BGIOSGA015547

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA015547

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015547, complete gene.

LocusTag

OsI_14948

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA015547-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA015547-PA

Length

16124

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:5129450..5145573

Sequence Coding Region

5145521..5145573,5145348..5145387),complement(5145176..5145256,5144598..5144792),complement(5142169..5142279
,5141934..5141999),complement(5140867..5140974,5140746..5140790),complement(5140477..5140533
,5139752..5139815),complement(5139556..5139658,5137884..5137935),complement(5137661..5137720
,5136986..5137048),complement(5136808..5136914,5136116..5136238),complement(5133932..5134013
,5133756..5133826),complement(5132650..5132730,5131686..5131743),complement(5131541..5131608
,5130809..5130883),complement(5130158..5130245,5129450..5129551

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:5129450..5145573 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTCAGATCCCCAATCTCGACAATGCTCCTCTCAATCTCGCGGCCCTCAGGGAGCAGTCGCAGAAGGACCTGCTAAACATCCTCAAGAGTATTAGGGGGAAGAAGTGTGTAGTTATTGATCCCAAGCTCGCGGGTACCCTGTCTCTGATTCTGCAGACCTCACTGCTAAAGGAATATGGTGCAGAGTTGCGGCTTCTCTCTGCTGAACCCCTCCAAACTGAGTGCGCTAAGATCCTATATCTCATACGCTCTGAGCTGAAGTTCATGAAATTAATTGCAAGCCAGATTAAGAACGATGAGCCTAAAGGGCTTCAGAGGGAATTCTTTCTTTACTTTGTGCCACGGCGCACAGTTGCCTGCGAAAAGATTCTGGAGGAGGAAAAAGTTCATCAGAAATTGACACTCGGAGAGTACCCCTTGTATCTAGTTCCATTGGATGAAGATGTGATTTGTTTTGAACTTGATCATTCTCTGCAGGAATGCCTTATTGAAGGGGATACTAGTTCTGTTTGGCATGTTGCAAAAGCTATCCATAAGTTAGAGTTTGCCTTTGGAGTGATTCCCAATGTTCGGGCCAAGGGTGTTGCATCCACCAAAGCCGCAGAGTTGCTGAATAGTATGCAACAGGAAGATCCTGTCAACATGGATGATATGGGGACTCCGGAGATAAACACTGTTATTTTGTTAGACAGAGAGGTGGATTTAGTGACACCGATGTGCTCTCAGTTGACATATGAAGGTTTATTAGATGAGATGTTGCAAATAAACAATGGATCTGTGGAGGTTGATGCCACTATTATGGGAGCCCAACAAGATGGTTTCTCTTTCTCCCATCTTTGGGAGGTATTCTGCCTCCCACTACTTGGAAGGTACCTCTTCAGAAAGGGAGGTGCTAAAACTGATCCCACAAGTGGGGGTAGTGATAAGTTGTACAAGGAAATTCGAGATCTCAATTTTGAAGTTGTAGTTCAGGTCTTGCGCCAAAAGGCAACATCTATTCAGCAAGATTACGCCGAAGTAAAATCCACCAATACTCAATCGGTTTCGGAGCTGAAGGACTTTGTGAAGAGGTTACATTCACTGCCAGAGATAGCTAGGCATGTTCATTTGGCACAACACTTGCAATCATTTACTGGAAAACCTTCCTTTCATGCCCGATTAGACATTGAACAAACAATATTGGAGGTGCAAAACTTTGAAATATGTTTTGAATACATTGAAGAGATGATACATAAGCAGGAGCCTATTGAAAATGTTCTTCGCCTTCTAGTGTTACTTTCACTTACAAATGCTGGGTTGCCAAAGAAGAATTTTGACTACTTGAGGCGGGAAATACTGCACAGTTATGGCTTTGAGCACATGCCCTTGTTATACAATCTGGAAAAGGCTGGCCTATTTAAGCGCCAGGAATCAAGAAGTAACTGGATTGGTATTACAAGGGCTCTACAGCTTATAGTTGATGTAAATGATACTGCAAACCCTAGTGATATATCATACATATTTTCTGGATACGCCCCTCTCAGTATTCGCCTTGTTCAGCATGCTGTGAGATCTGGATGGCGATCTATTGAAGAACTGTTGAAACTATTGCCAGGTCCTCATCTGGATTTGAAAAGAGGTAGTTCGGCCATTAATTCTTCATTGGATGTACACCAAGGTTTGGGGCTTCAACAGAGTATTGACAGATTATTTGCTCTCAGTGGTGATGAGGGATTTATGAGAGATCTGATACAAACTTATGAGAGCAAACCAGAAACAGGGGTTGGACATCGTTCTCTGGTTTTGGTTGTCTTTATTGGTGGGGTTACTTTTGCGGAGATTGCTGCTCTTCGATTCCTTAGTGCTCAGGAAGGGATGGGCTATGACTTCCTTGTTGCGACCACAAAGGTTGTCAATGGGAACACAATACTCAGGCCAATTATAACCAATAGCAAAGAGGTGATGATATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAQIPNLDNAPLNLAALREQSQKDLLNILKSIRGKKCVVIDPKLAGTLSLILQTSLLKEYGAELRLLSAEPLQTECAKILYLIRSELKFMKLIASQIKNDEPKGLQREFFLYFVPRRTVACEKILEEEKVHQKLTLGEYPLYLVPLDEDVICFELDHSLQECLIEGDTSSVWHVAKAIHKLEFAFGVIPNVRAKGVASTKAAELLNSMQQEDPVNMDDMGTPEINTVILLDREVDLVTPMCSQLTYEGLLDEMLQINNGSVEVDATIMGAQQDGFSFSHLWEVFCLPLLGRYLFRKGGAKTDPTSGGSDKLYKEIRDLNFEVVVQVLRQKATSIQQDYAEVKSTNTQSVSELKDFVKRLHSLPEIARHVHLAQHLQSFTGKPSFHARLDIEQTILEVQNFEICFEYIEEMIHKQEPIENVLRLLVLLSLTNAGLPKKNFDYLRREILHSYGFEHMPLLYNLEKAGLFKRQESRSNWIGITRALQLIVDVNDTANPSDISYIFSGYAPLSIRLVQHAVRSGWRSIEELLKLLPGPHLDLKRGSSAINSSLDVHQGLGLQQSIDRLFALSGDEGFMRDLIQTYESKPETGVGHRSLVLVVFIGGVTFAEIAALRFLSAQEGMGYDFLVATTKVVNGNTILRPIITNSKEVMI</aaseq>

Gene Sequence

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