关于

2019新型冠状病毒信息库 (原名2019nCoVR)

2019新型冠状病毒信息库整合了来自德国全球流感病毒数据库、美国国家生物技术信息中心、深圳(国家)基因库及国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)等机构公开发布的2019-nCoV基因组和蛋白质序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章等信息,开展了不同冠状病毒株的基因组序列变异分析并提供可视化展示。

如何引用

如果您有使用到任何我们网站的数据,请引用下面文献:

Song S, Ma L, Zou D, Tian D, Li C, Zhu J, Chen M, Wang A, Ma Y, Li M, Teng X, Cui Y, Duan G, Zhang M, Jin T, Shi C, Du Z, Zhang Y, Liu C, Li R, Zeng J, Hao L, Jiang S, Chen H, Han D, Xiao J, Zhang Z, Zhao W, Xue Y, Bao Y. The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2020 Dec;18(6):749-759. doi: 10.1016/j.gpb.2020.09.001. Epub 2020 Dec 28. [PMID: 33704069]
Zhao WM, Song SH, Chen ML, Zou D, Ma LN, Ma YK, Li RJ, Hao LL, Li CP, Tian DM, Tang BX, Wang YQ, Zhu JW, Chen HX, Zhang Z, Xue YB, Bao YM. The 2019 novel coronavirus resource. Yi Chuan. 2020;42(2):212–221. doi:10.16288/j.yczz.20-030 [PMID: 32102777]
Gong Z, Zhu J, Li C, Jiang S, Ma L, Tang B, Zou D, Chen M, Sun Y, Song S, Zhang Z, Xiao J, Xue Y, Bao Y, Du Z, Zhao WM: A coronavirus online analysis platform at the National Genomics Data Center. Zoological Research 2020, doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2020.065. [PMID=33045776]
Yu D, Yang X, Tang B, Pan YH, Yang J, Duan G, Zhu J, Hao ZQ, Mu H, Dai L, Hu W, Zhang M, Cui Y, Jin T, Li CP, Ma L; Language translation team, Su X, Zhang G, Zhao W, Li H. Coronavirus GenBrowser for monitoring the transmission and evolution of SARS-CoV-2. Brief Bioinform. 2022 Jan 19:bbab583. doi: 10.1093/bib/bbab583. [PMID: 35043153]

数据来源

本信息库中分析所用的全基因组序列来自CNGBdb,GenBank,GISAID,GWH和NMDC数据库,感谢“基因组序列发布动态”页面中所列的样本提供和数据递交单位。

基金支持

该数据库由国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)建设,并获得中国科学院“十三五”信息化建设专项(XXH13505-05)、中国科学院地球大数据先导A类专项(XDA19090116,XDA19050302)、中国科学院基因组科学数据中心能力建设(0202)、中国科学院青年创新促进会、中国科学院关键技术人才等项目支持。

联系我们

国家生物信息中心 (CNCB) / 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) (BIG)
国家基因组科学数据中心 (NGDC)
电子邮箱: GWH@big.ac.cn
联系地址: 北京市朝阳区北辰西路一号院104号