EPI_ISL_678132

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Saudi Arabia/KAUST-MAKKAH1631/2020
序列号 EPI_ISL_678132
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2020-04-26
采样地点 Saudi Arabia / Makkah
相关ID OV006243.1
谱系 A (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/6/NO
样本提供单位 Pathogen Genomics Lab King Abdullah University of Science and Technology(KAUST)
数据递交单位 Pathogen Genomics Lab King Abdullah University of Science and Technology(KAUST)
发布时间 2020-12-08 21:50:53

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Saudi Arabia/KAUST-MAKKAH1631/2020 (EPI_ISL_678132)
SNP数目 6
Insertion数目 0
Deletion数目 0
Indel数目 0
相似度 99.98
质量评估分级 A
注释统计 6(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:3; missense_variant:2)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_678132.The original sequence can be obtained from GISAID's website.