高通量原位结构解析软件包 高通量原位结构解析算法主要用于细胞原位等具有叠合蛋白密度样品的目标蛋白结构解析,该算法基于相关性分析,通过施加最优的权重函数,可以在单张冷冻电镜数据上实现目标蛋白质的定位以及高分辨结构解析。由于无需断层重构,原位结构解析的数据采集通量提升了数十倍。

Introduction

本软件包是高通量原位结构解析所需的程序以及源代码,所用语言包括C语言和Python。运用此软件包必须安装EMAN1.9软件包。高通量结构解析软件包包含已经编译好的可执行程序及其源代码。包含3个C程序和6个Python程序,C程序用于预处理二维图像、颗粒探测以及颗粒排序,而Python程序辅助文件的转换和创建。

Publications

  1. Determining structures in a native environment using single-particle cryoelectron microscopy ima
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    Jing Cheng,Bufan Li, Long Si, and Xinzheng Zhang, - The innovation

Credits

  1. Jing Cheng chengj@ibp.ac.cn
    Investigator

    National Laboratory of Biomacromolecules, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, China

  2. Xinzheng Zhang xzzhang@ibp.ac.cn
    Investigator

    National Laboratory of Biomacromolecules, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, China

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Summary
AccessionBT007324
Tool TypeApplication
CategoryStructure refinement
PlatformsLinux/Unix
TechnologiesC, Python2
User InterfaceDesktop GUI
Latest ReleaseisSPA1.0 (September 5, 2022)
Download Count1606
Country/RegionChina
Submitted ByLingfei Kong
Fundings

2017YFA0504700