BGIOSGA016117

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA016117

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016117, complete gene.

LocusTag

OS04G0311100

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA016117-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA016117-PA

Length

10651

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:12184047..12194697

Sequence Coding Region

12184047..12184401,12185404..12185481,12185634..12185668,12186434..12186527,12187176..12187260
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,12189264..12189422,12189512..12189607,12190195..12190246,12190331..12190442
,12190586..12190650,12191829..12192226,12192941..12193035,12193788..12193863
,12194415..12194537,12194629..12194697

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGCCGCCGGCGGCGGCGGCAGAGGGGGGCGCCCCGTCGAGGAGGATTTCATCGAGCTGAGTAGCAGCGACTCCGATTCCGACGGGGAGGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGCAGCGCGAAGAGGTCGCGGGGTGTGGGGGCGGGTGGATCGGCGGGGAAGCGCGCTAGGGTTTCCGCGGCGGGCGTGGCCGTGGATCTGCCCCCGGGTTTCCTTGATCCTCTACCACATGCGGCGTCGGCGGCGGCGGGGGCGGAGGCATCGGCGGGGCCGTCGAAGAGCGCGACGAAGCAGTTCTGGAAGGCCGGGGACTACGACGGGAAGCCGCTTGGGGATGGAGCGCCGCAGTCGTCAGTATCCGGATTGGATCATGTTCGTGTACATCCTAAATTTTTGCACTCAAATGCAACAAGCCACAAGTGGGCTCTGGGGGCATTGGCTGAGCTGCTGGATAACTCTCTTGATGAAATGATGGTGGTGGAATGGACCCAGACAAAATGCTGGCAGTGCATGTCATTGGGTTATTCAGCCAAGAGCAAAGTTGCAAGTACTATTGGGCAATATGGAAATGGTTTCAAGACAAGTACAATGAGACTTGGTGCTGATGTTTTAGTTTTCTCCCGTAGTGGTGGAAAAGGTGGCAAAAGGCTTACCCAAAGTGTTGGCATGCTATCCTACACCTTTCTGAGGAGCACCAACAAAGAGGATATTGTTGTTCCAATGATTGATTATGAAAATCAACAAGGTTGGAAAAGAAAGCCACGGACTACATTTGCTGATTGGAACACAAGCTTACAGACTATTATTACATGGTCGCCATATTCAACTGAAGCAGAACTACTTGAGCAGTTTAGTTCTATAAAGGAACAAGGGACTCGTATTATCATTTACAATCTTTGGGAGGACGATGAAGGACATTTGGAGCTTGATTTTGATGAGGACATACACGATATTCAACTCAGAGGTGGCAATCGTGATGAGAAAAATATCCTGATGGCTAAGCAGTTTCCGAACTCCAAGCATTTCCTGACTTATAGGCATTCATTAAGGAGCTATGCATCCATTTTATATCTCCGAGTTCCAAGTTTTTTCCAAATGATTTTACGTGGAAAAGAGATTGAGCACCATAATATTGTGACTGACATGATGTTGAAGAAAGAGGTGAAATACAAGCCAGTTGCACCTAATGGTGTTCCAAAGGATTCAAATATGGTAGCCGATGTAACAATTGGCTTTGTTAAAGATGCAAAACATCATGTTGATGTTCAGGGATTTAATGTATACCACAAGAACAGGCTAATAAAGCCTTTCTGGAGAGTGTGGACTGCCGCTGGAAGTGGTGGGCGTGGTGTCATAGGTGTACTGGAAGCTAATTTTATAGAGCCAGCTCATGATAAGCAGGACTTTGAGAGAACAACTCTTCTAGCAAGACTTGAAGCACGATTAATTCAAATGCAGAAAGACTATTGGTCAGGAAATGCTCATCGAATTGGATATTCTGGGACACGTGCTGGCAGATCCAATGAAACAGAAGAGGACGCCCCTGAAGTTACCCAAAGTGCACAGCAATCACCTTACTCTACGGGAAAAAATTATGGAAAATCAAATAAAAAGCAATCGCCTTACTCTACTGGGAAAGATAATGGAAAATCAAATACTAAATCTGGGAAGGCAAGCACGTCATTTCATACTCAGCGAAGAACTGATAAGTCTGCAACGACTAAACAACCTGGAAGATCAATAATGTATGGGCTTTCAGATACCAGTGATGAAAGTGATTCTGAGTTTGTGGGCGCCCCAACTCCAACAAGTTCAAGATCTCATATCCTGAATCCACTTAGAAAATCTTTCCAGAATGGGACTGCTTTGGCAACACCTCCATCCAATGGACGGACAGAAAGAGAGAGAAACAAAACTGCATCCCAGCCTGTGCAACTTAATGCAGCAAGTAATGGGGATTATACTATTGATGATCATGAGACTATTATCAAGCAACTGAGGGACGAAAACTCATCGTTGAAGGAAAGGTTACTGAAGGTGGAAGAATCATTGTCACAGGAGCTGGCGATTGAACGTGATAAGAACAAATCGTTAACAGAGAGGTTAGAGGATGCACAGAGGCAACTAGAAACTTCAAACAAGGAACAAGAAGCATTGATTGACATCTTCTCAGAAGAAAGAGGTCGACGAGACCTAGAAGAGGAAAATCTGCGAGGGAAGCTAAAGGATGCTTCTTCTACCATACAAGATTTGCTGGAGCAATTAAACGCTGCCCGAAAAGGTCGCAAGTTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAAGGGGRGGRPVEEDFIELSSSDSDSDGEGGGGGGGSAKRSRGVGAGGSAGKRARVSAAGVAVDLPPGFLDPLPHAASAAAGAEASAGPSKSATKQFWKAGDYDGKPLGDGAPQSSVSGLDHVRVHPKFLHSNATSHKWALGALAELLDNSLDEMMVVEWTQTKCWQCMSLGYSAKSKVASTIGQYGNGFKTSTMRLGADVLVFSRSGGKGGKRLTQSVGMLSYTFLRSTNKEDIVVPMIDYENQQGWKRKPRTTFADWNTSLQTIITWSPYSTEAELLEQFSSIKEQGTRIIIYNLWEDDEGHLELDFDEDIHDIQLRGGNRDEKNILMAKQFPNSKHFLTYRHSLRSYASILYLRVPSFFQMILRGKEIEHHNIVTDMMLKKEVKYKPVAPNGVPKDSNMVADVTIGFVKDAKHHVDVQGFNVYHKNRLIKPFWRVWTAAGSGGRGVIGVLEANFIEPAHDKQDFERTTLLARLEARLIQMQKDYWSGNAHRIGYSGTRAGRSNETEEDAPEVTQSAQQSPYSTGKNYGKSNKKQSPYSTGKDNGKSNTKSGKASTSFHTQRRTDKSATTKQPGRSIMYGLSDTSDESDSEFVGAPTPTSSRSHILNPLRKSFQNGTALATPPSNGRTERERNKTASQPVQLNAASNGDYTIDDHETIIKQLRDENSSLKERLLKVEESLSQELAIERDKNKSLTERLEDAQRQLETSNKEQEALIDIFSEERGRRDLEEENLRGKLKDASSTIQDLLEQLNAARKGRKF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..355#1358..1435#1588..1622#2388..2481#3130..3214#3928..4003#4327..4452#4697..4795#4896..4997#5218..5376#5466..5561#6149..6200#6285..6396#6540..6604#7783..8180#8895..8989#9742..9817#10369..10491#10583..10651#ATGGCGGCCGCCGGCGGCGGCGGCAGAGGGGGGCGCCCCGTCGAGGAGGATTTCATCGAGCTGAGTAGCAGCGACTCCGATTCCGACGGGGAGGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGCAGCGCGAAGAGGTCGCGGGGTGTGGGGGCGGGTGGATCGGCGGGGAAGCGCGCTAGGGTTTCCGCGGCGGGCGTGGCCGTGGATCTGCCCCCGGGTTTCCTTGATCCTCTACCACATGCGGCGTCGGCGGCGGCGGGGGCGGAGGCATCGGCGGGGCCGTCGAAGAGCGCGACGAAGCAGTTCTGGAAGGCCGGGGACTACGACGGGAAGCCGCTTGGGGATGGAGCGCCGCAGTCGTCAGGTAACCTTATTTTTTTTTTCTGGTCGCGTAACCCTTCTGTAATCCTGTTCTTGTTGTCATATCATAAATATCGTTTTAATATCTCTATGCTCGTTGTCATTTGATGGAGTTGAGATGTTTTGGTTCTTTCCTTAGACGATTCATGCAATGCAGCATTTAAGGTTTTGCAGCACTGAAAATGTGACTAGTAGCATTCAATGGGGGGAGTTTCTGGAGATAGAGTAAAATAGTTAATACTTCACCTGTGAACTGCAGAGCTTGAGGATTGGAACATTGATATGAACAAACAAGAAAGGTTATATGTTAGGAATGGGTGCCACTTGGACTTGGGTGCTTGTTAGGGCATGTACAATGGTCTTTATTAGTGGTCTCTCTCTATTGCAATGCAAGTAAATTTGATGACATGGAAGAAAGAGAAAGGAGGAAAGAGAAATATGGTTGTTATGCATGACAACTTCTCAGAGTCGACTCTTAGCATTTATTAGAGCAGATTTTAGCATTTATTAGAGCAGATTTTGTTGAATGGTGGTGAAAGAAAGGAAAGAATAGTAAGAAAAAATATTTCGATACATTAATGATTAGAGACCATATTGTCTCCAACTATTGTAGGATGCTAGTCTCTAGATAGCATAGAGCTCATACCTGACTCTATCTTTGTACATGCCCTTAGTTGTTTTAGTCCCTTCTTTCTATTTATTTTATGTTTTAGACCTGATTACACTTTTTAGGAAAATAGCAGCCAATGTAAGTAGGGTTGTGCCTTTGTACAATGTTGAATAGGAATGAAACTAAATGAAGTGGTAGAGATTTAGGAAGATGTATTTCCGTCTCTTCCATTGGAAGTTCTCTTTTTCACTCATACAACGAATTTGTCAACAGACATGTTCTTTATGGAAGTCTGTATGTGTGTAATATTTCTTTCTTAATCGGTCTGGATTAGATACACAAGTATCTGTGATTTTCTTTCTGTATTCTAATTTCACATTCACTTTCTCTTTTCAGTATCCGGATTGGATCATGTTCGTGTACATCCTAAATTTTTGCACTCAAATGCAACAAGCCACAAGTGGGCTCTGGGGGGTATGGTCTTCATCTTCATTTTACCTTTGCACTACCATTTCTTCCCATGAATGCTATAGCAGACACAACAACGGTGCCATGTTATTTGCTCACACAACTCAATCAATGTTTGGTCACACCAGTTGGCTAACATATTTTTATCCACGTTACAGCATTGGCTGAGCTGCTGGATAACTCTCTTGATGAAGTAAGTATTGTGAAATATTAAGTGCACTAGTTTGTAGCATTGAATCCTTGTATGTTTACTGACCTCTGTTTTCTCCGAAGGTCATAAATGGAGCTACCTATGTGAACATTGATATGTTGGAGAATAATAAAGACAAAACAAGAATGCTCCTTGTTGAAGGTGCACAACCTTTTTACCTTTTACCTTTAATTGTTGGCAAAAATCTTTGGTAAAATTCATTTTTTATAGTGACTTGATTTGGTACCTCTATTTCTGTTTATATTATCAAAAGTTTCTTTGATGACAAGAAACTTCTGTGTCCATAGCAAATTAACAACATAAAACATGCCCCTTTCTATCTGTTATAGCAAACTAAGTGAAGTAGTGAACATATATTTCACTCTGGAACCTGATAGGTTTCGACTTGACTTATAGTATTAACATGATGTGGTACATGGAATATTCAAGATCTTTTAAGCTTGTCCCTGTTTTATGTTATATGCAATTAATTGATGTACAGATTCAATTTGGCATAAAGAAAATTTAGGAGTTTAGGGATGCACAAAGCAAAATGGAAGATTGGTTTAAGGTTGGACAACCTCAGAAATATTATAGGTCTTTTACTGAGGCCTCTGGAGTGGTTAACACATTTAAGTGCTATCAGATAGTGCAGCATGTTTATGAAACTATGATGGAACTTTTAGATCTTACCTTATAAATGGAACCACATTGGTAGAATTTCTCAAATACTTATAATTCTTTTTCTTGTTATATTGTTTTATATAGATGATGGTGGTGGAATGGACCCAGACAAAATGCTGGCAGTGCATGTCATTGGGTTATTCAGCCAAGAGCAAAGTTGCAAGTACTATTGGGCAATGTAAGCTTCGAAAAACAAATTTTATATATTTTGGTTGCTTCACTAAATTTATGTTTTCCGTAGAGCAAAATAAACTAGCAGTCTTTAAATTTGTAAGTATAAGCATGAGTCGTCTAGGTCGACAAACTTGCAAAATGCAGATTCCGTTCACTAGACTTATAAAAGTGTGCCATACTGCCGGATCTCTCCGGGAACTGACGTGGCGGCTGACTTCTACACGGTTTTGGCTGCCACATCTCTCATCTCTCTCCTTCTCATCAGTCTTCTCTTTTATCCACTCTCTTTCTCACACATACACACATCCTCTCCTCTCTCTCCATTTCTCATCAGTTATCTCTTTATCCACTCTCCCTCTCTCTCTCTCACATACACACATCCTCTCTTTCTCCATGGCAGCAGAGCATGACAGGTTGGGCTCACAATTTTTTAAACATAATTTTGCATAGTCTGCCACACCAGTGCTCAAGTGGGTTCGACTGTTTTGCACCCTATATGACACTTCAAGTTCAAGGGCTTAAATTTACATTTTGCAAATTCGTGGACCTAGATGACACCTGCCTACAAGTTTAATGCAAGCTTGTATATTTTACTCTTTTTAGTATGCTGGCCAAACTTGTGATGCCTTCAACTTAATTTGTTCTATTACAGATGGAAATGGTTTCAAGACAAGTACAATGAGACTTGGTGCTGATGTTTTAGTTTTCTCCCGTAGTGGTGGAAAAGGTGGCAAAAGGTTAAGTTACACTTCATCTTGACAAACATTTAAAAAAAATCATTTTAGAAGATGCTGCTAACATGATATGTTTACAATTCCCTAACAACCAAAATTTCTTTGGACAGATGAGCTACCAGAAAGCCTGTGTAGTTCATCAAACTTGAAAGCACCAAATGATATTTGTTCAATTTAGTTAGCAGGTCAAATTAATTTCCCTGGTGTAATGCATGGTCAAGAATTTGATTTAAATCTATATTGCATGACCATTGTGTTCTGAAAAGCAAATCCTTTTACACTGTAGGGAATGTATAATCATGAACTCTCTGCGTTTCCAGATAAATCCTTTTTAGTTAGTGTATAGTTTATATTTTTCTCCCATATGACCAACACTTAGATATTAAGTTAACCAGATTTGCTATATGGAAATGACACCATTAGTTCAATCATCAAAAGTGCTATTATGCATTATACTGAATTTATAGTTTTATCAACACAATGTGATAAGAATTGATAATTGGTGATCAAAATTTTAGTAAAATACTTTAGTTTCTTAACAGTTGAAACTTGTTCCTTTACCATTGCACAACTACATGTGGCATTTCTTTCATTATTTGTTGTGTAGTTTTGTAGTACGTGCATACAATTTTAGTTATTTTCCTTTATCAAGAAATTGAGACCTTTACTTTTCCTTTATCAAGAAATTGAGACATTTACTTTTGTTTGGCATGAAGGCTTACCCAAAGTGTTGGCATGCTATCCTACACCTTTCTGAGGAGCACCAACAAAGAGGATATTGTTGTTCCAATGGTAGGATTCCTTCTTTGGTGCTTTTCATTAGTTTCAAATTTTTAATTTTCTCTAGACCTTTTTTTGCCCTCATATAAATTTTTTTACCACCCACCTGAAGCATCCATCCTCATTTTTTTTGAATATTTATGGGAGGATACTAAAGATATTTCCTGTCATACCTTTCTCAATTTTGTCTACTCATATCATTATGCAAGTTAAAATAAACACTATAGTACTGAATGGAGGGGATACTCTTGGAAAAATATTTATCTGGAAATTAGTTATGTTGTGTGTAATGTCTTTACCTTCTGAATTTTCCTATGTTTATGTGACAAATTCAGATTGATTATGAAAATCAACAAGGTTGGAAAAGAAAGCCACGGACTACATTTGCTGATTGGAACACAAGCTTACAGACTATTATTACATGGTCGCCATATTCAACTGAAGCAGAACTACTTGAGCAGGTATAATTTATGCAAGATCACTAAACAAATATGTATTTCTACTGTAATTATCAACATGATTATTGGTTCAGTTGCTTGAAGTTTCTTTGTCATGACCTTTCCTTTCAAAAGAAAAGGGCATCTGTGCATACTCGACAATGGAAGATGTTTCCTGGAGCTGTCTATATTTTATTTTCCCATTTTTAGAAACAAAAACATATTATTGCGAACCTCAGCACGTTCCAAATGGCTGTTTATTTTGCAGTTTAGTTCTATAAAGGAACAAGGGACTCGTATTATCATTTACAATCTTTGGGAGGACGATGAAGGACATTTGGAGCTTGAT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