病毒株名 | hCoV-19/France/OCC-SC574/2020 |
序列号 | EPI_ISL_645215 |
宿主 | Homo sapiens |
数据来源 | GISAID |
采样日期 | 2020-06-05 |
采样地点 | France / Occitanie / Nîmes |
相关ID | |
谱系 | B.1.529 (Version: 4.0.6) |
序列完整度 | Complete |
质量评估 | 0/0/0/12/NO |
样本提供单位 | CHU Nîmes |
数据递交单位 | CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD |
发布时间 | 2020-11-21 21:37:38 |
参考序列 | 2019-nCoV (MN908947.3) |
病毒株名 | hCoV-19/France/OCC-SC574/2020 (EPI_ISL_645215) |
SNP数目 | 12 |
Insertion数目 | 0 |
Deletion数目 | 2 |
Indel数目 | 0 |
相似度 | 99.95 |
质量评估分级 | A |
注释统计 | 14(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:4; intergenic_variant:3; missense_variant:5; upstream_gene_variant:1) |
文件下载 (GFF3) |
变异位点 | 参考碱基 | 碱基变化 | 基因位置密码子 | 蛋白质氨基酸变化 |
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