在线工具 - 2019新型冠状病毒信息库

此工具可对用户输入的变异位点进行功能注释，显示变异位点所在基因、密码中和氨基酸的改变，以及对基因功能影响的程度。目前仅支持NC_045512作为reference的在线注释。同时支持bed和vcf格式的输入文件。

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#Reference	Start position	End position	Base
NC_045512	1	1	T
NC_045512	10	10	C
NC_045512	1	2	TT
NC_045512	1	2	A
NC_045512	490	490	C

*输入文件以tab隔开，第一列是reference的染色体，即NC_045512；第二列是reference的起始位置；第三列是reference的终止位置；第四列是用户研究的毒株在该位置的突变碱基。

#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT
NC_045512	1	cov1	A	T	.	.	.	GT
NC_045512	2	cov2	TA	T	.	.	.	GT
NC_045512	3	cov3	AA	T	.	.	.	GT
NC_045512	4	cov4	AG	A	.	.	.	GT
NC_045512	5	cov5	GG	A	.	.	.	GT

*输入文件以tab隔开，第一列是reference的染色体，即NC_045512；第二列是reference的位置；第三列是ID；第四列是reference上的碱基，第五列是各毒株在该位置的突变碱基。