基因组序列
语言 / Language
| 病毒株名 | WH04 |
| 序列号 | CNA0007335 |
| 宿主 | Homo sapiens |
| 数据来源 | CNGBdb |
| 采样日期 | 2020-01-05 |
| 采样地点 | China / Hubei / Wuhan |
| 相关ID | LR757995.1,EPI_ISL_406801 |
| 谱系 | A (Version: 4.0.6) |
| 序列完整度 | Complete |
| 质量评估 | 0/0/0/3/NO |
| 样本提供单位 | BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology Co., Ltd; China CDC; Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences; Hubei Provincial Center for Disease Control and Prevention |
| 数据递交单位 | BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology Co., Ltd; China CDC; Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences; Hubei Provincial Center for Disease Control and Prevention |
| 发布时间 | 2020-01-31 06:48:13 |
| 年龄 | NA |
| 性别 | NA |
| 职业 | NA |
| 发作日期 | 2019-12-27 |
| 入院日期 | NA |
| 旅行史/接触史 | The patient stayed in a hotel near the seafood wholesale market between 2019/12/23 and 2019/12/27 |
| 严重程度 | NA |
| 病患状态 | NA |
| 临床症状及潜伏天数 | Fever |
| 临床检测 | BALF |
| 基础病史 | NA |
| 其他病原菌感染 | NA |
| 合并症 | NA |
| 临床用药和处理 | NA |
| 生理生化指标追踪 | NA |
| 出院日期 | NA |
| 相关文献 | Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. [PMID: 32007145] |
| 参考序列 | 2019-nCoV (MN908947.3) |
| 病毒株名 | WH04 (CNA0007335) |
| SNP数目 | 3 |
| Insertion数目 | 0 |
| Deletion数目 | 2 |
| Indel数目 | 0 |
| 相似度 | 99.98 |
| 质量评估分级 | A |
| 注释统计 | 5(synonymous_variant:1; intergenic_variant:3; missense_variant:1) |
| 文件下载 (GFF3) |
| 变异位点 | 参考碱基 | 碱基变化 | 基因位置密码子 | 蛋白质氨基酸变化 |
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