BGIOSGA015502
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015502 |
|---|---|
| Description |
Japonica Group Os04g0178300 (Os04g0178300) mRNA, |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015502, complete gene. |
| LocusTag |
NM_001058706.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015502-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015502-PA |
| Length |
6569 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:6557974..6564542 |
| Sequence Coding Region |
6564266..6564542,6563191..6563374),complement(6562366..6562580,6561643..6561763),complement(6561384..6561496 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:6557974..6564542 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:6557974..6564542 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATCGATGGCATCAGGACAGCACTGAGATCAATCGGAGAGGGAGAGATTAGCATCTCAGCCTATGACACTTCGTTGGTTGCCCTTCTGAAGAGGCTAGATGGGGGTGATGGTCCTCAGTTCCCATCAACCATCGACTGGATCGTTCAGAATCAGCTACCGGATGGTTCATGGGGTGATGCCTCCTTCTTCATGATGGGAGACCGGATCATGAGCACCCTCGCTTGTGTTGTAGCGTTGAAGTCATGGAACATCCACACCGATAAATGCGAGAGAGGTTTGTTGTTTATCCAAGAAAATATGTGGAGGTTGGCCCATGAGGAAGAAGACTGGATGCTAGTTGGATTTGAGATTGCCTTGCCCTCGCTCCTAGACATGGCTAAGGACCTGGATCTTGACATCCCTTACGATGAGCCAGCCTTGAAAGCAATATATGCCGAGAGAGAAAGGAAGCTTGCCAAGATTCCAAGAGACGTGCTACACGCTATGCCAACAACTTTACTTCATAGCCTTGAGGGAATGGTTGACTTGGACTGGGAAAAGCTCCTCAAGCTCCGGTGTCTCGATGGGTCCTTCCATTGCTCCCCTGCTTCGACGGCTACTGCTTTCCAGCAAACAGGAGACCAGAAATGCTTTGAATACCTCGATGGAATCGTCAAAAAGTTCAATGGAGGAGTTCCCTGTATCTACCCTTTGGATGTGTACGAACGCTTATGGGCCGTCGATAGGCTGACGAGGCTGGGCATATCAAGGCACTTCACAAGTGAAATTGAGGATTGCTTAGACTACATTTTCAGGAACTGGACTCCAGATGGATTAGCTCACACAAAGAACTGCCCGGTAAAAGATATCGATGACACGGCCATGGGTTTCCGTCTCCTCCGACTTTACGGCTACCAAGTCGACCCATGCGTGTTGAAGAAGTTCGAAAAGGATGGCAAGTTCTTCTGCTTGCACGGGGAGTCCAACCCATCCTCTGTCACCCCAATGTACAACACTTACCGGGCCTCCCAGCTCAAATTTCCTGGCGATGACGGTGTCCTTGGGCGAGCTGAGGTGTTTTGCCGCTCATTCCTCCAAGACAGGAGAGGCTCAAACAGAATGAAGGACAAGTGGGCCATCGCCAAGGATATCCCAGGCGAGGTTGAGTATGCTATGGACTACCCATGGAAAGCAAGTTTACCGCGTATTGAAACAAGGTTGTACTTGGATCAATATGGAGGTAGTGGCGATGTATGGATTGGGAAGGTCCTGCACAGGATGACTCTTTTCTGCAACGACCTGTACCTCAAGGCAGCTAAAGCTGACTTCAGTAATTTCCAGAAAGAGTGCCGAGTTGAGTTGAATGGCCTTAGAAGGTGGTATTTGAGGAGTAATCTGGAGAGGTTTGGAGGGACTGATCCACAGACTACACTGATGACATCCTACTTCTTAGCTTCAGCGAACATCTTCGAGCCAAACCGAGCAGCGGAACGTCTTGGATGGGCTCGCGTAGCGTTGCTTGCCGATGCCGTCTCCTCTCACTTCAGGAGAATCGGGGGACCAAAAAATTTGACCAGTAATCTTGAAGAGCTTATCAGCCTTGTTCCATTTGACGACGCTTATTCTGGCAGTCTTCGTGAAGCTTGGAAGCAGTGGCTCATGGCATGGACTGCAAAGGAGAGCAGCCAGGAGTCAATTGAAGGGGACACGGCAATATTGTTGGTTCGTGCCATCGAGATTTTTGGAGGACGGCATGTTTTGACTGGGCAAAGACCGGACCTTTGGGAGTATTCCCAGCTCGAGCAGCTCACCTCCTCCATCTGCCGCAAACTGTACAGGAGGGTTCTTGCCCAGGAGAATGGGAAAAGTACGGAGAAAGTTGAGGAGATAGACCAGCAATTGGATTTGGAGATGCAGGAATTGACTCGGCGCGTTCTTCAGGGCTGCAGCGCTATTAACAGACTAACCCGGGAGACGTTTCTCCATGTGGTGAAGAGCTTCTGCTATGTCGCCTACTGCTCACCTGAGACAATTGATAACCACATCGACAAGGTCATATTCCAAGATGTGATTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIDGIRTALRSIGEGEISISAYDTSLVALLKRLDGGDGPQFPSTIDWIVQNQLPDGSWGDASFFMMGDRIMSTLACVVALKSWNIHTDKCERGLLFIQENMWRLAHEEEDWMLVGFEIALPSLLDMAKDLDLDIPYDEPALKAIYAERERKLAKIPRDVLHAMPTTLLHSLEGMVDLDWEKLLKLRCLDGSFHCSPASTATAFQQTGDQKCFEYLDGIVKKFNGGVPCIYPLDVYERLWAVDRLTRLGISRHFTSEIEDCLDYIFRNWTPDGLAHTKNCPVKDIDDTAMGFRLLRLYGYQVDPCVLKKFEKDGKFFCLHGESNPSSVTPMYNTYRASQLKFPGDDGVLGRAEVFCRSFLQDRRGSNRMKDKWAIAKDIPGEVEYAMDYPWKASLPRIETRLYLDQYGGSGDVWIGKVLHRMTLFCNDLYLKAAKADFSNFQKECRVELNGLRRWYLRSNLERFGGTDPQTTLMTSYFLASANIFEPNRAAERLGWARVALLADAVSSHFRRIGGPKNLTSNLEELISLVPFDDAYSGSLREAWKQWLMAWTAKESSQESIEGDTAILLVRAIEIFGGRHVLTGQRPDLWEYSQLEQLTSSICRKLYRRVLAQENGKSTEKVEEIDQQLDLEMQELTRRVLQGCSAINRLTRETFLHVVKSFCYVAYCSPETIDNHIDKVIFQDVI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..277#1169..1352#1963..2177#2780..2900#3047..3159#3801..4033#4473..4588#4702..4800#5262..5441#5555..5642#5742..5951#6348..6569#ATGATCGATGGCATCAGGACAGCACTGAGATCAATCGGAGAGGGAGAGATTAGCATCTCAGCCTATGACACTTCGTTGGTTGCCCTTCTGAAGAGGCTAGATGGGGGTGATGGTCCTCAGTTCCCATCAACCATCGACTGGATCGTTCAGAATCAGCTACCGGATGGTTCATGGGGTGATGCCTCCTTCTTCATGATGGGAGACCGGATCATGAGCACCCTCGCTTGTGTTGTAGCGTTGAAGTCATGGAACATCCACACCGATAAATGCGAGAGAGGTATGTGTATATCACTAGATTTCCTTTTCTCCATTGTCTCTTCTTGTGGACACAATCCTTGATGTTTCCTTTTGATGGACTGAACTTTTTGATTTTGTTTACTGGTTTGTTTTGATTTTCTTTAAAAAATAAATGTGTTTATTAAAATAATTTAAAAAAAATCAAAGTTTTACAAATTCACACCCCCTGACATCACTTAGTGTAGCGTTTTTTAAAAACACCCTCCTAAATAATATTTTTTATAACATGACACATGGTCATTGAGATATGTTAACAGTCGTCGTACGAAGGAGCTGACCATTTTTCAGGCAACACTCTTATAAAGGGGGCCACTTGTAAAATGGCAGCCTAGCATATTTTGTAAGCGACCTCCTTGTAACCCTCCCAAAATAGAGTTTCTCTATATAGGAAGTGGATTTTTTCCCTTGAGAGGATGTCCCCTTGTTTTGTGCATGGTATTTAAAAAATCATGAAAAATTTGAAAAAAAATATCAAGATAGATCAATATATGATACATCTTTACACAAACATACAAGTTGAAATATTACTTATACAATTTAAAAAAAAAAAACAAATTTAACCACGAATTACATGTTTCATTCATAGTTAAATTTGTTACTTTTGTTTCTAGTTGTATAAGTTAAATTAGAATATGTATGTTTGTGGAGTGACATATCACATATTGTTCAATCTTACTATTTTTTTTTGAATTTTCTAATGACTTTTAAGAGATGAAAAATAAGAAGACATCCCCTTAAGCAATTAATAGAGTTTCTCTATGTGTGTGCGTGTGTATATAATATATGTATACATATATTGCGCTATCAGCATGTTTGTTTTTGGATTTACTATGCCAATAATTTGAGAGATGACAAGGATTTATTGTCGTAGGTTTGTTGTTTATCCAAGAAAATATGTGGAGGTTGGCCCATGAGGAAGAAGACTGGATGCTAGTTGGATTTGAGATTGCCTTGCCCTCGCTCCTAGACATGGCTAAGGACCTGGATCTTGACATCCCTTACGATGAGCCAGCCTTGAAAGCAATATATGCCGAGAGAGAAAGGAAGCTTGCCAAGTATGTATGCCTATATCTACCTATTAATTATTTTGTTTAGTAAAATTTTAGTCATGCCACACACGATAGAATATAAAGGATAAAATCCATCGTGAAAGCGCCCGCTTGCTTCTCGGTCTCTCTCACAAATAGCTACTCTCTCCGGGGTGATAATACTTATCCTTTTAGACAAGGACACGGTCTCTAAAAAGTAACTTTGACAACTATTTTCTATTATAATATATATAGAAATATTAACAAATATATGATTTTATTAAAGTACTTTTTAAACTAATCTACACATATGGTCTTCATATTTTAAGATAAATATTTTAGAAATTATTTTTAATCAAAGATTTTAATGTTTGACTTTACCCTTGTTCAAAATGACTAATATTATCGGTCCGAAGTGAGTAGCAGATATGGACTTATTGCATATGCCCGAAACATGTAATATGTGGATCTATCGTATATTAGGGTTGCATTACTGTAAAACCATTCACAAATTATTCTCCTTTTTTGCTTTTCTTATACAGTTAAAATTATTGCGAGATTTAGAGTTATTTTTGCTCTAATATAACGCATTCTAACATCTTTTACGATGAATGAATGTTTTGCATTCAAATTCTAGGATTCCAAGAGACGTGCTACACGCTATGCCAACAACTTTACTTCATAGCCTTGAGGGAATGGTTGACTTGGACTGGGAAAAGCTCCTCAAGCTCCGGTGTCTCGATGGGTCCTTCCATTGCTCCCCTGCTTCGACGGCTACTGCTTTCCAGCAAACAGGAGACCAGAAATGCTTTGAATACCTCGATGGAATCGTCAAAAAGTTCAATGGAGGAGGTAATTATTGAAGCCGATTTACCAAAATATTTTTTGTTGATTTACATGCACAAAATTTCAGAATTCCATAAAGTATATTAATTAATTTCTCCTTATATTAGCTAGTTTCTTCTTCCTTCCTCTCCCAGTACACTGACTCAATTCAACACTGTATCTGTATGCAATGAAACAGAAGCGCACTTCTGTATGAAACAGAACCCCTCCCCTCCACACGAAAAATAGAGCGATAGATTAACACATGATTAAATAAGTATTAGTTATAAAAAATTTAAAAAATAAATTAATATGATTTTTTAAAGCAACTTTCATATATAAACTTTTTATAAAACATGTACCGTTTAATAGTTTGAAAAGCGTGCATGCGGAAAATGAGGAAGATAGGTCGGGAATCTATGGGAAAGAACGCACCCAAGAGGCTAGGTTCAGTAGTTCGTTTAGCTTTTGCAATCTCCTTGTTTTTTTTCATTAGCACTACTCCCAAACTTGTAAATGGTACCTTTATTGACAACTTTTTATATACAACCTTTTCCAGAAAAAATAAATAAACTTACAGTATTATTATGTTTAATAATTACAGCTTACTTATTCATTATGTTTTCCAGTTCCCTGTATCTACCCTTTGGATGTGTACGAACGCTTATGGGCCGTCGATAGGCTGACGAGGCTGGGCATATCAAGGCACTTCACAAGTGAAATTGAGGATTGCTTAGACTACATTTTCAGGTACTAATTAACTTTTAACATACATGTATATATCTGTATTACCAACATGTATACAGATACTTTATGCACGTAGGTAACCAAAGTGAATTAATTAATGTTTAGTTGACCATATATATATAATATGGATATTAATTATACTGGAACAGGAACTGGACTCCAGATGGATTAGCTCACACAAAGAACTGCCCGGTAAAAGATATCGATGACACGGCCATGGGTTTCCGTCTCCTCCGACTTTACGGCTACCAAGTCGACCCATGTAAATACTAGTCCCTCGGTCTTTTTTCTTAATTAAATTGTTTAAAGTTTCAATAAGTTAATTTATAGAAAATTATAGCAACATTTCCAATACAAATATATTCAATGTTACATTTAATTAAACTAGCTTGGTGTTGTAGATTTTGCTATTTTTCCTATAAATTTGATCAACCTAAATAATTAAGGTCTAACTTGGAAAACAATCAAAGCAACTTATAATATCAAAATATAAATACATGGAGTAGTTTACTAACAGTTGCTAATTAACGTCTAATAATTAAGATATCCAACAAATTAAAATTACTACTTATTGTTTTAAAGTACTTATTGTTCGAACAAATCTCACACAAACCAACAAGATGTACAAAGATTATATTACATGGTTTACCCTCATTAAATACATGCCAATTACTTTTCCAAAGCATATGAACCATTGGAGTTGTGACTGCATTAATGTATAACCGCATTCATAAAGGATAGAGAGAGAAGATGACCTCTACTAGAAGTACTTTGGAAACGTGACAATGATAAGTATTTTGATATAAAATTTAAATTCTAGAATGATAAGTAATATAAAATGGAGAGACTATTTACTTTAATAATTGAACCTAGCTAATGTGCTCAAACGATAATGCCATGCAGGCGTGTTGAAGAAGTTCGAAAAGGATGGCAAGTTCTTCTGCTTGCACGGGGAGTCCAACCCATCCTCTGTCACCCCAATGTACAACACTTACCGGGCCTCCCAGCTCAAATTTCCTGGCGATGACGGTGTCCTTGGGCGAGCTGAGGTGTTTTGCCGCTCATTCCTCCAAGACAGGAGAGGCTCAAACAGAATGAAGGACAAGTGGGCCATCGCCAAGGATATCCCAGGCGAGGTATGTTAAGTCCTACTACTCCCTATGCCAAAAAAAAAAAAGAGCTTTTCAGGATGAATCTGAACATGCATTTGTTCAAACAATCGAAAATCAATGCAATTTTATTAAAGTATATATGAATGGGATGTGATAATACTTCGTTCCTATTGAAAATGCAAGTTTTTGATGCTAAGCTACCAACTAATTCATTGCGTCTTCTACTTCAATATACTCCTACTCCCTCCGTCCAAAACAAAAACCTTTCAGGATGAATGATATGCATTTGTCTAGACTGGAACAGAGAGAGTGCCTAGCTAGCAATGGAAAATTAAGGCAAATTTATTAAAGTATATATGGATGGAATGTGATAATACTTCAATTCCTATTGAAAATACAAGTTTTTTTATGCCAAGCTACCAACTAATTTATTCTGTCTTCTACTTCAATATATATTTATTAGGTTGAGTATGCTATGGACTACCCATGGAAAGCAAGTTTACCGCGTATTGAAACAAGGTTGTACTTGGATCAATATGGAGGTAGTGGCGATGTATGGATTGGGAAGGTCCTGCACAGGTAATTAACCGTAGCTTCAGATGTAATAATATGTATTTTGTCTATTCGTTAATGATAGAATTACCTGCAGCAAAACAAATAGTCCCTTCTTGTTCTAAGTCTGAATTTTTCAGGATGACTCTTTTCTGCAACGACCTGTACCTCAAGGCAGCTAAAGCTGACTTCAGTAATTTCCAGAAAGAGTGCCGAGTTGAGTTGAATGGCCTTAGAAGGTATGTCCTATTAATCCCGAATTTGAGCCAATAACTCTTTGACAAATACCATATATCT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