NONHSAT091589
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Expression
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Allelic Information and Variation
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Evolution
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Labs working on this lncRNA
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References
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Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT091589 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intronic(S) |
Length |
5038 nt |
Genomic location |
chr3-:124965120..124970132 |
Exon number |
2 |
Exons |
124965120..124969707,124969714..124970132 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 AAAAGAGAAA ACTAATTTGT GGTATTAGAA GCCTGGATAG TGGTTATTTT TGAGAAGTTA GACATGCTGA TCAGGTGAGG 000080
000081 CTTCAAGAGG CACTTAGGAA GTGCTCATAA TGTTCTATTT CTTGATTATG AGTGCTGGTT ACGTGAGTTG ATGGACTTTG 000160 000161 TGGAAATTTA ATGAGCTATG ATTATGATTT ATTTACTTTT CTCTATGACT GTTACACTCT AGTAAAAAGT TTGCCTAAAA 000240 000241 TAAGAAAGTA GCAAAGAAAG AAATAATGAG AAGGGTTAGA CGAAATAAAA TTTGCTGATT ATTGGTAATT ATTGAAGCTG 000320 000321 GGTGATAAGC GAGGGATCTT TATGTGTTCT CTACTTTTGT GTATGTTTGA AAAGATCCAT AATGATAATT AAGATAAACT 000400 000401 ATAGGAATAG AAAGCAGACA ATTTGTTCCT GGATGGGGAT GACAGAGAGG AGCAGGAGAA AGGAAATATA GAGAATAAAA 000480 000481 GGAAATTTTG TGGTTTAAGA TAAATATATT GTCTTGATTG TGATGATGCT TTCAGAACTA ACCAAATAGT CAAATAATGC 000560 000561 AAAAAACAAA AACAAACAAA AAACCCCAGA AAACTTAGGT TCAACTTATT CCAACTGCTG TCATCTACCT GGAAGAAGAC 000640 000641 CAGACACTAG TAACAACTTA ATACTTGCTA AATGAATTAA TGACTGGGGT GCCATTTGGC ATATTATTGG TCTACATTTT 000720 000721 TTTTAACTAT AGAAAATATT GAGCATGAGT TTCTTACAGG TAAGTTACAG ATTATTTGAA AGAAGTATGT ACATGTAATC 000800 000801 AGAGGTCCAC ACTCAGGGAT GCTCTGAGAT AAGCTATGTC AGATGAATAA GGCACTGAAG 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Predicted Small Protein
Name | NONHSAT091589_smProtein_2012:2242 |
Length | 77 |
Molecular weight | 8784.5265 |
Aromaticity | 0.210526315789 |
Instability index | 43.0105263158 |
Isoelectric point | 9.59112548828 |
Runs | 10 |
Runs residual | 0.00983061101028 |
Runs probability | 0.0310722487194 |
Amino acid sequence | MNIWLANVFSHSIGYLFILLSMLKLFSLTSYSFIFALFAYGFVVISTKSLPRPMSRSFLP CFLQGFLWFQVLCLSL |
Secondary structure | LLEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLLLLLLLHHH HHHHHHHHHHHHHHLL |
PRMN | LLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHH HHHHHHHHHHHHHHHH |
PiMo | ooooooooooTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTT TTTTTTTTTTTTTTTT |