EPI_ISL_418255

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Italy/ABR-IZSGC-TE4925/2020
序列号 EPI_ISL_418255
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2020-03-14
采样地点 Italy / Abruzzo
相关ID
谱系 B.1 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/2/0/9/Yes
样本提供单位 Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell'Abruzzo e del Molise "G. Caporale"
数据递交单位 Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell'Abruzzo e del Molise "G. Caporale"
发布时间 2020-03-30 15:15:46

临床信息

年龄 63
性别 F
职业 NA
发作日期 NA
入院日期 NA
旅行史/接触史 NA
严重程度 NA
病患状态 NA
临床症状及潜伏天数 NA
临床检测 Conventional nested RT-PCR
基础病史 NA
其他病原菌感染 NA
合并症 NA
临床用药和处理 NA
生理生化指标追踪 NA
出院日期 NA
相关文献 A "One-Health" approach for diagnosis and molecular characterization of SARS-CoV-2 in Italy. [PMID: 32313828]

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Italy/TE4925/2020 (EPI_ISL_418255)
SNP数目 9
Insertion数目 0
Deletion数目 1
Indel数目 0
相似度 99.97
质量评估分级 B2
注释统计 10(synonymous_variant:2; intergenic_variant:2; missense_variant:3; upstream_gene_variant:1; coding_sequence_variant:2)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_418255.The original sequence can be obtained from GISAID's website.