首页
基因组序列
新冠病毒序列
冠状病毒序列
数据提交
数据下载
原始序列
基因组变异
变异数据统计
变异注释
主要株系序列变异比较
序列突变位点比较
变异群体发生率时空变化
S蛋白突变
突变谱系浏览
谱系演化树
单体型网络演化追踪
序列演化可视化
新冠病毒基因组及变异效应知识
新冠病毒基因组结构与基因功能信息
病毒潜在宿主信息
基因组突变表型知识信息
监测预警
中国近期序列监测
新冠病毒序列全局监测
奥密克戎监测
核酸引物区突变监测
高风险变体预警
临床信息
文献情报
在线工具
序列质控
基因组组装
基因组注释
变异鉴定
变异注释
BLAST比对
进化树
单体型分析
谱系和进化分析
基因组溯源
关于
科研成果
新闻报道
2019新型冠状病毒信息库
如何引用
数据来源
联系我们
语言 / Language
English
简体中文
首页
基因组序列
新冠病毒序列
冠状病毒序列
数据提交
数据下载
原始序列
基因组变异
变异数据统计
变异注释
主要株系序列变异比较
序列突变位点比较
变异群体发生率时空变化
S蛋白突变
突变谱系浏览
谱系演化树
单体型网络演化追踪
序列演化可视化
新冠病毒基因组及变异效应知识
新冠病毒基因组结构与基因功能信息
病毒潜在宿主信息
基因组突变表型知识信息
监测预警
中国近期序列监测
新冠病毒序列全局监测
奥密克戎监测
核酸引物区突变监测
高风险变体预警
临床信息
文献情报
在线工具
序列质控
基因组组装
基因组注释
变异鉴定
变异注释
BLAST比对
进化树
单体型分析
谱系和进化分析
基因组溯源
关于
科研成果
新闻报道
2019新型冠状病毒信息库
如何引用
数据来源
联系我们
语言 / Language
English
简体中文
RCoV19
2019新型冠状病毒信息库 - 变异群体发生率时空变化
首页
基因组变异
变异群体发生率时空变化
变异群体发生率时空变化
频率
默认
0.0005
0.01
0.1
0.5
按方差排序
默认
升序
降序
基因/区域名称
全部
5'UTR
Intergenic
ORF1ab
S
ORF3a
E
M
ORF6
ORF7a
ORF8
N
ORF10
3'UTR
变异类型
全部
intergenic_variant
upstream_gene_variant
start_lost
coding_sequence_variant
inframe_deletion
frameshift_variant
missense_variant
stop_gained
synonymous_variant
protein_altering_variant
inframe_insertion
-
stop_lost
stop_retained_variant
downstream_gene_variant
转录调控及酶切位点
全部
TRS:orf1ab
TRS:S
TRS:ORF3a
TRS:E
TRS:M
TRS:ORF6
TRS:ORF7a
TRS:ORF8
TRS:N
TRS:ORF10
Furin:S
变异时间变化
变异地域变化(世界)
变异地域变化(中国)
病毒株系变化(世界)
通过计算截止各时间点变异位点的群体发生频率,用热度图形式动态展示了变异位点随时间发展的变化趋势(默认显示频率大于0.05的位点,用户可根据需要自行选择不同频率的位点)。如:ORF1ab基因的11083位点,随着疫情发展其群体发生频率从0逐步增加到22%,随后递减至8%。
通过计算各国家的群体发生频率,用热度图形式动态展示了变异位点在各地区的变化趋势
通过计算中国各省市的群体发生频率,用热度图形式动态展示了变异位点在各地区的变化趋势(默认显示频率大于0.05的位点,用户可根据需要自行选择不同频率的位点)。
通过统计累计的病毒株系数,监测全球病毒株变化