGGTACTTGAGACAGGTGATGACTTAGGAGAGGTAACAGAAACTGTTGATTACTTTGTTCAAGCAAGCACCATTGCTGCTGGCAACTTGTTTGGGAGGCGGCGTGTCATACAGGTATATGGTAAGGGTGCTCGTGTGCTTGATGGTTCTTTCATGACACAGGAGCTAAACTTTACTACGCATGCTTCAGAATCATCTAGTTCAGAGGCTCTCGGTGTGGCATGCGCTTCCATTGCAGATCCATATGTTCTTTTGAAGATGGTTGATGGATCTGTTCAACTTCTTATAGGAGATTATTGTACTTGTACTCTTTCTGTGAATGCTCCCAGTATATTTATTAGCTCAAGTGAGCGAATCGCTGCCTGTACACTTTATCGTGACAGAGGTCCTGAACCATGGCTGAGAAAGACACGTAGTGATGCATGGTTATCTACTGGTATTGCGGAGGCAATTGATGGCAATGGTACTTCATCTCATGATCAATCTGATATATATTGTATCATTTGCTATGAAAGCGGTAAACTGGAAATTTTTGAAGTGCCTAGTTTCCGATGTGTTTTCTCTGTGGAAAATTTTATTTCTGGCGAGGCTCTTTTGGTTGATAAATTTTCTCAGCTCATATATGAGGATAGCACGAAAGAAAGATATGATTGCACTAAAGCTTCCCTAAAGAAAGAAGCAGGAGATAGCATTCGGATAGTTGAGCTTGCAATGCATAGATGGTCTGGTCAATTCAGTAGACCCTTCCTTTTTGGACTATTGAATGATGGCACATTGTTGTGTTACCATGCCTTCTCTTATGAAGCCTCGGAGAGCAATGTGAAAAGGGTTCCATTGTCACCTCAAGGTTCTGCTGATCATCACAATGCCAGTGATTCCAGGCTCAGAAATCTCAGATTTCACCGGGTTTCTATAGATATAACATCACGAGAAGACATACCAACTCTTGGACGACCAAGAATAACAACCTTTAACAATGTTGGTGGCTATGAGGGATTATTTCTTAGTGGCACGAGGCCAGCTTGGGTTATGGTTTGTCGACAACGATTGCGGGTGCACCCACAGTTATGTGACGGTCCCATTGAAGCCTTTACTGTTCTGCATAATGTAAATTGTTCTCATGGCTTTATATATGTTACATCACAGGGTTTTCTGAAGATATGCCAATTGCCCTCAGCATATAACTATGACAACTACTGGCCTGTTCAAAAGGTCCCTTTGCATGGCACCCCACATCAGGTCACATATTATGCAGAGCAATCTCTTTATCCCCTAATAGTGTCTGTTCCTGTAGTTCGTCCCCTAAATCAAGTTCTTTCTTCTATGGCTGATCAAGAATCAGTTCATCACATGGATAACGATGTTACAAGCACTGATGCTCTTCATAAGACATATACTGTTGATGAATTTGAGGTCCGCATTTTGGAGCTGGAGAAACCTGGTGGACATTGGGAGACGAAGTCCACAATTCCTATGCAATTGTTTGAAAATGCTCTAACCGTGCGCATTGTTACATTACATAATACAACCACCAAGGAAAATGAGACCCTGTTGGCCATTGGGACTGCTTATGTTCTTGGGGAGGATGTAGCTGCTAGAGGACGTGTGCTTCTGTTCTCTTTCATGAAAAGTGAAAATTCTCAAAATCTGGTCACTGAAGTCTACTCAAAAGAGAGTAAAGGTGCTGTATCAGCTGTTGCGTCTCTTCAAGGTCATCTGCTGATAGCTTCTGGTCCTAAGATCACATTAAACAAGTGGACTGGTGCTGAATTGACTGCTGTTGCATTCTATGATGCCCCTTTGCATGTTGTGAGCCTGAACATTGTCAAAAACTTCGTTTTGTTTGGTGATATTCATAAAAGCATTTATTTTCTGAGCTGGAAAGAGCAAGGTTCTCAATTGAGTCTCCTGGCAAAAGATTTTGGATCACTCGATTGCTTTGCAACTGAGTTCTTAATTGATGGAAGCACGCTGAGCCTTGTAGCTTCAGATTCTGATAAGAATGTGCAGGTCAAAAACTTCGTTTTGTTTGGTGATATTCATAAAAGCATTTATTTTCTGAGCTGGAAAGAGCAAGGTTCTCAATTGAGTCTCCTGGCAAAAGATTTTGGATCACTCGATTGCTTTGCAACTGAGTTCTTAATTGATGGAAGCACGCTGAGCCTTGTAGCTTCAGATTCTGATAAGAATGTGCAGATCTTCTATTACGCTCCAAAAATGGTTGAGAGCTGGAAGGGGCAGAAGCTCCTCTCCAGAGCAGAATTTCATGTCGGAGCCCATATAACGAAGTTTTTGAGGCTGCAAATGCTTCCTACTCAGGGCTTATCGTCTGAAAAGACAAATCGTTTCGCTCTTCTTTTTGGCAATCTGGATGGTGGCATTGGATGCATTGCGCCTATTGATGAGCTAACATTCAGACGGCTGCAAAGCTTACAGAGGAAGCTTGTAGATGCTGTCCCACATGTGTGTGGCTTGAATCCAAGGTCATTCAGGCAGTTTCATTCTAATGGGAAGGGACATCGTCCTGGACCAGATAACATCATTGACTTCGAACTTCTTGCACACTATGAGATGTTGTCATTAGATGAGCAGCTTGATGTTGCACAGCAGATTGGAACTACCCGCTCGCAGATACTGTCCAACTTCAGTGATATTTCACTGGGCACTAGTTTCTTGTAG</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MSYAAYKMMHWPTGVDHCAAGFVTHSPSDAAAFFTAATVGPGPEGDIDSAAAASRPRRLGPSPNLVVAAANVLEVYAVRAETAAEDGGGGTQPSSSSGAVLDGISGARLELVCYYRLHGNIESMTVLSDGAENRRATIALAFKDAKITCLEFDDAIHGLRTSSMHCFEGPEWQHLKRGRESFAWGPVIKADPLGRCGAALAYGLQMIILKAAQVGHSLVGEDEPTCALSSTAVRIESSYLIDLRALDMNHVKDFAFVHGYIEPVLVILHEQEPTWAGRILSKHHTCMISAFSISMTLKQHPVIWSAANLPHDAYQLLAVPPPISGVLVICANSIHYHSQSTSCSLDLNNFSSHPDGSPEISKSNFQVELDAAKATWFSNDIVMFSSKAGEMLLLTVVYDGRVVQRLDLMKSKASVLSSAVTSIGNSFFFLGSRLGDSLLVQFSYGASKSVLQDLTNERSADIEGDLPFSKRLKRIPSDVLQDVTSVEELSFQNIIAPNSLESAQKISYIVRDALINVGPLKDFSYGLRANADPNAMGNAKQSNYELVCCSGHGKNGSLSVLQQSIRPDLITEVELPSCRGIWTVYYKSYRGQMAEDNEYHAYLIISLENRTMVLETGDDLGEVTETVDYFVQASTIAAGNLFGRRRVIQVYGKGARVLDGSFMTQELNFTTHASESSSSEALGVACASIADPYVLLKMVDGSVQLLIGDYCTCTLSVNAPSIFISSSERIAACTLYRDRGPEPWLRKTRSDAWLSTGIAEAIDGNGTSSHDQSDIYCIICYESGKLEIFEVPSFRCVFSVENFISGEALLVDKFSQLIYEDSTKERYDCTKASLKKEAGDSIRIVELAMHRWSGQFSRPFLFGLLNDGTLLCYHAFSYEASESNVKRVPLSPQGSADHHNASDSRLRNLRFHRVSIDITSREDIPTLGRPRITTFNNVGGYEGLFLSGTRPAWVMVCRQRLRVHPQLCDGPIEAFTVLHNVNCSHGFIYVTSQGFLKICQLPSAYNYDNYWPVQKVPLHGTPHQVTYYAEQSLYPLIVSVPVVRPLNQVLSSMADQESVHHMDNDVTSTDALHKTYTVDEFEVRILELEKPGGHWETKSTIPMQLFENALTVRIVTLHNTTTKENETLLAIGTAYVLGEDVAARGRVLLFSFMKSENSQNLVTEVYSKESKGAVSAVASLQGHLLIASGPKITLNKWTGAELTAVAFYDAPLHVVSLNIVKNFVLFGDIHKSIYFLSWKEQGSQLSLLAKDFGSLDCFATEFLIDGSTLSLVASDSDKNVQVKNFVLFGDIHKSIYFLSWKEQGSQLSLLAKDFGSLDCFATEFLIDGSTLSLVASDSDKNVQIFYYAPKMVESWKGQKLLSRAEFHVGAHITKFLRLQMLPTQGLSSEKTNRFALLFGNLDGGIGCIAPIDELTFRRLQSLQRKLVDAVPHVCGLNPRSFRQFHSNGKGHRPGPDNIIDFELLAHYEMLSLDEQLDVAQQIGTTRSQILSNFSDISLGTSFL</aaseq>
Gene 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