Characterization of insect-specific Culex flavivirus (Flaviviridae) nucleotide sequences in mosquitoes from urban parks in São Paulo, Brazil.
Thaís de Moura Coletti, Camila Malta Romano, Paulo Roberto Urbinatti, Renildo Souza Teixeira, Leila Weiss de Almeida Pedrosa, Marcello Schiavo Nardi, Delsio Natal, Antônio Charlys da Costa, Jaqueline Goes de Jesus, Ingra Morales Claro, Ester Cerdeira Sabino, Steven S Witkin, Mauro Toledo Marrelli, Licia Natal Fernandes
Author Information
Thaís de Moura Coletti: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, Laboratório de Investigação Médica-49, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Camila Malta Romano: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Paulo Roberto Urbinatti: Universidade de São Paulo, Faculdade de Saúde Pública, Departamento de Epidemiologia, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Renildo Souza Teixeira: Prefeitura de São Paulo, Centro de Controle de Zoonoses, Laboratório de Fauna Sinantrópica, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Leila Weiss de Almeida Pedrosa: Secretaria do Verde e Meio Ambiente, Divisão da Fauna Silvestre, Coordenadoria de Gestão de Parques e Biodiversidade, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Marcello Schiavo Nardi: Secretaria do Verde e Meio Ambiente, Divisão da Fauna Silvestre, Coordenadoria de Gestão de Parques e Biodiversidade, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Delsio Natal: Universidade de São Paulo, Faculdade de Saúde Pública, Departamento de Epidemiologia, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Antônio Charlys da Costa: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Jaqueline Goes de Jesus: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, Laboratório de Investigação Médica-46, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Ingra Morales Claro: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, Laboratório de Investigação Médica-46, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Ester Cerdeira Sabino: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, Laboratório de Investigação Médica-46, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Steven S Witkin: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Mauro Toledo Marrelli: Universidade de São Paulo, Faculdade de Saúde Pública, Departamento de Epidemiologia, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
Licia Natal Fernandes: Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, Laboratório de Investigação Médica-49, São Paulo, SP, Brasil. ORCID
BACKGROUND: Despite their worldwide occurrence, the distribution and role of insect-specific flaviviruses (ISFs) remain unclear. METHODS: We evaluated the presence of ISFs in mosquitoes collected in São Paulo, Brazil, using reverse transcription and semi-nested polymerase chain reaction (PCR). Some of the positive samples were subjected to nanopore sequencing. RESULTS: Twelve mosquito pools (2.8%) tested positive for flavivirus infection. Nanopore sequencing was successfully performed on six samples. Phylogenetic analysis grouped these sequences into genotype 2 of Culex flavivirus (CxFV). CONCLUSIONS: The identification of CxFV genotype 2 at new locations in São Paulo highlights the importance of understanding the role of ISFs in mosquito vector competence.
