Variation ID : sbi33825262

Variation Detail



Variation ID sbi33825262
Type INDEL
Position Chr01 771-804
Ref /Alleles GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA/ G
MAF G: 0.011
5' Flank GGTCTTGACAAAATACCTTGAAAAACTTGA
3' Flank GTTGGAATAAAGAAACTTGGTGTCAGAATT

Individual Alleles

id Sample Id Type Alleles
1 101 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
2 103 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
3 107 Improved N|N
4 11 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
5 110 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
6 123 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
7 131 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
8 132 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
9 135 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
10 137 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
11 138 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
12 14 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
13 140 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
14 141 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
15 144 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
16 150 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
17 154 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
18 159 Landrace N|N
19 16 Improved N|N
20 161 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
21 167 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
22 168 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
23 170 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
24 173 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
25 175 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
26 176 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
27 182 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
28 186 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
29 190 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
30 192 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
31 194 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
32 195 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
33 197 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
34 J22 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
35 J26 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
36 J5 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
37 J50 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
38 2001 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
39 2005 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
40 2008 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
41 2009 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
42 201 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
43 2010 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
44 2016 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
45 2019 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
46 202 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
47 2021 Improved N|N
48 2023 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
49 2026 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
50 2029 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
51 2030 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
52 2031 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
53 2036 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
54 2037 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
55 2038 Improved N|N
56 2039 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
57 204 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
58 2042 Improved N|N
59 2043 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
60 2048 Improved N|N
61 2049 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
62 205 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
63 2050 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
64 2052 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
65 2054 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
66 2056 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
67 2059 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
68 206 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
69 2064 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
70 2065 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
71 2067 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
72 2068 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
73 2069 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
74 2071 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
75 2074 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
76 2075 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
77 2076 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
78 2080 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
79 2081 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
80 2082 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
81 2086 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
82 2088 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
83 260 Wild sorghum N|N
84 261 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
85 262 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
86 263 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
87 286 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
88 29 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
89 3 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
90 302546 S.propinquum G|G
91 31 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
92 32 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
93 34 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
94 346 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
95 348 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
96 353 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
97 355 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
98 357 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
99 364 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
100 367 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
101 s37 S.propinquum G|G
102 s38 S.propinquum G|G
103 370 Landrace N|N
104 377 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
105 392 Wild sorghum N|N
106 394 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
107 40 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
108 42 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
109 43 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
110 45 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
111 47 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
112 48 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
113 51 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
114 53 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
115 56 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
116 61 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
117 62 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
118 66 Landrace N|N
119 67 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
120 68 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
121 70 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
122 73 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
123 75 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
124 88 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
125 89 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
126 91 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
127 92 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
128 93 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
129 94 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
130 95 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
131 96 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
132 97 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
133 s1 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
134 s36 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
135 s2 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
136 s3 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
137 s32 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
138 s43 Weedy GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
139 s40 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
140 s41 Weedy GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
141 s39 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
142 s42 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
143 s47 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
144 s5 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
145 GW102 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
146 GW103 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
147 GW104 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
148 GW105 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
149 GW16 Landrace N|N
150 GW2 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
151 GW34 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
152 GW37 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
153 GW58 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
154 GW59 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
155 GW9 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
156 s4 Weedy GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
157 s6 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
158 s7 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
159 s8 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
160 s9 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
161 J101 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
162 J103 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
163 J112 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
164 J113 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
165 J129 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
166 J130 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
167 J136 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
168 J152 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
169 J2 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
170 J20 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
171 J4 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
172 J42 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
173 J44 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
174 J49 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
175 J52 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
176 J53 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
177 J54 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
178 J57 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
179 J59 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
180 J64 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
181 J66 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
182 J67 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
183 J69 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
184 J87 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
185 J99 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
186 s45 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
187 s11 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
188 s10 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
189 s46 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
190 s12 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
191 s13 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
192 MHMD Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
193 s14 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
194 s15 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
195 s34 Weedy GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
196 s33 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
197 s21 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
198 s16 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
199 s44 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
200 s35 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
201 s31 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
202 s17 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
203 s18 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
204 s20 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
205 s19 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
206 s22 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
207 s23 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
208 s24 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
209 s25 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
210 s26 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
211 s27 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
212 s28 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
213 s29 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
214 s30 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
215 SL25 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
216 SL105 Wild sorghum N|N
217 SL108 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
218 SL109 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
219 SL12 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
220 SL129 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
221 SL130 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
222 SL135 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
223 SL136 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
224 SL137 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
225 SL138 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
226 SL140 Wild sorghum N|N
227 SL141 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
228 SL19 Wild sorghum N|N
229 SL28 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
230 SL32 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
231 SL35 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
232 SL36 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
233 SL37 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
234 SL39 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
235 SL41 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
236 SL43 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
237 SL47 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
238 SL49 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
239 SL51 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
240 SL53 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
241 SL62 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
242 SL83 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
243 SL97 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
244 s48 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
245 Tu13 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
246 Tu14 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
247 Tu30 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
248 Tu5 Wild sorghum GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
249 WSC5 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
250 WSC15 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
251 WSC19 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
252 WSC30 Landrace N|N
253 WSC52 Landrace N|N
254 WSC6 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
255 WSC61 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
256 WSC71 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
257 WSC72 Landrace N|N
258 WSC79 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
259 WSC94 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
260 WSC99 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
261 WSC100 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
262 WSC104 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
263 WSC105 Landrace N|N
264 WSC12 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
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270 WSC24 Landrace N|N
271 WSC25 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
272 WSC29 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
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274 WSC32 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
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276 WSC38 Landrace N|N
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279 WSC54 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
280 WSC56 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
281 WSC59 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
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283 WSC70 Landrace N|N
284 WSC73 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
285 WSC81 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
286 WSC85 Improved GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
287 WSC91 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
288 WSC93 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA
289 WSC98 Landrace GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA|GATGCTCCAATCCAATAATTGTCTAGCAGCAGGA

Alleles Distribution

Gene Annotation



Variation ID Gene Consequence Transcript Type cDNA Source/target codon Protein Name protein pos source/target Amino acid
sbi33825262 Sobic.001G000100 upstream gene variant |MODIFIER Sobic.001G000100.1 mRNA Sobic.001G000100.1.p

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