国家基因组科学数据中心生物多样性分中心

国家基因组科学数据中心生物多样性分中心于2023年12月成立,依托单位为中国科学院昆明动物研究所。

建设目标

立足我国西南与东南亚地区丰富的遗传多样性资源,充分集聚生物多样性演化、保护与可持续利用优势资源,通过大数据整合与分析,对生物多样性数据进行系统管理和深度挖掘,开展生物多样性共享、应用和以大数据为核心的基础性、前瞻性研究,为维护国家生态文明和生态安全屏障建设、人民健康提供高质量的支撑服务。

研究方向

依托遗传进化与动物模型全国重点实验室、模式动物表型与遗传研究国家重大科技基础设施(灵长类)、国家非人灵长类实验动物资源库、中国西南野生生物种质资源库(动物种质资源分库)、西南生物多样性实验室、云南省西南及跨境生物多样性数据信息重点实验室、昆明动物博物馆、生物多样性大数据中心、生物多样性基因组中心等多个生物多样性平台,系统梳理生物多样性科学数据资源,开展“第二次青藏高原综合科学考察”、“动物复杂性状的进化解析与调控”等重大项目数据汇交和相关论文数据汇交,探索建立面向解决世界难题的时空格局型、资源功能型和关系纽带型更为复杂的生物多样性综合数据汇聚,研究全面支撑生物多样性数据资源存储、共享、应用和挖掘的大数据技术体系。

特色资源

开发“西南及跨境生物多样性大数据平台”、“生物多样性全景图”、“灵长类ENCODE数据库”、“新冠病毒全球演化跟踪、新冠疫情全球动态监控预测平台”等一系列权威数据库/信息平台,相关数据库工作入选两项院级十大进展,引领科研范式变革示范。

基础设施

已建成“云-数-智-存”一体化数智大数据中心集群,计算能力超过300万亿次,存储6.5PB,拥有三级网络安全等级保护全方位防护能力;汇聚数十亿条科学数据,实现上百TB的生物资源对外共享。

人员队伍

目前由11人组成,包括具备科学数据整编、质量控制和挖掘利用等能力的专职信息化工作人员8名,研究生3名。

负责人: 吕雪梅

吕雪梅,博士,研究员,博士生导师,中国科学院引进海外高层次人才、“西部之光”引进人才、云南省引进高层次人才。中国科学院昆明动物研究所进化生态与多维组学动态学科组负责人,主持中国科学院生物多样性信息化区域中心、云南省西南及跨境生物多样性数据信息重点实验室、昆明动物所进化发育研究中心工作。目前已在National Science Review、Science Advances、Nature Communications、Molecular Biology and Evolution、PNAS、Genome Research、Science Bulletin等期刊上累计发表SCI论文63篇,获得专利11项、软件著作权2项、参与制定国家科学数据标准4项。主持及承担科技部国家重点研发计划课题及应急专项、中科院战略先导专项、基金委重大研究计划重点和集成项目、第二次青藏高原综合科学考察研究课题等。