高通量原位结构解析软件包 高通量原位结构解析算法主要用于细胞原位等具有叠合蛋白密度样品的目标蛋白结构解析,该算法基于相关性分析,通过施加最优的权重函数,可以在单张冷冻电镜数据上实现目标蛋白质的定位以及高分辨结构解析。由于无需断层重构,原位结构解析的数据采集通量提升了数十倍。
Introduction
本软件包是高通量原位结构解析所需的程序以及源代码,所用语言包括C语言和Python。运用此软件包必须安装EMAN1.9软件包。高通量结构解析软件包包含已经编译好的可执行程序及其源代码。包含3个C程序和6个Python程序,C程序用于预处理二维图像、颗粒探测以及颗粒排序,而Python程序辅助文件的转换和创建。
Publications
Determining structures in a native environment using single-particle cryoelectron microscopy ima
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Credits
- Jing Cheng chengj@ibp.ac.cn Investigator
National Laboratory of Biomacromolecules, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, China
- Xinzheng Zhang xzzhang@ibp.ac.cn Investigator
National Laboratory of Biomacromolecules, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, China
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Summary
Accession | BT007324 |
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Tool Type | Application |
Category | Structure refinement |
Platforms | Linux/Unix |
Technologies | C, Python2 |
User Interface | Desktop GUI |
Latest Release | isSPA1.0 (September 5, 2022) |
Download Count | 1606 |
Country/Region | China |
Submitted By | Lingfei Kong |
Fundings
2017YFA0504700