基因组序列
语言 / Language
| 病毒株名 | SARS-CoV-2/human/CHN/GYCDC-cx2024593A/2024 |
| 序列号 | C_AA104212.1 |
| 宿主 | Homo sapiens |
| 数据来源 | GenBase |
| 采样日期 | 2024-10-05 |
| 采样地点 | China / Sichuan / Guangyuan |
| 相关ID | |
| 谱系 | LZ.2 (Version: PUSHER-v1.30) |
| 序列完整度 | Complete |
| 质量评估 | 0/0/9/142/Yes |
| 样本提供单位 | |
| 数据递交单位 | Sichuan Center of Disease Control and Prevention |
| 发布时间 | 2025-01-20 10:11:47 |
| 参考序列 | 2019-nCoV (MN908947.3) |
| 病毒株名 | SARS-CoV-2/human/CHN/GYCDC-cx2024593A/2024 (C_AA104212.1) |
| SNP数目 | 133 |
| Insertion数目 | 1 |
| Deletion数目 | 10 |
| Indel数目 | 0 |
| 相似度 | 99.52 |
| 质量评估分级 | C |
| 注释统计 | 144(downstream_gene_variant:3; synonymous_variant:34; intergenic_variant:3; missense_variant:94; upstream_gene_variant:2; inframe_insertion:1; inframe_deletion:7) |
| 文件下载 (GFF3) |
| 变异位点 | 参考碱基 | 碱基变化 | 基因位置密码子 | 蛋白质氨基酸变化 |
|---|