2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/USA/IA-SHL-2602345/2025
序列号	EPI_ISL_19800147
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2025-03-23
采样地点	United States / Iowa
相关ID
谱系	JN.1 (Version: PUSHER-v1.23.1)
序列完整度	Complete
质量评估	0/1/9/151/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2025-03-31 03:21:30

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/USA/IA-SHL-2602345/2025 (EPI_ISL_19800147)
SNP数目	142
Insertion数目	0
Deletion数目	11
Indel数目	0
相似度	99.49
质量评估分级	C
注释统计	153(downstream_gene_variant:3; synonymous_variant:34; intergenic_variant:4; missense_variant:101; upstream_gene_variant:2; coding_sequence_variant:1; inframe_deletion:8)
文件下载 (GFF3)