| Accession | SAMC1833960 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Accession in Other Database | GSA-Human: HRS207430 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample name | FLAG_rep1.RNA-Seq | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Title | FLAG_rep1.RNA-Seq | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample type | Human sample | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | HeLa-S3 cells were infected with lentivirus.After infection, puromycin was added to the medium to select the positively infected cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Attributes |
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| Custom attributes |
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| Release date | 2021-06-23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioProject Accession | PRJCA005419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Submitter | Hongjie Yao (yao_hongjie@gibh.ac.cn) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organization | Guangzhou Institutes of Biomedicine and Health,Chinese Academy of Sciences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Submission date | 2023-06-18 |
| Resource name | Description |
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| GSA-Human (1) | - |
| HRA000960 (Open Access) | Here, we explore the functions of an alternatively spliced human CTCF isoform (CTCF-s). Functionally, we find that CTCF-s competes with the genome binding of canonical CTCF and binds a similar DNA sequence. CTCF-s binding disrupts CTCF/cohesin binding, alters CTCF-mediated chromatin looping and promotes the activation of IFI6 that leads to apoptosis. This effect is caused by an abnormal long-range interaction at the IFI6 enhancer and promoter. |