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CRA005715 基本信息

标题: PacBio and HiC reads of Lentinula edodes genome sequencing

项目编号: PRJCA007678 /

发布日期: 2021-12-27

文件个数: 6

文件大小: 398.11 GB

出版信息

文章标题

Haplotype-Resolved Genome Analyses Reveal Genetically Distinct Nuclei within a Commercial Cultivar of <i>Lentinula edodes</i>

杂志名称

Journal of Fungi

发表年份

2022

Doi

10.3390/jof8020167

PubMed ID

35205921

文章标题

Insights into the Global Transcriptome Response of Lentinula edodes Mycelia during Aging

杂志名称

Journal of Fungi

发表年份

2023

Doi

10.3390/jof9030379

PubMed ID

36983547

文章标题

HOG1 Mitogen-Activated Protein Kinase Pathway–Related Autophagy Induced by H 2 O 2 in Lentinula edodes Mycelia

杂志名称

Journal of Fungi

发表年份

2023

Doi

10.3390/jof9040413

PubMed ID

37108868

数据下载

元数据信息:

CRA005715.xlsx

文件:

HTTPS：https://download.cncb.ac.cn/gsa/CRA005715

推荐 Qtrans（测试）：文件下载

Aspera命令行: 帮助

文件:

FTP：ftp://download.big.ac.cn/gsa/CRA005715

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Experiments和Runs信息

实验编号	实验名称	物种名称	测序平台	样本编号
CRX308527	HiC_SP30	Lentinula edodes	Illumina HiSeq X Ten	SAMC540331
Run编号	Run别名		Run序列文件信息
CRR357963	HiC_SP30		File: CRR357963_f1.fq.gz File: CRR357963_r2.fq.gz
CRX308526	HiC_SP3	Lentinula edodes	Illumina HiSeq X Ten	SAMC540330
Run编号	Run别名		Run序列文件信息
CRR357962	HiC_SP3		File: CRR357962_f1.fq.gz File: CRR357962_r2.fq.gz
CRX308525	Pacbio_SP30	Lentinula edodes	Pacbio Sequel II	SAMC540331
Run编号	Run别名		Run序列文件信息
CRR357961	Pacbio_SP30		File: CRR357961.bam
CRX308524	Pacbio_SP3	Lentinula edodes	Pacbio Sequel II	SAMC540330
Run编号	Run别名		Run序列文件信息
CRR357960	Pacbio_SP3		File: CRR357960.bam

提交者:Qi Gao (gaoqi@ipepbaafs.cn)

所属单位:Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences

提交日期:2021-12-22