Genome-to-Variants工具可将用户提交的猴痘病毒基因组序列与参照基因组进行比对，检测SNP/indel变异位点。

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Variation Annotation工具用户输入的变异位点进行功能注释，显示变异位点所在基因、密码子和氨基酸的改变。

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Genome Annotation工具可对用户提交的猴痘病毒序列进行基于VAPiD的基因注释。可以注释猴痘基因组的190个基因机器蛋白产物。

BLAST工具可对用户在线提交的核酸序列进行BLAST比对，可选择猴痘参照基因组、猴痘序列数据库、痘病毒基因组数据库。