| Accession | SAMC107079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Sample name | Xiaomi Iso-Seq | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Title | Iso-seq of Xiaomi | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample type | Plant sample | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Setaria italica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Xiaomi is an extremly short life cycle EMS mutagenized mutant which shows growth characters similar to those of Arabidopsis, producing up to six generations per year and growing to ~26 cm tall. To annotate Xiaomi genome accurately, we performed a Iso-sequencing using seven tissues, including 2 day-after germination seeds, 2-week-old seedling, root, stem, young leaf, mature leaf, pollinated panicles and panicles. A total of 15 SMRT cells were sequenced on a PacBio RS II platform. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Attributes |
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| Release date | 2020-06-24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioProject Accession | PRJCA001730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Submitter | Xingchun Wang (wxingchun@163.com) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organization | Shanxi Agricultural University | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Submission date | 2019-09-16 |
| Resource name | Description |
|---|---|
| GSA (1) | - |
| CRA001972 | Iso-sequencing of Xiaomi |