2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	SARS-CoV-2/human/USA/MI-QDX-601/2020
序列号	MW064634.1
宿主	Homo sapiens
数据来源	GenBank
采样日期	2020-03-19
采样地点	United States / MI
相关ID	EPI_ISL_571336
谱系	A (Version: 2022-01-05)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/13/NO
样本提供单位
数据递交单位	Infectious Diseases, Quest Diagnostics, 33608 Ortega Hwy, San Juan Capistrano, CA 92675, USA
发布时间	2020-10-06 13:21:27

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	SARS-CoV-2/human/USA/MI-QDX-601/2020 (MW064634.1)
SNP数目	13
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.95
质量评估分级	A
注释统计	15(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:5; intergenic_variant:2; missense_variant:7)
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