EPI_ISL_645215

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/France/OCC-SC574/2020
序列号 EPI_ISL_645215
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2020-06-05
采样地点 France / Occitanie / Nîmes
相关ID
谱系 B.1.529 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/12/NO
样本提供单位 CHU Nîmes
数据递交单位 CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
发布时间 2020-11-21 21:37:38

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/France/OCC-SC574/2020 (EPI_ISL_645215)
SNP数目 12
Insertion数目 0
Deletion数目 2
Indel数目 0
相似度 99.95
质量评估分级 A
注释统计 14(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:4; intergenic_variant:3; missense_variant:5; upstream_gene_variant:1)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_645215.The original sequence can be obtained from GISAID's website.