BGIOSGA017105

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA017105

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017105, complete gene.

LocusTag

OJ1112_E08.119

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA017105-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA017105-PA

Length

10467

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:30004775..30015241

Sequence Coding Region

30004775..30004889,30005033..30005226,30006232..30006353,30006433..30006491,30006806..30006834
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,30014998..30015093,30015179..30015241

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:30004775..30015241 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGGCGCCGCGGGAGGGTTCGTCACGCGGGCCTTCGAGGCCATGCTCAAGGAGTGCACAGCCAACCGCGGCAAGTTCGCCGCGCTGCAGCAATCCATCCAGTCCTACCTCGATGCCATCAAGGGGGCGGCGGCGGCGGGACAGGAGGAGGGCGGCGACGCGGCGGCGGCGCCCATCACGCAGGTGCTGGCGTCGGCGGGGCGCGTGCTGGAGGGGACTCAGGCCGAGCTGGTGCTGCAGCCGCTCCGCCTCGCCTTCGAGACCAAGCACGTCAAGCTCGTCGAGCCCGCGCTCGACTGCCTCCATAAACTTATTGCTTATGACCATCTAGAAGGCGACCCTGGTTTAGAGGGTGGTAAAAATTCCCCTCTATTTACTGACATCCTGAACATGGTCTGCGGTTGTGTTGATAACACCTCCTCTGACAGCACTGTTCTCCAAGTCTTGAAAGTGCTTCTCAATGCTGTTGCTTCAAATAGATTTAGAGAAATTGCAGTTGTCTTTTACAAAAATCCTGTTTCTGTACCACCTGCCAGCTCTGCAATGAAAGAAGAACCATCATCTAGCACAGAGGAATCAGAGAATGGTGAAGTATCCACTGGTAACCAAGCTGATGAAAAAATTACTCTTGGAGATGCGCTATCCTTGAATCGAGCTACAGAAGCATCTCCAGCATCTGTTGAAGAGCTTCAGAGTCTTGCAGGAGGAGCTGATATTAAGGGGTTGGAGGCTGTTCTTGACAAGGCTGTTGAACTTGAGGATGGAAAGAAAGTATCAGGTGGAATAGACCTGGACACTGTGAACATAATACAGCGTGATGCACTATTGCTCTTCCGGACTCTCTGCAAGATGAGCATGAAGGAAGAGAGTGATGAGGTTGCTACAAAGACAAGGCTGCTATCACTCGAACTGTTACAGGGATTGCTAGAAGGAGTCGGTGATTCATTTACCAAAAATTTCCACTTCATCGATTCAGTTAAAGCCTATCTTTCCTATGCTATTCTGCGAGCGGCTGTGTCTTCATCTGCGGTTGTTTTTCAGTACGCTTGTGGGATATTTGCAGTTCTATTGCTTCGTTTTCGAGAGAGTCTGAAGGGTGAGATCGGTGTCTTCTTTCCTCTGATAGTTTTAAGGTCTCTCGATAGCTCTGACAGTCCACTCAGCCAAAGGGCCAGTGTCCTTAGGATGCTGGAGAAAGTCTGCAAGGATTCACAAATGCTTGCAGACATGTTTGTAAATTATGATTGTGACCTTGAGGGGCCAAACCTTTTTGAACGCATGGTCAGTGCACTCTCAAGGATTGCACAAGGATCTCAAAATGCGGATACAAACACTGCCGCATCTTCTCAAACAGTTTCTGTGAAAGGCTCATCTCTTCAGTGTTTGGTGAGTATTTTGAAGTCATTGGTTGATTGGGAGCAAGCTCGAAGAGATTCCTTGAAACAGGGGAGTGTTGCCGAAGCTTGTGAAAATGATTCTTCTGCAAGGAGCATAACAAGTGATGAAATAAAGAGCCAAGAGGATGGTCGCAATCAGTTTGAGATAGCTAAAGCTCATAAGTCAACAATGGAGGCTGCAATCTCAGAGTTCAATCGCAAACCAGCAAGGGGGATTGAGTATTTGTTATTAAATAAGTTGATCGAAAATAATGCAACATCTGTAGCTCACTTTCTCAAGAGCAATTCTAGCTTGGATAAGGCTATGATTGGTGAATATTTGGGACAACATGAGGAGTTCCCTCTTGCTGTGATGCATGCTTATGTTGATTCAATGAAATTTTCGGGATTGAAGTTTGATGCTGCAATTCGTGAGTTCTTGAAAGGGTTTCGCCTTCCTGGGGAGGCACAAAAGATTGATCGCATAATGGAAAAGTTTGCTGAGCGGTACTGTGCTGATAACCCTGGACTTTTCAAAAATGCAGATACTGCTTATGTTCTTGCTTATGCTGTTATAATGTTGAATACTGACGCCCACAACCCAATGGTGTGGCCTAAAATGTCAAAATCAGATTTCGTACGAATGAACACTGCGAGTGATGCAGAGGAATGTGCCCCAAAGGAGCTCTTGGAGGAAATTTATGATTCCATTGTCCAGGAAGAGATAAAGATGAAAGACGATTTCCCTGATTCAGCAAAAACTAATAAACCCAGACGAGAAACAGAAGAAAGGGGTGTTGTCAATATCCTCAATTTAGCTCTTCCAAGACTGAAGTCAGCAAGTGATACCAAAGCAGAAAGTGAGAAAATCATTAAGCAGACTCAAGCACTTTTCAAAAATCAGGGACAGAAGAGAGGTGTTTTTCATGTTGCTCAGCAGGTCGAGCTTGTTAGGCCAATGCTTGAAGCTGTAGGATGGCCTTTGCTTGCAACATTTTCTGTTACCATGGAGGAAGGTGACAGCAAGCCTAGGGTTGTGCTATGCATGGAAGGGTTTAGGGCTGGCATCCATCTTACTCGTGTTCTTGGGATGGACACCATGCGCTATGCTTTCTTGACATCCTTAGTGCGGTTTACATTTTTGCATGCTCCTAAGGAAATGCGTAGTAAAAATGTTGAGGCTTTACGGACCCTCCTTGGCTTAGCTGACACAGATATGGATGCTTTGCAAGATACTTGGAATGCTGTTTTAGAATGTGTCTCCAGGCTTGAATATATCACTTCAAATCCTTCAATTGCTGCAACTGTTATGCAGGGATCAAATCAAATATCGAGAGAATCTGTTGTCCAGTCACTGAAAGAGTTGTCTGGGAAGCCTGCTGAACAAGTCTTTGTAAACAGTGTAAAACTACCAAGTGATTCCATTGTTGAATTCTTCACTGCTCTTTGTGGTGTTTCTGCAGAAGAACTGAAACAGACACCTGCTCGTGTCTTTAGCTTACAAAAGCTTGTCGAGATAAGCTACTATAATATGGCTCGGATACGTTTGGTGTGGGCGAGAATATGGTCTGTCTTGTCACAGCATTTTATTGCCGCTGGGAGCCACCACGAGGAGAAAGTTGCCATGTATGCAATTGACTCATTGAGGCAGCTTGGTATGAAGTACTTGGAACGTGCAGAATTGAACAAATTCACATTTCAGAATGACATATTGAAGCCTTTTGTTATTTTAATGAGAAATAGTCACAGTGAAAAAATCCGTGGTCTAATTGTTGATTGCATTGTTCAGTTGATCAAATCAAAAGTTGGCAGCATAAAGTCAGGTTGGCGTTGTGTGTTCATGATATTCACCGCGGCAGCTGATGATGAGAATGAACATATTGTTGAAAGTGCTTTTGAAAATGTAGAACAAGTTATCTTGGAGCATTTTGATCAAGTTGTTGGTGATTGCTTCATGGACTGCGTCAACTGTCTTATTGGTTTCGCAAATAATAAATGCACACCTCGAATTAGTTTAAAGGCTATCGCTCTCCTACGCATATGTGAAGACCGTTTGGCAGAGGGTTGCATTCCTGGTGGTGCTGTTAAACCTGTTGATGATGTTCCAGAGGCCCATTTTGATGTTACTGAGCATTATTGGTTTCCTATGCTAGCTGGCCTATCAGATTTAACTTTAGACCCCAGACCAGAAGTTAGACACTGTGCACTTGAAGTGTTGTTTGATCTTCTGAATGAGAGAGGTCATAAATTCTCCTCACCTTTTTGGGAGAGCATTTTTCATCGTGTACTATTTCCCATATTTGATCATGTAAGGCATGCTGGAAGGGATGGCCTTTCTTCTGGGGATGACTGGCTTCGTGATACCAGCATTCATTCTCTGCAGTTAATCTGCAACCTTTTCAATACTTTCTACAAGGAGGTGTCATTTATGCTTCCACCTCTTTTGGGCTTGCTGCTTGAGTGTGCCAAGAAAACAGACCAGACTGTTGTTTCAATTGCTCTTGGAGCTTTAGTTCATCTCATAGAGGTTGGTGGTCACCAATTCAGTGACAGCGACTGGGAAACACTTCTAAAGAGCATTAGAGATGCATCATACACAACCCAACCTCTCGAACTCCTCAATTCAGTAGGATTTCAGAAACCAAACAATCAGCAATCACTTTCAAGAGAAGCAGAGACCAACGGTCTTGGTAGTAGTTACCATGATAGCAGGGAAGGAGGAGCTTCAATAAGTCATATTGATGAACAGGATGGTCATCAGGAAACAAATGCACAGACTAGCCTAGACAATTCAGAAGGTTTGCCATCTCCATCAGGGAGAGCACAACCTGCAGTTTCCCCACGGGGTCAGACCTTTGGACAAAGAATTATGGGGAATATGATGGACAATCTTTTGGTCAGGAGTCTTACTTCCAAATCAAAAGGTCGTACAGACGATATTGTGCCACCCTCACCTGTGAAGGCACCTGATGCTGACGGGGCTGACAAAACTGACGATGAAGAGAATCCTATGATGGAGACTGTTAGGAGTAAATGTATCACTCAATTACTGCTACTTGGGGCCATTGACAGCATACAGAAGAGGTACTGGAGCAGGCTAAAAACCACACAGCAGACTGCAATAATGGATATTTTGCTATCACTCCTAGAATTTGCTTCTTCCTATAACTCAACTTCAAATCTTCGAACCAGGATGCACCATATACCCCCAGAAAGGCCTCCACTGAATCTTCTTCGCCAGGAACTAGCTGGAACTGCTATCTATTTGGAGATTCTTCAGAAATCAACTGTGGAACATGATGGGAATGACCCAAGTGAGGATACAAATGGGCACGTCATAGAATCTGATGAACATGAAAAGCTCAAGAGCCTCGCAGAAGGGAAGCTTGTTTCGTTTTGTGGGCAGATCTTGAAAGATGCTTCTGATCTCCAGCCAAGCACTGGGGAAGCTGCAAGTGCAGACATACACCGTGTACTGGACCTAAGAGCACCAGTTATTGTCAAGGTTTTGAATGGAATGTGTATCATGGACGCTCAGATATTCAAGAAGCACATCAGAGAGTTCTATCCATTAATTACAAAACTTATCTGCTGTGATCAGATGGATGTTCGTGGTGCCCTTGGTGACCTTTTCAGCAAACAACTTACCCCACTCATGCCCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAGAAGGFVTRAFEAMLKECTANRGKFAALQQSIQSYLDAIKGAAAAGQEEGGDAAAAPITQVLASAGRVLEGTQAELVLQPLRLAFETKHVKLVEPALDCLHKLIAYDHLEGDPGLEGGKNSPLFTDILNMVCGCVDNTSSDSTVLQVLKVLLNAVASNRFREIAVVFYKNPVSVPPASSAMKEEPSSSTEESENGEVSTGNQADEKITLGDALSLNRATEASPASVEELQSLAGGADIKGLEAVLDKAVELEDGKKVSGGIDLDTVNIIQRDALLLFRTLCKMSMKEESDEVATKTRLLSLELLQGLLEGVGDSFTKNFHFIDSVKAYLSYAILRAAVSSSAVVFQYACGIFAVLLLRFRESLKGEIGVFFPLIVLRSLDSSDSPLSQRASVLRMLEKVCKDSQMLADMFVNYDCDLEGPNLFERMVSALSRIAQGSQNADTNTAASSQTVSVKGSSLQCLVSILKSLVDWEQARRDSLKQGSVAEACENDSSARSITSDEIKSQEDGRNQFEIAKAHKSTMEAAISEFNRKPARGIEYLLLNKLIENNATSVAHFLKSNSSLDKAMIGEYLGQHEEFPLAVMHAYVDSMKFSGLKFDAAIREFLKGFRLPGEAQKIDRIMEKFAERYCADNPGLFKNADTAYVLAYAVIMLNTDAHNPMVWPKMSKSDFVRMNTASDAEECAPKELLEEIYDSIVQEEIKMKDDFPDSAKTNKPRRETEERGVVNILNLALPRLKSASDTKAESEKIIKQTQALFKNQGQKRGVFHVAQQVELVRPMLEAVGWPLLATFSVTMEEGDSKPRVVLCMEGFRAGIHLTRVLGMDTMRYAFLTSLVRFTFLHAPKEMRSKNVEALRTLLGLADTDMDALQDTWNAVLECVSRLEYITSNPSIAATVMQGSNQISRESVVQSLKELSGKPAEQVFVNSVKLPSDSIVEFFTALCGVSAEELKQTPARVFSLQKLVEISYYNMARIRLVWARIWSVLSQHFIAAGSHHEEKVAMYAIDSLRQLGMKYLERAELNKFTFQNDILKPFVILMRNSHSEKIRGLIVDCIVQLIKSKVGSIKSGWRCVFMIFTAAADDENEHIVESAFENVEQVILEHFDQVVGDCFMDCVNCLIGFANNKCTPRISLKAIALLRICEDRLAEGCIPGGAVKPVDDVPEAHFDVTEHYWFPMLAGLSDLTLDPRPEVRHCALEVLFDLLNERGHKFSSPFWESIFHRVLFPIFDHVRHAGRDGLSSGDDWLRDTSIHSLQLICNLFNTFYKEVSFMLPPLLGLLLECAKKTDQTVVSIALGALVHLIEVGGHQFSDSDWETLLKSIRDASYTTQPLELLNSVGFQKPNNQQSLSREAETNGLGSSYHDSREGGASISHIDEQDGHQETNAQTSLDNSEGLPSPSGRAQPAVSPRGQTFGQRIMGNMMDNLLVRSLTSKSKGRTDDIVPPSPVKAPDADGADKTDDEENPMMETVRSKCITQLLLLGAIDSIQKRYWSRLKTTQQTAIMDILLSLLEFASSYNSTSNLRTRMHHIPPERPPLNLLRQELAGTAIYLEILQKSTVEHDGNDPSEDTNGHVIESDEHEKLKSLAEGKLVSFCGQILKDASDLQPSTGEAASADIHRVLDLRAPVIVKVLNGMCIMDAQIFKKHIREFYPLITKLICCDQMDVRGALGDLFSKQLTPLMP</aaseq>

Gene Sequence

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