April 2025 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
S | M | T | W | T | F | S |
30 | 31 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 |
13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 |
20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 |
27 | 28 | 29 | 30 | 1 | 2 | 3 |
4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
April 2025 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
S | M | T | W | T | F | S |
30 | 31 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 |
13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 |
20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 |
27 | 28 | 29 | 30 | 1 | 2 | 3 |
4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
此表中的所有统计是基于与2019-nCoV (MN908947.3)序列的比较分析鉴定
采样日期 | 病毒株名 | SNP数目 | Insertion数目 | Deletion数目 | 相似度 | 氨基酸数目 | 最后更新 | 文件下载 (GFF3) | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NULL | NC_004718.3 | 5854 | 28 | 37 | 11 | 80.12 | NULL | 5930(intergenic_variant:23; protein_altering_variant:6; inframe_insertion:11; downstream_gene_variant:22; synonymous_variant:3661; missense_variant:2081; upstream_gene_variant:28; frameshift_variant:34; stop_gained:48; stop_gained,protein_altering_variant | 1638 | 2020-02-25 18:31:14 | 2019-nCoV_SARS-Cov_variants.gff3 |
NULL | MG772933.1 | 3499 | 7 | 17 | 8 | 88.17 | NULL | 3531(intergenic_variant:23; protein_altering_variant:5; inframe_insertion:4; downstream_gene_variant:15; synonymous_variant:2611; missense_variant:834; upstream_gene_variant:10; frameshift_variant:14; stop_gained:10; inframe_deletion:5) | 698 | 2020-02-25 18:31:14 | 2019-nCoV_bat-SL-CoVZC45_variants.gff3 |
2027-07-29 | Madrid-c10.2 (OZ224239.1) | 6 | 0 | 2 | 0 | 99.97 | A | 8(synonymous_variant:2; intergenic_variant:2; missense_variant:4) | 4 | 2025-04-02 03:07:50 | 2019-nCoV_OZ224239.1_variants.gff3 |
2025-03-23 | hCoV-19/USA/IA-SHL-2602345/2025 (EPI_ISL_19800147) | 142 | 0 | 11 | 0 | 99.49 | C | 153(downstream_gene_variant:3; synonymous_variant:34; intergenic_variant:4; missense_variant:101; upstream_gene_variant:2; coding_sequence_variant:1; inframe_deletion:8) | 95 | 2025-03-31 09:49:22 | 2019-nCoV_EPI_ISL_19800147_variants.gff3 |
2025-03-23 | 2602345 (PV393113.1) | 142 | 0 | 11 | 0 | 99.49 | C | 153(downstream_gene_variant:3; synonymous_variant:34; intergenic_variant:4; missense_variant:101; upstream_gene_variant:2; coding_sequence_variant:1; inframe_deletion:8) | 95 | 2025-03-28 05:06:21 | 2019-nCoV_PV393113.1_variants.gff3 |
变异位点 | 参考碱基 | 碱基变化 | 基因位置密码子 | 蛋白质氨基酸变化 |
---|
变异位点 | 参考碱基 | 碱基变化 | 基因位置密码子 | 蛋白质氨基酸变化 |
---|---|---|---|---|
No data available in table |
变异总数 | 突变密集区间 | Gap | 样本级别 |
---|---|---|---|
<=15 | 无 | 中间最多有两个deletion,且最长的deletion<=30bp | A |
<=15 | 无 | 其他 | B1 |
<=15 | >=1 | B2 | |
>15 | C |