Variation Detail
Variation ID | sbi33825346 |
Type | INDEL |
Position | Chr01 9907-9928 |
Ref /Alleles | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC/ G |
MAF | G: 0.018 |
5' Flank | CCAAGCAAGATGTCACAAGCTCCAAGTCAA |
3' Flank | CTACACCCACTCAAGTTTCACCTACACCGA |
Individual Alleles
Sample Id | Type | Alleles |
---|---|---|
101 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
103 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
107 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
11 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
110 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
123 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
131 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
132 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
135 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
137 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
138 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
14 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
140 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
141 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
144 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
150 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
154 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
159 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
16 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
161 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
167 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
168 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
170 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
173 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
175 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
176 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
182 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
186 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
190 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
192 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
194 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
195 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
197 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J22 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J26 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J5 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J50 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2001 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2005 | Improved | N|N |
2008 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2009 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
201 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2010 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2016 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2019 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
202 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2021 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2023 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2026 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2029 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2030 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2031 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2036 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2037 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2038 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2039 | Improved | N|N |
204 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2042 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2043 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2048 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2049 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
205 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2050 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2052 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2054 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2056 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2059 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
206 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2064 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2065 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2067 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2068 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2069 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2071 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2074 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2075 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2076 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2080 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2081 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2082 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2086 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
2088 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
260 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
261 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
262 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
263 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
286 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
29 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
3 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
302546 | S.propinquum | N|N |
31 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
32 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
34 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
346 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
348 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
353 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
355 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
357 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
364 | Wild sorghum | N|N |
367 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s37 | S.propinquum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s38 | S.propinquum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
370 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
377 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
392 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
394 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
40 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
42 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
43 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
45 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
47 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
48 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
51 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
53 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
56 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
61 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
62 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
66 | Landrace | N|N |
67 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
68 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
70 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
73 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
75 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
88 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
89 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
91 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
92 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
93 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
94 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
95 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
96 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
97 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s1 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s36 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s2 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s3 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s32 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s43 | Weedy | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s40 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s41 | Weedy | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s39 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s42 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s47 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s5 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW102 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW103 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW104 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW105 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW16 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW2 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW34 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW37 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW58 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW59 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
GW9 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s4 | Weedy | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s6 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s7 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s8 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s9 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J101 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J103 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J112 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J113 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J129 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J130 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J136 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J152 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J2 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J20 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J4 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J42 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J44 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J49 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J52 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J53 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J54 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J57 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J59 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J64 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J66 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J67 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J69 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J87 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
J99 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s45 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s11 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s10 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s46 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s12 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s13 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
MHMD | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s14 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s15 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s34 | Weedy | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s33 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s21 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s16 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s44 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s35 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s31 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s17 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s18 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s20 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s19 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s22 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s23 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s24 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s25 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s26 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s27 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s28 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s29 | Landrace | G|G |
s30 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL25 | Wild sorghum | G|G |
SL105 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL108 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL109 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL12 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL129 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL130 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL135 | Wild sorghum | N|N |
SL136 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL137 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL138 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL140 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL141 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL19 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL28 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL32 | Wild sorghum | G|G |
SL35 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL36 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL37 | Wild sorghum | N|N |
SL39 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL41 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL43 | Wild sorghum | N|N |
SL47 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL49 | Wild sorghum | G|G |
SL51 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL53 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL62 | Wild sorghum | G|G |
SL83 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
SL97 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
s48 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
Tu13 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
Tu14 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
Tu30 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
Tu5 | Wild sorghum | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC5 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC15 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC19 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC30 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC52 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC6 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC61 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC71 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC72 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC79 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC94 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC99 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC100 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC104 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC105 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC12 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC13 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC16 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC17 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC18 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC20 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC24 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC25 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC29 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC31 | Landrace | N|N |
WSC32 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC34 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC38 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC39 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC40 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC54 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC56 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC59 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC68 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC70 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC73 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC81 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC85 | Improved | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC91 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC93 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
WSC98 | Landrace | GCTACACCCACTCAAGTTTCAC|GCTACACCCACTCAAGTTTCAC |
Alleles Distribution
Gene Annotation
Variation ID | Gene | Consequence | Transcript | Type | cDNA | Source/target codon | Protein Name | protein pos | source/target Amino acid |
sbi33825346 | Sobic.001G000200 | downstream gene variant |MODIFIER | Sobic.001G000200.1 | mRNA | Sobic.001G000200.1.p |
Genome Browser