EPI_ISL_19753884

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/India/DL-VRDL-AHRR59/2022
序列号 EPI_ISL_19753884
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2022-01-09
采样地点 India / Delhi / New Delhi
相关ID
谱系 BA.2.12 (Version: PUSHER-v1.23.1)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/8/78/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间 2025-03-12 03:20:15

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/India/DL-VRDL-AHRR59/2022 (EPI_ISL_19753884)
SNP数目 70
Insertion数目 1
Deletion数目 9
Indel数目 0
相似度 99.73
质量评估分级 C
注释统计 80(inframe_insertion:1; synonymous_variant:15; downstream_gene_variant:3; missense_variant:51; upstream_gene_variant:2; frameshift_variant:3; stop_gained:1; inframe_deletion:4)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_19753884.The original sequence can be obtained from GISAID's website.