sorgsd

Variation ID : sbi33825573

Variation Detail

Variation ID	sbi33825573
Type	INDEL
Position	Chr01 38699-38718
Ref /Alleles	GGTCTTCTGTATGGGTACTC/ G
MAF	G: 0.151
5' Flank	TGGGTTATGCCTCTCCTAATACCTAAAATG
3' Flank	TGTTGGAGGCTATAAATATTGTGTTGGAGA

Individual Alleles

id	Sample Id	Type	Alleles
1	101	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
2	103	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
3	107	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
4	11	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
5	110	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
6	123	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
7	131	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
8	132	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
9	135	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
10	137	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
11	138	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
12	14	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
13	140	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
14	141	Improved	N\|N
15	144	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
16	150	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
17	154	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
18	159	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
19	16	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
20	161	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
21	167	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
22	168	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
23	170	Improved	N\|N
24	173	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
25	175	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
26	176	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
27	182	Landrace	G\|G
28	186	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
29	190	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
30	192	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
31	194	Improved	G\|G
32	195	Improved	G\|G
33	197	Improved	G\|G
34	J22	Landrace	N\|N
35	J26	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
36	J5	Landrace	G\|G
37	J50	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
38	2001	Landrace	G\|G
39	2005	Improved	G\|G
40	2008	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
41	2009	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
42	201	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
43	2010	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
44	2016	Improved	N\|N
45	2019	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
46	202	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
47	2021	Improved	G\|G
48	2023	Improved	G\|G
49	2026	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
50	2029	Improved	G\|G
51	2030	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
52	2031	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
53	2036	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
54	2037	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
55	2038	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
56	2039	Improved	G\|G
57	204	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
58	2042	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
59	2043	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
60	2048	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
61	2049	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
62	205	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
63	2050	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
64	2052	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
65	2054	Improved	G\|G
66	2056	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
67	2059	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
68	206	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
69	2064	Improved	G\|G
70	2065	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
71	2067	Improved	G\|G
72	2068	Improved	G\|G
73	2069	Improved	G\|G
74	2071	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
75	2074	Improved	G\|G
76	2075	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
77	2076	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
78	2080	Improved	G\|G
79	2081	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
80	2082	Improved	G\|G
81	2086	Improved	G\|G
82	2088	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
83	260	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
84	261	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
85	262	Improved	G\|G
86	263	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
87	286	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
88	29	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
89	3	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
90	302546	S.propinquum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
91	31	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
92	32	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
93	34	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
94	346	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
95	348	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
96	353	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
97	355	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
98	357	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
99	364	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
100	367	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
101	s37	S.propinquum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
102	s38	S.propinquum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
103	370	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
104	377	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
105	392	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
106	394	Wild sorghum	N\|N
107	40	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
108	42	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
109	43	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
110	45	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
111	47	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
112	48	Improved	G\|G
113	51	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
114	53	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
115	56	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
116	61	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
117	62	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
118	66	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
119	67	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
120	68	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
121	70	Improved	G\|G
122	73	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
123	75	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
124	88	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
125	89	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
126	91	Improved	N\|N
127	92	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
128	93	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
129	94	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
130	95	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
131	96	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
132	97	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
133	s1	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
134	s36	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
135	s2	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
136	s3	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
137	s32	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
138	s43	Weedy	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
139	s40	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
140	s41	Weedy	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
141	s39	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|G
142	s42	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
143	s47	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
144	s5	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
145	GW102	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
146	GW103	Landrace	N\|N
147	GW104	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
148	GW105	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
149	GW16	Landrace	G\|G
150	GW2	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
151	GW34	Landrace	G\|G
152	GW37	Landrace	G\|G
153	GW58	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
154	GW59	Landrace	G\|G
155	GW9	Landrace	G\|G
156	s4	Weedy	G\|G
157	s6	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
158	s7	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
159	s8	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
160	s9	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
161	J101	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
162	J103	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
163	J112	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
164	J113	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
165	J129	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
166	J130	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
167	J136	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
168	J152	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
169	J2	Landrace	N\|N
170	J20	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
171	J4	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
172	J42	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
173	J44	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
174	J49	Landrace	G\|G
175	J52	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
176	J53	Landrace	G\|G
177	J54	Landrace	G\|G
178	J57	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
179	J59	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
180	J64	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
181	J66	Landrace	N\|N
182	J67	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
183	J69	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
184	J87	Landrace	G\|G
185	J99	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
186	s45	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
187	s11	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
188	s10	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
189	s46	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
190	s12	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
191	s13	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
192	MHMD	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
193	s14	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
194	s15	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
195	s34	Weedy	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
196	s33	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
197	s21	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
198	s16	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
199	s44	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
200	s35	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
201	s31	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
202	s17	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
203	s18	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
204	s20	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
205	s19	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
206	s22	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
207	s23	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
208	s24	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
209	s25	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
210	s26	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
211	s27	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
212	s28	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
213	s29	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
214	s30	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
215	SL25	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
216	SL105	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
217	SL108	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
218	SL109	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
219	SL12	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
220	SL129	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
221	SL130	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
222	SL135	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
223	SL136	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
224	SL137	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
225	SL138	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
226	SL140	Wild sorghum	N\|N
227	SL141	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
228	SL19	Wild sorghum	N\|N
229	SL28	Wild sorghum	N\|N
230	SL32	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
231	SL35	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
232	SL36	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
233	SL37	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
234	SL39	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
235	SL41	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
236	SL43	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
237	SL47	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
238	SL49	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
239	SL51	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
240	SL53	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
241	SL62	Wild sorghum	N\|N
242	SL83	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
243	SL97	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
244	s48	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
245	Tu13	Wild sorghum	N\|N
246	Tu14	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
247	Tu30	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
248	Tu5	Wild sorghum	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
249	WSC5	Landrace	G\|G
250	WSC15	Landrace	G\|G
251	WSC19	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
252	WSC30	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
253	WSC52	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
254	WSC6	Landrace	G\|G
255	WSC61	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
256	WSC71	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
257	WSC72	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
258	WSC79	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
259	WSC94	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
260	WSC99	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
261	WSC100	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
262	WSC104	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
263	WSC105	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
264	WSC12	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
265	WSC13	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
266	WSC16	Landrace	G\|G
267	WSC17	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
268	WSC18	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
269	WSC20	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
270	WSC24	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
271	WSC25	Landrace	G\|G
272	WSC29	Landrace	G\|G
273	WSC31	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
274	WSC32	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
275	WSC34	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
276	WSC38	Landrace	N\|N
277	WSC39	Improved	G\|G
278	WSC40	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
279	WSC54	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
280	WSC56	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
281	WSC59	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
282	WSC68	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
283	WSC70	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
284	WSC73	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
285	WSC81	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
286	WSC85	Improved	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
287	WSC91	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
288	WSC93	Landrace	GGTCTTCTGTATGGGTACTC\|GGTCTTCTGTATGGGTACTC
289	WSC98	Landrace	G\|G

Alleles Distribution

Gene Annotation

Variation ID	Gene	Consequence	Transcript	Type	cDNA	Source/target codon	Protein Name	protein pos	source/target Amino acid
sbi33825573	Sobic.001G000400	upstream gene variant \|MODIFIER	Sobic.001G000400.2	mRNA			Sobic.001G000400.2.p
sbi33825573	Sobic.001G000400	upstream gene variant \|MODIFIER	Sobic.001G000400.5	mRNA			Sobic.001G000400.5.p
sbi33825573	Sobic.001G000400	intron variant \|MODIFIER	Sobic.001G000400.4	mRNA			Sobic.001G000400.4.p
sbi33825573	Sobic.001G000400	intron variant \|MODIFIER	Sobic.001G000400.3	mRNA			Sobic.001G000400.3.p
sbi33825573	Sobic.001G000400	intron variant \|MODIFIER	Sobic.001G000400.1	mRNA			Sobic.001G000400.1.p
sbi33825573	Sobic.001G000400	upstream gene variant \|MODIFIER	Sobic.001G000400.6	mRNA			Sobic.001G000400.6.p

Genome Browser