BGIOSGA017146
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA017146 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017146, complete gene. |
| LocusTag |
H0714H04.7 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017146-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017146-PA |
| Length |
7482 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:30549568..30557049 |
| Sequence Coding Region |
30549568..30549728,30550311..30550397,30550478..30550553,30550659..30550733,30550821..30550874 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:30549568..30557049 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:30549568..30557049 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTGTTGTGTAAGGTATATTTGTTTGATTCAGCGGTCATCTTGCTATTTCTTTCAGGTGGATACTATTTTAGACAAGGAAAATTTCAAGTTGGAGGACCTTCTTGATGAGGATGAAATAATCCAGGAGTGCAAAGCACTAAACACCCGCCTAATCAATTTTCTGCGGGACAAAGTTCAAGTGGAGCAATTACTCCACTACATTGTCGAAGAGGCACCTGAAGATGCTGAAAAGAAGAGGATATTTCGATTTCCTTTTGTAGCTTGTGAAATATTTACATGTGAAGTGGATGTCATAATGAAGACATTAGTGGAGAATGAAGATCTCATGGACTTGCTTTTCTCCTACTTAAAACCTGACCGACCTCATGGGACACTGTTGGCTGGTTACTTTTGTAAGGTCGTGATTTGCTTGATGCTGAGGAAGACTCTCCCATTCGTCAATTATGTGCAGGGCCATCCTGAAATAGTTAGCCAACTTGTTGACCTTATTGGTATAACTTCTATAATGGAGGTGTTGATCCGCTTGATCGGTGCTGATGAAACTATGTATTCTGGTTATGTTGACTCAATGCAATGGTTGGATGACATAAAGGTCCTTGAGATGATTGTTGACAAGTTCAGTTCATCTGATTCTCCTGAGGTTCATGCAAACGCTGCTGAAATCCTTTGTGCGATAACTAGATATGCCCCACCAGCGCTTGCTACAAAAATATCCAGTGCAAGTTTTGTGGCGAGACTATTTCACCATGCTTTTGAAGATTCAAGGCCTAAATCGGTGTTGGTCCACTCATTGTCAGTGTGCATATCTTTGTTGGATCCTAAGAGACTTGTATTAGCTTCCTACCAAGTTTTCCGTAGTCAACTAAGCCATGCAACATTGGTCACTGCAAGTCCAGAGACAGTTGGTGGCATGCTGGATAGCCTAGGTGATTTGTTGAAGCTGCTGGATGTTTCATCTGCTGAAAATGTTCTGCCAACGACATATGGAGTCTTACAACCTCCTCTAGGAAAGCACCGCTTGAAGATTGTAGAGTTCATCTCCGTCCTGCTCTCAATTGGAAGTGAAGCTGCTGAAATTCGATTGATCCATCTAGGAGCAATCAAGCGTGTCATAGATCTATTTTTTGAGTACCCTTTTAACAACTTTTTGCACCACCATGTGGAGAGCATCATCAGTTCTTGTTTAGATAGTAAGCAGGATCAGCTGATCTGTCATGTTCTTGATGAGTGTAAGCTTGTTACAAGAATTTTGGAAGCTGAGAAGAACTCTGCTCTATCAATAGATTTAACTAAGCACACGGTTCCTTTGGAGGGGAGATTTACACCAAGGATCGGACTTGTTGGTCATATGACACGCATATCTAACAAACTCATTCAGCTGGCTAAGACCAACAGCATAATTCAATCACATTTGCAGCAAAATTCTGGGTGGGCTGAGTGGCATGCTGGAACCCTAACTAGGCGTAACGCAGTAGAAAATGTTTACCAGTGGGCTTGTGGCCGGCCAACAACACTGCAGGATCGAGGTAGGGACAGTGATGAAGAAGACTTTCGAGATAGGGACTACGATGTTGCTGCGCTTGCTAGCAATTTGAGTCAGGCATCTAAATATGGTATTTACAGTTATGAAGATATTGATGAGGATCAAGTACCACATGAGCGAGATGATGAGGACGTATATTTTGACGATGAATCTGCTGAAGTGGTTATTTCCTCTCTTCGTCTTGGTGATGAACATGACAGCAACTCCTTGTTTACAAATTCCAATTGGTTTGCATTTGATGAGGATAAAGCACTGAACGGCGAGGTCAACCCAGAAGCTTCCCCATCCCCAAATTCAGAGATATCTTCTCCAAATGTTGATGATGAGAATGATGAAGTCATTCTTACTGAGGGTTACAGAATGGCCGAAAGGGTTCAGAGTCACTTTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MCCVRYICLIQRSSCYFFQVDTILDKENFKLEDLLDEDEIIQECKALNTRLINFLRDKVQVEQLLHYIVEEAPEDAEKKRIFRFPFVACEIFTCEVDVIMKTLVENEDLMDLLFSYLKPDRPHGTLLAGYFCKVVICLMLRKTLPFVNYVQGHPEIVSQLVDLIGITSIMEVLIRLIGADETMYSGYVDSMQWLDDIKVLEMIVDKFSSSDSPEVHANAAEILCAITRYAPPALATKISSASFVARLFHHAFEDSRPKSVLVHSLSVCISLLDPKRLVLASYQVFRSQLSHATLVTASPETVGGMLDSLGDLLKLLDVSSAENVLPTTYGVLQPPLGKHRLKIVEFISVLLSIGSEAAEIRLIHLGAIKRVIDLFFEYPFNNFLHHHVESIISSCLDSKQDQLICHVLDECKLVTRILEAEKNSALSIDLTKHTVPLEGRFTPRIGLVGHMTRISNKLIQLAKTNSIIQSHLQQNSGWAEWHAGTLTRRNAVENVYQWACGRPTTLQDRGRDSDEEDFRDRDYDVAALASNLSQASKYGIYSYEDIDEDQVPHERDDEDVYFDDESAEVVISSLRLGDEHDSNSLFTNSNWFAFDEDKALNGEVNPEASPSPNSEISSPNVDDENDEVILTEGYRMAERVQSHF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..161#744..830#911..986#1092..1166#1254..1307#2298..2357#2488..2604#2967..3061#3181..3383#3802..3899#4163..4266#4333..4498#4566..4688#5144..5226#6111..6252#6977..7006#7123..7193#7293..7482#ATGTGTTGTGTAAGGTATATTTGTTTGATTCAGCGGTCATCTTGCTATTTCTTTCAGGTGGATACTATTTTAGACAAGGAAAATTTCAAGTTGGAGGACCTTCTTGATGAGGATGAAATAATCCAGGAGTGCAAAGCACTAAACACCCGCCTAATCAATTTGTACTATTTCTCTTTTAGAGTACTGTTTCTCTGTAGTTGTTTTCTTGTACAATTTCTATTCTGGGACACAGTTTTTCCGTTGCATTTTTTTTTCCTTCCTTGAGTTGTGATTGATCTTAGAGCGTATGCTGATATTGTTCACCAAATGGATATGTGTGACTATCTATGTTATCTATATGTACTACCAAATGTCTGCTCTGTGAATGCTGTTCATGCCTAAGATAGTAGCATATTACAGGTAAGTATATAGGAGGGAGATCCTCACTAAGCTTGGGTTAAAGTGGAGTACTGTATGATAAGTCATCGAACCTTATTTCAACCAGCTACATGAATGTTTCCTGGCATGTTTATTATCACCTTTTCTTTACATTTTTCTTACCGCAATTCTTTTTAATCTGGTGTACGACTTGTGAATAAAGGAGAGGTTATGAATGTGTGGCCAAGTGTACATACAAGAGGAATGGGCGCACATCCACAATATAGCTTTGCTAGTTGAACCACACATAAATTTAATATCCTTTAATTATATGGCACCGGAAGATGATTTGATAATGTGCTATTCATTTATTCTGGTCATTGCAGTCTGCGGGACAAAGTTCAAGTGGAGCAATTACTCCACTACATTGTCGAAGAGGCACCTGAAGATGCTGAAAAGAAGAGGATATTTCGGTATACATGGCTTATGGTTGAATAAAAAAACACTTAATGCAATCCCCACATGTGGAATTCTCACGAATTTTTGTGTGCAGATTTCCTTTTGTAGCTTGTGAAATATTTACATGTGAAGTGGATGTCATAATGAAGACATTAGTGGAGAATGAAGATGTATGTTTCATTTTAGTTTTCTTATGTTAGCTTGATACAATATTATTCTCCTATCATGGTGTACAATTATCTTGTATGACTAATGAAGCCATGCTATCTGTGCAGCTCATGGACTTGCTTTTCTCCTACTTAAAACCTGACCGACCTCATGGGACACTGTTGGCTGGTTACTTTTGTAAGGTACTTTTATGCAACCATTCACGTCTGCAAATTTTTTGTCTCAGCCTGGCTGATTAAATGGTCATTATATACTGCTACCTTTTGCAGGTCGTGATTTGCTTGATGCTGAGGAAGACTCTCCCATTCGTCAATTATGTGCAGGTTTGTGTAGTTCTGCTGTCAGTTGTCAGCTCTTCCTTTGCTCTTTTGTTCGCTCACTGTTCTCCCAAGTTAGCCTTGCCTTCATCTGTCTTTCTTATGCATTTGTATTTACTGTGAAACAGTGGTTTCTGTAGTAAGCAATTTGTGCAACAGCTATTACAGCTAACGCCATTTTGTGAAGCAATGTTTGTTCAGCTGATGTCACTTTTGGGAGAGGTGAATCTAATCCATTTAGGATATAAATTGTTTTAGGACTTAGTGACGTGCTATAAATAATCTAGAGTAATTCATTTTCAGTATAGGTTTGGAGGATAGTTGTGAGGCTACATAGGGGATGCAACTGTATTGACGCAAAGAATCCACTGAAGCGTAGACATGGAAACTCATCTTAAAGCAAGGATGAGCAATTTGGCACATGAGTGGATTAAAGGTGTGATATATGTTTAGCATTAGATTCTTCTAACGAGCAAGGATATTTGTTCAAAAGGTCTAAGAAGGACGTGGGCGTGTGGTAGAGCAACAATGCCTTGTATCTCCAAGGCTGTGCTGAAAGAATTTGCAGTTGGTCTTTGCCAAAACTTCTCATGCTGTGATTGTTTCGTTGCCATTAGCCCATTATTTACGTTCTTTCTATAAGATCCACATCCACCTATTGTTTGATGTTGTGCACGGGTGTTAAGGTATCAAATCTACATCTGGGGCTGCAACACAAATAGGTGTAGAGTATTAAAGTTGGAATCATCAAAATGACAGTTGGTCATAGAGTAGAACTAAAAACCTGTGACAGTGAACATGCACTTGTAGATGAGTTTCTCATTTGTCTCAGCTTTACACATGTTGAACATCTGAAACTCATTTTTCACATCTCTTGTAACCATTCATATTATGTTTAAAGGTTGTACTGTGGAGAGGTGAATCCATACATTGGTGTTCTGTGCATAAATATTACTTACGGATTTGATTTTTATGTGTTGCTTATTCCTGCTGCAGGGCCATCCTGAAATAGTTAGCCAACTTGTTGACCTTATTGGTATAACTTCTATAATGGAGGTTAGCTTTCTAAAGACAAATTTAAATGCCAAAAAAAAAATCATCTGTAGCTTTGGAAAGTCATGGTAACAAATAACATCACTGATTAATCGGCTTAAACAGTTTGATAGCTTGTTGGTTTGTAATGCAGGTGTTGATCCGCTTGATCGGTGCTGATGAAACTATGTATTCTGGTTATGTTGACTCAATGCAATGGTTGGATGACATAAAGGTCCTTGAGATGATTGTTGACAAGTTCAGTTCATCTGTAAGAACTAAAGATTACTTTTAGCATCTCGTCTCACTTTGTCAATCTTCTGCTTGTCTTGTTTATTGTTGCTCCAAACTATTTTAACAATAGGACCGCTGCTTGTTACTTCGTTAATTTCTGGTCAGCATGCATGCTTCCAGTTTTAACGGAAAAATAAGTTAAAACTTCCCTTGGAATTTAAATGATCAAGTACTGTCCTCAAGTACTAACTGGTTACATTCCATTCTTTTGAAGATGGCACAATTTTTATCATATTCAAATGCAGGAAGTGTTGGCTATTTATATGCTGTTCATATATAATAGAAATTTGTGGGTAATGCTTTTTTTTATTAACATACTCGTTATAACTTCTGTTGAAGGATTCTCCTGAGGTTCATGCAAACGCTGCTGAAATCCTTTGTGCGATAACTAGATATGCCCCACCAGCGCTTGCTACAAAAATATCCAGTGCAAGGTGCTTTTCCATCTGCCCATATTGCTGAAATTTTTAAGATGTGTAAAGTCTCTGGGCTTTGTGATAGCAATTTGATATTCAAAACAATTCTGTGTATCCTTTTTACTTCATGGTTGCAGTTTTGTGGCGAGACTATTTCACCATGCTTTTGAAGATTCAAGGCCTAAATCGGTGTTGGTCCACTCATTGTCAGTGTGCATATCTTTGTTGGATCCTAAGAGACTTGTATTAGCTTCCTACCAAGTTTTCCGTAGTCAACTAAGCCATGCAACATTGGTCACTGCAAGTCCAGAGACAGTTGGTGGCATGCTGGATAGCCTAGGTTAGTGGTTCCTTAAGCTGTTATGTCCATATATCTTTTCGTTTGGTGAGTCACTCTGGCTATGGTCCTTTAAAATATACATCCTTTATTGTCATTTTACATTATTTGCTGTCCACAATTAAGTCCAGCTCTTGTTGTGGATTGCTTTTATTAATTCAGAACCTTTACCTGAGTATTATTCAGGAAAGCTTTGTATCTTCATAAAATGGTGTAGCCAATGATAAGACACATATAAAACTTCTGAATACCTCTTTTGAGTAACATGTATACATTCTTCTACTATCATTTAAGCATCCTACATTCAACTATTTCTTTTAGTTCTTATGATTATAAAGTGCAAGTAACACATAAAGATGTATGCTCCAACCTCCAAGGCTAACGCACTGAAAGATCTTAATTTCTACCAATGATGTTTAAGGTGATTTGTTGAAGCTGCTGGATGTTTCATCTGCTGAAAATGTTCTGCCAACGACATATGGAGTCTTACAACCTCCTCTAGGAAAGCACCGCTTGAAGGTATGAGTGCTTAATTATATGCAGGTCTGTCGAGCCACAAAGTGCATAGATTACATGACATAACAGCGATTTGTGCCTATTTGTGTTTGCCAGCATTTTACATCGCTGTTGCACAATTATACACTTTTTTGTCTGCGAAGACCTTGAATATAAATATACTTATCCATACCATTGGTGCCAGATGTCTATTTGACCTTTGATTTCTGTTGTTTAGGTAATTGCTTTACATTTTTCATTGTTATTCTTGATGTTTTTTTTTTCAGATTGTAGAGTTCATCTCCGTCCTGCTCTCAATTGGAAGTGAAGCTGCTGAAATTCGATTGATCCATCTAGGAGCAATCAAGCGTGTCATAGATCTATTTTTTGAGTAAGTTAAATTGCAATGTTGTTTCTCATAAGTTTGTCAAGGAGCTGACATATAATTAATCATTAGGTACCCTTTTAACAACTTTTTGCACCACCATGTGGAGAGCATCATCAGTTCTTGTTTAGATAGTAAGCAGGATCAGCTGATCTGTCATGTTCTTGATGAGTGTAAGCTTGTTACAAGAATTTTGGAAGCTGAGAAGAACTCTGCTCTATCAATAGATTTAACTAAGGTACTAAATTAATATCCCACTCTTTATTTTATTAAACAATTATATTTACTTGCAATTCCCCTTTCAGCACACGGTTCCTTTGGAGGGGAGATTTACACCAAGGATCGGACTTGTTGGTCATATGACACGCATATCTAACAAACTCATTCAGCTGGCTAAGACCAACAGCATAATTCAATCACATTTGCAGGTCTGTATTCGATTATGCATAGGGAAACCTTCGTATTGTTTACATCCCCGACATGTTAGTGGTTTTATTAATGGTCCCTTGCCAATTATCTGATGGATCCCTAGACAA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