BGIOSGA016408
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA016408 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016408, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_15883 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016408-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016408-PA |
| Length |
9330 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:18746828..18756157 |
| Sequence Coding Region |
18746828..18747241,18748003..18748148,18748540..18748637,18748714..18748908,18749003..18749130 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:18746828..18756157 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:18746828..18756157 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGAGCGACAGCGACGTCGACGAGGACGAGCTCCTCCAGATGGCGCTGCAGGAGCAGGCGGCGCGTGACCTCAGCCACCAGCGCCCCGCGGGGGCCGGGAAGCCCGTCGTCAACCTCGTCCGCCCCCCTGCCAACTCCTCCCGCGGCGGCGGCGGAGGAGGACGCGGCGGAGGGGGCCCCGCCAAGGCGAGGCAGCCCAGCCGCGGAGGCGGCGACGACGACGACGACTCCGAGGTCGAGATGCTGTCCATTTCCTCCGGGGATGAGGATGGCGCCCCCTCCTCCCGTGACCGTGGCCCCCCGCCCCCCCGCGGCGGCGGCCGCGCCGGGGCACGGCGGGCCGCGTCGAGGGATGATGGGGATTTCGACGACGACGAGCCCAGGAGCTGGAAGCGCGTCGACGAGGCCGAGCTTGCTCGCAGGGTTCGGGAAATGCGTGAAGGGGGGGCAGCTCCTACAGTTGATCAGAAAGCAGCTGCTGCAGCAACTCGGAAGGCACTTACCAATGTACAGACTTTACCTAGAGGAGTAGAAGTTCTGGACCCTTTGGGCCTTGGAGTCATTGATAATAAGTCTCTGCGATTAATTACTGATGCTTCAGTAAGTTCTCCTGTTTCAAGGGAGAAGGCTCAGGGTTTAGACCCCAGTATGCGAGAGAAAGTTATATATTCTTCTCCGAATTTTGACCCCAAGGTTTTTCTTTCGTGGGTTCACAAAGATACAAGTGCTGCTGACTTAGAGTCTGGTGCGCTTACCTTGAAAACTGATCTCAAAGGGAGAACACAGCAGAAAAAACAATTAGTCAAGGAGAACTTTGATTGTTTTGTTTCGTGCAAAACCACGATAGATGATATTGAGTCAAAGCTGAGACAGATAGAGGAAGATCCCGAAGGTGCAGGAACTGCTCACTTGTACTCAGTCACCCAGAAAATTAGTGGTGTAGCAAACCGTGCATTTGAGCCTCTATTTGAGAGGCAGGCCCAAGCTGAGAAGATCAGATCTGTTCAAGGAATGCTTCAGAGATTCCGGACATTATTTAACCTGCCAAGTGCAATTCGTGGGAACATTAGAAAAGGAGAATATGACCTAGCTGTCAGGGAGTACCAGAAAGCTAAATCTATTGTTCTTCCTTCTCATGTGGGGATACTAAAACGTGTACTTGAGGAAGTGGAAAAGGTAATGCAGGAATTCAGAGGCATGCTTTACAAGTCAATGGAGGATCCTCATCTTGACCTCGCTGAGTTCTATCTGCCTCCTGATTTTCTTGCCAACTGCCAGCTTGAGAACATTGTTCGGCTACTGTTGGAGTTGGAACCTGAGACCGATCCAGTGTGGCATTATCTTAACATTCAGAATAGCAGGATCCATGGATTGTTTGAAAAATGCACCTTAGATCATGAAGCACGAATGGAGGTTCTACAGAATAAAATTCGTGAGAAAATACTATCTGATGCAAAATGGAGGCAATTGCAACAAGATTCAAATAAATCATTGGAAGTTGATTCTGCTACCGGTGACTCTTTTCAAGATGATCAACTGTCAACAAATATTATGGCTGATGAAGCTGATAGCTTAAGGGCAGCCTACATTCGTAGGTTAACTGCTGTACTTATCCAGCATGTTCCTGCATTCTGGAGATTAGCTTTATCTGTCTTCAGTGGAAAATTTGCAAAGGCAGCTGCGGGGAATGTACTTTCTGATTCTGATATGAATACAAAACAGAGTGTAAATAAGACTGATGATAAAGGTGGAGAAGCAAAGTACACAAACCATACTCTTGATGAAGTTGCTAGTATGGTTCGTGCTACTGTATCTGCTTTTGACACCAAGGTTCAGAATACTTTCCGTGATTTTGAGGAATGTAACATTCTTCGCCCGTTCATGGGTGATACTATAAAAGAAATAGCTAAGGCTTGCCTTACTCTTGAAGGGAAGGATTCATCTCCAACTGCTGTGAAAATGTTGCGGGCCCTTCATTATGAAATAACGAAGCTTTACATTCTACGACTTTGTTCATGGATGCGGGCAACAACTAAGGAGATATCGAAATATGAGACCTGGTTTACTTTAACCACCCTTGAGAGGAACAAATCTCTATATGCAATTTCAAGCATGCCCTTGGAGTTCCGTGATATCATAGTTTCGGCAATGGACCGCATTGATTTTATGGTTCTTAATCTGAGGAGTGAGACTGCCAAGTCTTACGATATTTCTCAACACCTCCATGAAATTCATGAATCTGTCAGACTTGCATTTCTAAATTCTTTTCTGGATTTTGCTGGTTATCTGGAGAGGTTTGGAGGGGAACTAGCTCAGAACAGATCAAATAAAGAAAACAACCATACCCAAAATGGATATGTAAATGGTACTAACAGTGAAACATCTGCTGGCATGGATGGGGACTTGTACAAGAAGCTGTTGGTTGTTCTGAGTAACATTGGATATTGTAAAGCTGAACTTTCAGATGAACTGTATACCAAATACAGGCACATTTGGTCCCCAGTCAGGGATAATGATGAGCGTAGTGCTGACATGCGAGATCTGATGACTTCTTTCTCAGCACTTGAGGAGAAAGTCCTGGAACAGTATACATTTGCAAAGTCGAACTTGATCAGAAATGCTGCACGAAACTATCTGTTGGATTATGGGATTCACTGGGGAGCAGCACCAGCAGTAAAGGGCATTCGAGATGCAGCTCTTGATTTACTGCACATCCTTGTAGCTGTACACGCAGAGGTCTACTCCGGTGCTAGGCCTCTGCTGGAAAAGGCGATGACAATTTTGGTAGAGGGTTTGATTGATATCTTCCTCAGTATTTTCCATGAGAATAAGACCAAAGAACTCAGAATGTTGGACGCAAATGGTTTTTGTCAGCTCATGCTTGAGCTCGAGTATTTTGAGACTATATTACGGACATACTTATCAACTGAGGCAGAGCAGGCTTTGAGATCCTTACAAGAGAATTTATTGGAGAAGGCCTGTGAAAGTGTGACTGAAGCCTTGGAGAATCCTGGACACCACCGTCGACCAACTCGTGGCAGTGAGGATGCTGCATCAGATGATAGACAATCAGTATCACCTGATGATCTGCTTGCACTTGCTCAGCAATGCAGTAGCGATTTGCTTCAAGGGGAGCTGGAGAAAACCCGGTTAAATATTGCGTGCTTTATGGAGTCAACTCTTCAATCAACGCCTGCACCGGCTGGATCAAAACCTGCTGCTTATCAGTCATACAAGGCACCTGCGACACACCAACCAGTTCAAGTGTCCTCCCCAAGTTTTAGAAGGCAGCAGACAAGTACAAATTCACCTGCAGCCTCGAGGCGGCGTCGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASDSDVDEDELLQMALQEQAARDLSHQRPAGAGKPVVNLVRPPANSSRGGGGGGRGGGGPAKARQPSRGGGDDDDDSEVEMLSISSGDEDGAPSSRDRGPPPPRGGGRAGARRAASRDDGDFDDDEPRSWKRVDEAELARRVREMREGGAAPTVDQKAAAAATRKALTNVQTLPRGVEVLDPLGLGVIDNKSLRLITDASVSSPVSREKAQGLDPSMREKVIYSSPNFDPKVFLSWVHKDTSAADLESGALTLKTDLKGRTQQKKQLVKENFDCFVSCKTTIDDIESKLRQIEEDPEGAGTAHLYSVTQKISGVANRAFEPLFERQAQAEKIRSVQGMLQRFRTLFNLPSAIRGNIRKGEYDLAVREYQKAKSIVLPSHVGILKRVLEEVEKVMQEFRGMLYKSMEDPHLDLAEFYLPPDFLANCQLENIVRLLLELEPETDPVWHYLNIQNSRIHGLFEKCTLDHEARMEVLQNKIREKILSDAKWRQLQQDSNKSLEVDSATGDSFQDDQLSTNIMADEADSLRAAYIRRLTAVLIQHVPAFWRLALSVFSGKFAKAAAGNVLSDSDMNTKQSVNKTDDKGGEAKYTNHTLDEVASMVRATVSAFDTKVQNTFRDFEECNILRPFMGDTIKEIAKACLTLEGKDSSPTAVKMLRALHYEITKLYILRLCSWMRATTKEISKYETWFTLTTLERNKSLYAISSMPLEFRDIIVSAMDRIDFMVLNLRSETAKSYDISQHLHEIHESVRLAFLNSFLDFAGYLERFGGELAQNRSNKENNHTQNGYVNGTNSETSAGMDGDLYKKLLVVLSNIGYCKAELSDELYTKYRHIWSPVRDNDERSADMRDLMTSFSALEEKVLEQYTFAKSNLIRNAARNYLLDYGIHWGAAPAVKGIRDAALDLLHILVAVHAEVYSGARPLLEKAMTILVEGLIDIFLSIFHENKTKELRMLDANGFCQLMLELEYFETILRTYLSTEAEQALRSLQENLLEKACESVTEALENPGHHRRPTRGSEDAASDDRQSVSPDDLLALAQQCSSDLLQGELEKTRLNIACFMESTLQSTPAPAGSKPAAYQSYKAPATHQPVQVSSPSFRRQQTSTNSPAASRRRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..414#1176..1321#1713..1810#1887..2081#2176..2303#2398..2556#3625..3729#3955..4065#4159..4296#4415..4597#4868..5023#5121..5244#5326..5536#6120..6235#6334..6559#6725..6818#7705..7782#8122..8178#8328..8477#8592..8798#9088..9330#ATGGCGAGCGACAGCGACGTCGACGAGGACGAGCTCCTCCAGATGGCGCTGCAGGAGCAGGCGGCGCGTGACCTCAGCCACCAGCGCCCCGCGGGGGCCGGGAAGCCCGTCGTCAACCTCGTCCGCCCCCCTGCCAACTCCTCCCGCGGCGGCGGCGGAGGAGGACGCGGCGGAGGGGGCCCCGCCAAGGCGAGGCAGCCCAGCCGCGGAGGCGGCGACGACGACGACGACTCCGAGGTCGAGATGCTGTCCATTTCCTCCGGGGATGAGGATGGCGCCCCCTCCTCCCGTGACCGTGGCCCCCCGCCCCCCCGCGGCGGCGGCCGCGCCGGGGCACGGCGGGCCGCGTCGAGGGATGATGGGGATTTCGACGACGACGAGCCCAGGAGCTGGAAGCGCGTCGACGAGGCCGAGGTATGTGGGGGGAGATCGGCGAGATCTCGATCTCGGCCGCTCGTCTTCCGTGCTAGTTTTTTGGGGGTCGAGTGCTTTGATGATCCGAAAATTTTGGTTGGTCCCGCGGGTTTGTTAAGGCAGCGAGCGGAGTAGCTTGTTATGAACATGTCAGAATCGTGGTTGAGTGCATTTAGCTAGTAGTGTAGGTTATGAAATTTATGCTGGTTTGATCAGTTTGTTTCTGTTCCTTCTGGGGATCGCACAAATTAGCTGTGGTGCTGCAGAGTGGAGTTGCTTGTTGGGTCGCCTGGGGGGGGGGATTTGGGTTAATTCCTAAGACTTGCCTATTGGTGTGAACTCTGGGTACTGGTGTGTTTCAATCATTCATGTTGTGTAGTACTATGATATATGGAGGTATAAGGGATTAATTAATGGACTTATAGACAACATTTTTACAAGTTTGCTGGTCTGACACACAATGCTTGGTCATCACATCAATTGCATTTGTGCAGCGTGCATTACTGTTGGCACACTCTTTCGGTATAGTTCATTTTGATTTCCTTCTAGCTGCACATTCGTGTTATTCAAACCTCCTCTCTCAGCTTGTTTGAAATTGAATGCCATGCTTTTCATTTTCTCTGTTGTTGCATTTGTTCATGTATCATTTCATATCTGCATTCTCCATATTAAATGTTAAATGCACCAAATACAAACTTCTGTTTTAACATGTTATCTTGTGCTGAATATGCCTAATGTCAGTCTGCCTTTGCTCCACCCAGCTTGCTCGCAGGGTTCGGGAAATGCGTGAAGGGGGGGCAGCTCCTACAGTTGATCAGAAAGCAGCTGCTGCAGCAACTCGGAAGGCACTTACCAATGTACAGACTTTACCTAGAGGAGTAGAAGTTCTGGACCCTTTGGGCCTTGGGTAACTATCTGGATCACAAAACTCATGGTCAATACATGACACGCATCATCTTCTTTTATATATTTTTTCCACATTAATGTACCACTTGACCACTTGATAAACATTTTATAAAATGCAATCACCTCATACATTGATAGTATGTTAGATAGCAAACACATTCATTGGTTCTAAAATTTTTGAAAGTGAGCTGTACGTAACCTTACTGAAACATCAAACTTTGTATTATCAATATATTTTGGCAGCAACAAGTATTAACCTCATATATATTAATAATGTCCTGCTCTGCATTACCTAGTACATGTGTGGTATGCTCTTTATCATGGAGAATTAAAATTACCAATCCAATGTCCTCTCTATATTCGTGTTTTAATAGCATTTATTTTCTTACCAGAGTCATTGATAATAAGTCTCTGCGATTAATTACTGATGCTTCAGTAAGTTCTCCTGTTTCAAGGGAGAAGGCTCAGGGTTTAGACCCCAGTATGCGAGGTATGCCTTTTGGTCATACATATTATTTCATTCTGTTATCTGTTCTTCCATAACGAGGGTATGTTTTTATTTGCAGAGAAAGTTATATATTCTTCTCCGAATTTTGACCCCAAGGTTTTTCTTTCGTGGGTTCACAAAGATACAAGTGCTGCTGACTTAGAGTCTGGTGCGCTTACCTTGAAAACTGATCTCAAAGGGAGAACACAGCAGAAAAAACAATTAGTCAAGGAGAACTTTGATTGTTTTGTTTCGTGCAAAACCACGATAGATGGTATCTGTTCCTTTTTTTTCTTCTGCTCTGTTGTAGATAATTCTCATGATCTTAATTTTTGCACCTGTTTTTAATACCGCGAGTTTTTCTGCAGATATTGAGTCAAAGCTGAGACAGATAGAGGAAGATCCCGAAGGTGCAGGAACTGCTCACTTGTACTCAGTCACCCAGAAAATTAGTGGTGTAGCAAACCGTGCATTTGAGCCTCTATTTGAGAGGCAGGTATACCAACTAAGTTTTCTCTAGAACTTCATTTCACTAATCATGGTCATTATTACTGCAATTCTTGAGTGCGGTAACGTAAACCGTTGTGCAGGCCCAAGCTGAGAAGATCAGATCTGTTCAAGGAATGCTTCAGAGATTCCGGACATTATTTAACCTGCCAAGTGCAATTCGTGGGAACATTAGAAAAGGAGAATATGACCTAGCTGTCAGGGAGTACCAGAAAGCTAAATCTATTGTTCTTCCTTCTCATGTACGTCAACTTGATTTATTTTATCTGCGTCTGTTATTTGAAGATATTAGAAGTGGTGGGAATGATGGGGATGGGTGCCAACTGATCATAGCGCACTATCTGGGGTACCGACACCCATAAAGTGAAAAACAATGTGATTTAGTGGGAACCACAATACCCATCAGGATTCTTACATTATCACCGTCTTACACTACTTCTAGTTTAGTAACACAAGAGAAACATGTACCCGTTCTTTTTATTTGATGGCTTTGACCTTTCACGGTCCAAGATGTAACTTTGACCATTAGCTATATATTGATATAGTATTATGAGAGTACCTCTCGGGTACATACCTAGTGTTACAGTTTCGTATAGCCAATCTCGAGTTCTCATGTATTGATGTTCAAAGTAACATGGGTTCTAGGATGTCAAATAAGAAAGAAAGGGTATTGTCTGACCTACAGGTAGCATGGGTTTATCAAAGTTTTAATGCGGTTGCATTAACATTTCTGTTGCCCCTGTTTTTCTTTTTGGCTATTTTGTGGGACATCCCTTAACCATTTGGAGATCATGAGAAAAGCATGAAATAGTTTTATGTTGGATTAAAAATGCGATGAAATAGATTTGTGGATTATATTCTCTTTCTTCCTTTCATGATGGCTCATATGCCTGATACATGCTATATGATTTTCTTTGTTTTCCAAGATCAATTATCGTATGCTTCTTTGTTCTTTCCTTGCACAAAAATTTTGCATATTGTTTCCTGTTCATGCCAATTTCTTGCACATGTATTTGGTAATTAATATAACATCATAATAACTAATAACATTACATGATTGATTCACACAAAGATCTAAGAAATCCATAGTTTAGATGGCTCATGCATGTCCATTACTTGATTTTATTATCTCTCTATTGTATGACTTACAAAATCTTGAGTATTTTGATGCTGGAGTAATAGGGACTAAAAATTTAACTATTGTCTTGTGACATCCCTTCTATTTTAGGCACAATACGCCACAACAAATTGTTGCTTAAGCACATCCAGTATTTTTACTATATTCTTTTTATGATGAATAACTGACACAGGTGGGGATACTAAAACGTGTACTTGAGGAAGTGGAAAAGGTAATGCAGGAATTCAGAGGCATGCTTTACAAGTCAATGGAGGATCCTCATCTTGACCTCGCTGAGGTTAGTTGACTTTCCAATATTCAATGTAGAATACTTGAAGTTCCTTACTAGTGTTGATAGTCAAATACTCAAATATCACTCAACTCGCTAATTTTGATTATAGAAATTTTGGTAGTTACATGAGGAAGTTACTTGATACCTACACGTAGGATGCTGCTGGCTGTAAACTGAACTACTGATCGCTAGTTGTTTATATTTATGCTATTTAGATACAATATGATTCAGTTCTATCTGCCTCCTGATTTTCTTGCCAACTGCCAGCTTGAGAACATTGTTCGGCTACTGTTGGAGTTGGAACCTGAGACCGATCCAGTGTGGCATTATCTTAACATTCAGGTTAACGCTCTTGACCAAAATTATCTGTGCTTTATGTCATGGCCATACTTGCTTGTACCACTACTTATATGTTCTATCTTCATATCTTCTCAGAATAGCAGGATCCATGGATTGTTTGAAAAATGCACCTTAGATCATGAAGCACGAATGGAGGTTCTACAGAATAAAATTCGTGAGAAAATACTATCTGATGCAAAATGGAGGCAATTGCAACAAGATTCAAATAAATCAGTGAGTAGTTTGGGTTCAGCATAGCACTCATTTGATCATCTACTATGATGCTACAAATTTGCATGGTATTTGCACCTTGTCTTAGTTAACATGGCACATGTTCCTTATGTTTGCATAGTTGGAAGTTGATTCTGCTACCGGTGACTCTTTTCAAGATGATCAACTGTCAACAAATATTATGGCTGATGAAGCTGATAGCTTAAGGGCAGCCTACATTCGTAGGTTAACTGCTGTACTTATCCAGCATGTTCCTGCATTCTGGAGATTAGCTTTATCTGTCTTCAGTGGAAAATTTGCAAAGGTATGAATGGGTTTAGCTTTAACATTTGTCAGATATAGTTAAGATCTTGCTCCAAAACATATGAATACATATGAACCTTTTCATCCCACCTCTTCTCATAGATTGCAATGCGTATGAAATAAGCGCCTTTTATATATTTTTTTTTCATATAGTGTATTCTGA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| External Link(s) |
