2019新型冠状病毒信息库 - Spike蛋白结构(PDB_ID: 6VSB)

S蛋白突变

Spike蛋白结构(PDB_ID: 6VSB)

Spike为三聚体，如下图所示ABC三条相同链组成，分别为用蓝色，黄色，绿色显示。 此外，Spike蛋白与其受体人ACE2结合片段为residues: 336-516，3条链均有此片段，统一用青色显示。

Spike序列突变分析

突变名称	突变数目	在ACE2结合区域	是否关键互作氨基酸	基因组位置	查看结构图
2F>V	15	NO	NO	21566
2F>L	136	NO	NO	21566
2F>C	7	NO	NO	21567
2F>Y	9	NO	NO	21567
2F>S	190	NO	NO	21567
2F>L	13	NO	NO	21568
2F>L	1021	NO	NO	21568
3V>I	554	NO	NO	21569
3V>L	10	NO	NO	21569
3V>F	111	NO	NO	21569
3V>G	38751	NO	NO	21570
3V>D	4	NO	NO	21570
3V>A	260	NO	NO	21570
4F>V	6	NO	NO	21572
4F>I	178	NO	NO	21572
4F>L	51	NO	NO	21572
4F>Y	9	NO	NO	21573
4F>C	8	NO	NO	21573
4F>S	35	NO	NO	21573
4F>L	21	NO	NO	21574
4F>L	17	NO	NO	21574
5L>V	15	NO	NO	21575
5L>I	300	NO	NO	21575
5L>F	156275	NO	NO	21575
5L>R	2	NO	NO	21576
5L>H	1	NO	NO	21576
5L>P	7	NO	NO	21576
6V>L	306	NO	NO	21578
6V>I	661	NO	NO	21578
6V>F	6156	NO	NO	21578
6V>G	18	NO	NO	21579
6V>D	1	NO	NO	21579
6V>A	1330	NO	NO	21579
7L>V	19	NO	NO	21581
7L>I	64	NO	NO	21581
7L>S	22	NO	NO	21582
7L>F	52	NO	NO	21583
7L>F	27	NO	NO	21583
8L>M	64	NO	NO	21584
8L>V	437	NO	NO	21584
8L>W	33	NO	NO	21585
8L>S	7	NO	NO	21585
8L>F	211	NO	NO	21586
8L>F	1940	NO	NO	21586
9P>A	2	NO	NO	21587
9P>T	214	NO	NO	21587
9P>S	1217	NO	NO	21587
9P>R	22	NO	NO	21588
9P>Q	25	NO	NO	21588
9P>L	3538	NO	NO	21588
10L>V	89	NO	NO	21590
10L>I	118	NO	NO	21590
10L>R	3	NO	NO	21591
10L>Q	7	NO	NO	21591
10L>P	3	NO	NO	21591
11V>L	26	NO	NO	21593
11V>I	609	NO	NO	21593
11V>F	167	NO	NO	21593
11V>G	5	NO	NO	21594
11V>D	1	NO	NO	21594
11V>A	107	NO	NO	21594
12S>A	59	NO	NO	21596
12S>T	20	NO	NO	21596
12S>P	170	NO	NO	21596
12S>C	348	NO	NO	21597
12S>Y	151	NO	NO	21597
12S>F	11210	NO	NO	21597
13S>C	100	NO	NO	21599
13S>G	161	NO	NO	21599
13S>R	1	NO	NO	21599
13S>T	3593	NO	NO	21600
13S>N	170	NO	NO	21600
13S>I	34798	NO	NO	21600
13S>R	1	NO	NO	21601
13S>R	1	NO	NO	21601
14Q>E	49	NO	NO	21602
14Q>K	3969	NO	NO	21602
14Q>L	144	NO	NO	21603
14Q>R	2042	NO	NO	21603
14Q>P	3	NO	NO	21603
14Q>H	651	NO	NO	21604
14Q>H	6744	NO	NO	21604
15C>G	8	NO	NO	21605
15C>S	3	NO	NO	21605
15C>R	77	NO	NO	21605
15C>S	28	NO	NO	21606
15C>Y	61	NO	NO	21606
15C>F	582	NO	NO	21606
15C>W	7	NO	NO	21607
16V>L	170	NO	NO	21608
16V>I	307	NO	NO	21608
16V>F	4098	NO	NO	21608
16V>G	8	NO	NO	21609
16V>D	1	NO	NO	21609
16V>A	289	NO	NO	21609
17N>Y	15	NO	NO	21611
17N>D	199	NO	NO	21611
17N>H	9	NO	NO	21611
17N>I	74	NO	NO	21612
17N>S	1890	NO	NO	21612
17N>T	93	NO	NO	21612
17N>K	142	NO	NO	21613
17N>K	325	NO	NO	21613
18L>V	39	NO	NO	21614
18L>I	187	NO	NO	21614
18L>F	149714	NO	NO	21614
18L>R	2429	NO	NO	21615
18L>H	27	NO	NO	21615
18L>P	885	NO	NO	21615
19T>S	66	NO	NO	21617
19T>A	445	NO	NO	21617
19T>P	3267	NO	NO	21617
19T>R	2304983	NO	NO	21618
19T>K	403	NO	NO	21618
19T>I	3197584	NO	NO	21618
20T>S	23	NO	NO	21620
20T>A	345	NO	NO	21620
20T>P	153	NO	NO	21620
20T>S	109	NO	NO	21621
20T>N	73155	NO	NO	21621
20T>I	9476	NO	NO	21621
21R>G	974	NO	NO	21623
21R>T	230514	NO	NO	21624
21R>K	833	NO	NO	21624
21R>I	4761	NO	NO	21624
21R>S	76	NO	NO	21625
21R>S	123	NO	NO	21625
22T>S	44	NO	NO	21626
22T>A	111	NO	NO	21626
22T>P	48	NO	NO	21626
22T>S	9	NO	NO	21627
22T>N	4113	NO	NO	21627
22T>I	9277	NO	NO	21627
23Q>E	51	NO	NO	21629
23Q>K	152	NO	NO	21629
23Q>L	184	NO	NO	21630
23Q>R	458	NO	NO	21630
23Q>P	445	NO	NO	21630
23Q>H	720	NO	NO	21631
23Q>H	109	NO	NO	21631
24L>V	30	NO	NO	21632
24L>I	32	NO	NO	21632
24L>S	2787	NO	NO	21633
24L>F	25	NO	NO	21634
24L>F	132	NO	NO	21634
25P>A	13	NO	NO	21635
25P>T	2163	NO	NO	21635
25P>S	5655	NO	NO	21635
25P>R	25	NO	NO	21636
25P>H	242	NO	NO	21636
25P>L	1242	NO	NO	21636
26P>A	7	NO	NO	21638
26P>T	256	NO	NO	21638
26P>S	83233	NO	NO	21638
26P>R	208	NO	NO	21639
26P>H	1851	NO	NO	21639
26P>L	3757	NO	NO	21639
27A>P	67	NO	NO	21641
27A>T	475	NO	NO	21641
27A>S	15193	NO	NO	21641
27A>G	47	NO	NO	21642
27A>E	63	NO	NO	21642
27A>V	3070	NO	NO	21642
28Y>D	30	NO	NO	21644
28Y>N	77	NO	NO	21644
28Y>H	1682	NO	NO	21644
28Y>F	118	NO	NO	21645
28Y>C	24	NO	NO	21645
28Y>S	23	NO	NO	21645
29T>S	160	NO	NO	21647
29T>A	11581	NO	NO	21647
29T>P	3	NO	NO	21647
29T>S	56	NO	NO	21648
29T>N	110	NO	NO	21648
29T>I	8278	NO	NO	21648
30N>Y	56	NO	NO	21650
30N>D	82	NO	NO	21650
30N>H	251	NO	NO	21650
30N>I	81	NO	NO	21651
30N>S	363	NO	NO	21651
30N>T	31	NO	NO	21651
30N>K	102	NO	NO	21652
30N>K	169	NO	NO	21652
31S>A	16	NO	NO	21653
31S>T	2	NO	NO	21653
31S>P	446	NO	NO	21653
31S>C	2	NO	NO	21654
31S>Y	38	NO	NO	21654
31S>F	3626	NO	NO	21654
32F>V	82	NO	NO	21656
32F>I	10	NO	NO	21656
32F>L	581	NO	NO	21656
32F>C	17	NO	NO	21657
32F>Y	93	NO	NO	21657
32F>S	207	NO	NO	21657
32F>L	156	NO	NO	21658
32F>L	184	NO	NO	21658
33T>S	483	NO	NO	21659
33T>A	193	NO	NO	21659
33T>P	3	NO	NO	21659
33T>R	24	NO	NO	21660
33T>K	162	NO	NO	21660
33T>I	6303	NO	NO	21660
34R>G	33	NO	NO	21662
34R>S	7	NO	NO	21662
34R>C	101	NO	NO	21662
34R>P	111	NO	NO	21663
34R>H	51	NO	NO	21663
34R>L	287	NO	NO	21663
35G>R	161	NO	NO	21665
35G>S	264	NO	NO	21665
35G>C	93	NO	NO	21665
35G>A	22	NO	NO	21666
35G>D	3	NO	NO	21666
35G>V	559	NO	NO	21666
36V>L	31	NO	NO	21668
36V>I	643	NO	NO	21668
36V>F	11427	NO	NO	21668
36V>G	1	NO	NO	21669
36V>D	1	NO	NO	21669
36V>A	55	NO	NO	21669
37Y>N	1	NO	NO	21671
37Y>H	17	NO	NO	21671
37Y>F	7	NO	NO	21672
37Y>C	9	NO	NO	21672
37Y>S	3	NO	NO	21672
38Y>D	2	NO	NO	21674
38Y>N	6	NO	NO	21674
38Y>H	24	NO	NO	21674
38Y>F	8	NO	NO	21675
38Y>C	3	NO	NO	21675
39P>A	2	NO	NO	21677
39P>T	19	NO	NO	21677
39P>S	107	NO	NO	21677
39P>R	2	NO	NO	21678
39P>H	23	NO	NO	21678
39P>L	69	NO	NO	21678
40D>H	1	NO	NO	21680
40D>N	10	NO	NO	21680
40D>Y	8	NO	NO	21680
40D>V	1	NO	NO	21681
40D>G	9	NO	NO	21681
40D>A	2	NO	NO	21681
40D>E	7	NO	NO	21682
40D>E	22	NO	NO	21682
41K>E	45	NO	NO	21683
41K>Q	12	NO	NO	21683
41K>I	19	NO	NO	21684
41K>R	125	NO	NO	21684
41K>T	9	NO	NO	21684
41K>N	88	NO	NO	21685
41K>N	59	NO	NO	21685
42V>L	4	NO	NO	21686
42V>I	170	NO	NO	21686
42V>F	56	NO	NO	21686
42V>G	2	NO	NO	21687
42V>D	1	NO	NO	21687
42V>A	3	NO	NO	21687
43F>V	4	NO	NO	21689
43F>I	4	NO	NO	21689
43F>L	5	NO	NO	21689
43F>C	3	NO	NO	21690
43F>Y	46	NO	NO	21690
43F>S	6	NO	NO	21690
43F>L	36	NO	NO	21691
43F>L	4	NO	NO	21691
44R>G	3	NO	NO	21692
44R>T	6	NO	NO	21693
44R>K	26	NO	NO	21693
44R>I	11	NO	NO	21693
44R>S	12	NO	NO	21694
44R>S	1	NO	NO	21694
45S>A	46	NO	NO	21695
45S>T	10	NO	NO	21695
45S>P	49	NO	NO	21695
45S>C	1	NO	NO	21696
45S>Y	34	NO	NO	21696
45S>F	416	NO	NO	21696
46S>A	171	NO	NO	21698
46S>T	20	NO	NO	21698
46S>P	98	NO	NO	21698
46S>L	386	NO	NO	21699
47V>L	44	NO	NO	21701
47V>I	272	NO	NO	21701
47V>F	420	NO	NO	21701
47V>G	13	NO	NO	21702
47V>D	4	NO	NO	21702
47V>A	87	NO	NO	21702
48L>V	31	NO	NO	21704
48L>I	25	NO	NO	21704
48L>S	15	NO	NO	21705
48L>F	6	NO	NO	21706
48L>F	2	NO	NO	21706
49H>D	12	NO	NO	21707
49H>N	44	NO	NO	21707
49H>Y	10786	NO	NO	21707
49H>L	95	NO	NO	21708
49H>R	27	NO	NO	21708
49H>P	5	NO	NO	21708
49H>Q	35	NO	NO	21709
49H>Q	12	NO	NO	21709
50S>A	56	NO	NO	21710
50S>T	60	NO	NO	21710
50S>P	132	NO	NO	21710
50S>L	220861	NO	NO	21711
51T>S	18	NO	NO	21713
51T>A	116	NO	NO	21713
51T>P	8	NO	NO	21713
51T>S	22	NO	NO	21714
51T>N	21	NO	NO	21714
51T>I	6257	NO	NO	21714
52Q>E	45	NO	NO	21716
52Q>K	361	NO	NO	21716
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52Q>R	4913	NO	NO	21717
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52Q>H	116417	NO	NO	21718
53D>H	5	NO	NO	21719
53D>N	552	NO	NO	21719
53D>Y	3	NO	NO	21719
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53D>G	44	NO	NO	21720
53D>A	11	NO	NO	21720
53D>E	18	NO	NO	21721
53D>E	231	NO	NO	21721
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54L>M	11	NO	NO	21722
54L>W	22	NO	NO	21723
54L>S	84	NO	NO	21723
54L>F	1898	NO	NO	21724
54L>F	8634	NO	NO	21724
55F>V	3	NO	NO	21725
55F>I	2	NO	NO	21725
55F>L	16	NO	NO	21725
55F>C	4	NO	NO	21726
55F>Y	55	NO	NO	21726
55F>S	2	NO	NO	21726
55F>L	10	NO	NO	21727
55F>L	10	NO	NO	21727
56L>V	66	NO	NO	21728
56L>I	14	NO	NO	21728
56L>S	16	NO	NO	21729
56L>F	12	NO	NO	21730
56L>F	1	NO	NO	21730
57P>A	3	NO	NO	21731
57P>T	7	NO	NO	21731
57P>S	93	NO	NO	21731
57P>R	12	NO	NO	21732
57P>H	20	NO	NO	21732
57P>L	15	NO	NO	21732
58F>V	8	NO	NO	21734
58F>I	4	NO	NO	21734
58F>L	56	NO	NO	21734
58F>C	8	NO	NO	21735
58F>Y	77	NO	NO	21735
58F>S	24	NO	NO	21735
58F>L	21	NO	NO	21736
58F>L	19	NO	NO	21736
59F>V	8	NO	NO	21737
59F>I	33	NO	NO	21737
59F>L	3006	NO	NO	21737
59F>C	11	NO	NO	21738
59F>Y	141	NO	NO	21738
59F>S	7311	NO	NO	21738
59F>L	71	NO	NO	21739
59F>L	20	NO	NO	21739
60S>A	115	NO	NO	21740
60S>T	37	NO	NO	21740
60S>P	1442	NO	NO	21740
60S>C	81	NO	NO	21741
60S>Y	18	NO	NO	21741
60S>F	193	NO	NO	21741
61N>Y	7	NO	NO	21743
61N>D	58	NO	NO	21743
61N>H	7	NO	NO	21743
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1265L>R	85	NO	NO	25356
1265L>H	13	NO	NO	25356
1265L>P	557	NO	NO	25356
1266K>E	69	NO	NO	25358
1266K>Q	45	NO	NO	25358
1266K>I	6	NO	NO	25359
1266K>R	4130	NO	NO	25359
1266K>T	19	NO	NO	25359
1266K>N	106	NO	NO	25360
1266K>N	110	NO	NO	25360
1267G>R	838	NO	NO	25361
1267G>R	7	NO	NO	25361
1267G>A	7	NO	NO	25362
1267G>E	306	NO	NO	25362
1267G>V	418	NO	NO	25362
1268V>L	5	NO	NO	25364
1268V>I	310	NO	NO	25364
1268V>F	35	NO	NO	25364
1268V>G	9	NO	NO	25365
1268V>D	5	NO	NO	25365
1268V>A	230	NO	NO	25365
1269K>E	7	NO	NO	25367
1269K>Q	4	NO	NO	25367
1269K>T	1	NO	NO	25368
1269K>R	4	NO	NO	25368
1269K>N	5	NO	NO	25369
1270L>V	6	NO	NO	25370
1270L>I	2	NO	NO	25370
1270L>S	33	NO	NO	25371
1270L>F	2	NO	NO	25372
1270L>F	2	NO	NO	25372
1271H>D	4	NO	NO	25373
1271H>N	10	NO	NO	25373
1271H>Y	73	NO	NO	25373
1271H>L	1	NO	NO	25374
1271H>R	5	NO	NO	25374
1271H>P	6	NO	NO	25374
1271H>Q	2	NO	NO	25375
1272Y>D	160	NO	NO	25376
1272Y>N	2	NO	NO	25376
1272Y>H	168	NO	NO	25376
1272Y>F	99	NO	NO	25377
1272Y>C	13	NO	NO	25377
1273T>S	26	NO	NO	25379
1273T>A	35	NO	NO	25379
1273T>P	11	NO	NO	25379
1273T>R	8	NO	NO	25380
1273T>I	1021	NO	NO	25380
1273T>K	17	NO	NO	25380

突变位点在蛋白结构上的标注

突变株数最高的三个位点已在图一中标出。为更清晰的展示其它突变位点，我们在spike蛋白A链三维结构各个角度截图展示。(ABC三个链序列相同，但在三级结构上看有些许差异)