DNA甲基化差异区域检测集成分析工具 面向全基因组的甲基化数据集成与分析及可视化软件(METHDIAV v1.0)
Introduction
METHDIAV是一个单碱基核苷酸全基因组DNA甲基化数据集成软件,支持通过网络浏览器访问数据,输入甲基化位点信息搜索到他们感兴趣的基因或染色体区域。METHDIAV部署了一个快速的、可嵌入的基因组浏览器JBrowse,其内置的搜索引擎效率更高,更适合大规模数据集。此外,基于JBrowse的Web界面在基因组上下文中还可以展示可视化的甲基化数据以及其它注释,并提供数据下载功能以及染色体任意区域的滚动和缩放功能,以方便查看各级别分辨率下的甲基化及相关注释信息。
Publications
No Publication Information
Credits
- Shuigeng Zhou sgzhou@fudan.edu.cn Investigator
Computer Science, Fudan University, China
Community Ratings
Usability | Efficiency | Reliability | Rated By |
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Summary
Accession | BT007225 |
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Tool Type | Application |
Category | Differentially methylated region detection, Methylation annotation, Allele-specific DNA methylation detection |
Platforms | Linux/Unix, MAC OS X |
Technologies | Java |
User Interface | Webpage |
Input Data | FASTQ |
Download Count | 0 |
Country/Region | China |
Submitted By | Shuigeng Zhou |
Fundings
2016YFC0901700