样本编号 SAMC515474
样品名称 TC008-41
样本标题 a new higher-quality reference genome of jute species Corchorus olitorius (C. olitorius)
样品类型 Plant sample
物种名称 Corchorus olitorius
描述信息 We newly assembled an improved genome of the C. olitorius cv. salt tolerance jute variety (TC008-41, No. zhonghuangma 15, namely TC) by using a combine technology data comprise of Nanopore long reads (111.02 Gb), paired-end sequences (43.24 Gb), 10X Genomics sequences (94.72 Gb), and chromatin conformation capture (Hi-C) data (48.24 Gb). A total of 411.26 Mb TC assembly was anchored onto 7 pseudo-chromosomes with an contig N50 size of 4.13 Mb, which have improved 2.75-fold compared to the recently published genome
样本属性
栽培品种 No. zhonghuangma 15
实验材料提供者 Zemao Yang
组织 leaf
生长时期 1 year(s)
细胞系
细胞类型
采样单位
取样时间
收集/保存方法
发育阶段
疾病名称
疾病分期
基因型
培养方法
高度/长度
取样来源
经纬度
表型
数量
类型
性别
凭证标本
培养温度
处理方法
发布日期 2023-01-07
项目编号 PRJCA007347
提交者 Zemao  Yang  (yangzemao@caas.cn)
提交单位 Institute of Bast Fiber Crops of Chinese Academy of Agricultural Science
提交日期 2021-12-01

样本包含数据信息

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