NONHSAT129263

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT129263

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

16901 nt

Genomic location

chr8+:135795862..135812762

Exon number

1

Exons

135795862..135812762

Genome context

Sequence
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012321 tggggtattg atttctgaac cttaacgtaa tgaagcctcc acagaaactc agaaggacag ggttcgaatg agcttcgaga 012400
012401 cagctgaaca catgaactga ctattcccag agggtggtgc acctggagaa ggcacagaag ctccgtgacc cttctcagta 012480
012481 tcttgcctat gctccttgtc tttctggcag ttcatgtgta tccttcataa tatcctttat aataaatggg taaatgtaaa 012560
012561 taaagtgttt ccctgaattc tgtgagctgc tctagcaaat taatcacact tgaggagggg gacctctagc cagttggtca 012640
012641 gaatcacaaa ccgctaactg cttgtgactg acatctgaag taaggggtag tcttgtagga ctgagccctc cacttgcggg 012720
012721 atctgacact atctcccagt agataatgtc agaattgaac tgaattagag gacacctggc tggtatccac tggagaatct 012800
012801 gcagtaaaga actgctggtt gttggtggag agaaatcccc acacacattt ggtgagagaa gtgttgagtg gaatgtgaga 012880
012881 ggagaaagca cttctggttt tttcctTTAT CTCTAATAAT GTTCCTTCTC CTGCATTGCA CTGCCTCCTT AGGAAGCACC 012960
012961 AGGAATAAGA AAGGACATCT GCTTTTCACA TGTGTCACTT GACAGACTTG TCATGATGAT GGGTTAATAA AGAGACTAAA 013040
013041 GAAAACCATT ACAAAAAAAA AATCTGAAAT TTACTTTGGC CACAAAGATG AATAGCAGTT GGACATTCTT GACAACTGCT 013120
013121 TCTACTTTAG GTCTAGTGAC TATGAAGCAC AAAGATTCTC CACATATCat taataaataa atatatatat GTATGCAAGC 013200
013201 ATGTATTAAC TTTGCTTAAT GTTTTAGTTT AATCTGATAT TAATTTCTAT ATGTTAAAAG TTCATTTATC ATCCATGTAA 013280
013281 CATAGTCTTC TGCACATCTA ATCATGACAT TGTATCAGTG ACATAGTCTG GTCACTGCAT TTAATACAAA TACTGATTTG 013360
013361 AAGAATTTAT AACATTAAAA AAGTTTAAGA TTACAGATTG AATGACCATT TAGAAAGTTA TCTGAAAAAG AAGGACTGAC 013440
013441 AATACCCAAC CCACAAACTG TTTCTCATTC ATACTTATAC CTTTACTTGA AAAATAACTC AGTATTTTGG TGAATACTGA 013520
013521 CTGTGCTACT GACTACAAAC AGGAGATAAT TTTTTGTATG TGCTATTGAC TACACATAGG aaaataattt tgttatatta 013600
013601 agtataaata aaataCCCGC CCCCCACCAA ATTTTCAGAT AACCTATAAA GTGGGGAAAG CTTATCATAA TGTCAAAATG 013680
013681 ACTGGGATAT CGAAATAAAA GTAACTGTAT ACCTTTTAAG TGCCTTTTAT ACCCTTCAAC CAAAAAAACC TTATAAAAGT 013760
013761 CCTCCCTACC CCCAGGGAAT TTGAGCTCTT ACAACATTTG CACAGAAAAC AAGTGGCAAA GGAAGTTTCT CAAACTAATT 013840
013841 TTAAAAAACA GAACAACCCA CAAATCCTGT TTTTATTTTT TGACAAAAGA AAAATACTGA ACATTTTTTA AGGAATGATT 013920
013921 TTGAAACAAG CAAGGAAAAG GTCACAACTT TGAAACCAGT TATAACTGCA CCTGGATAGT CCCAAGACAG AAAGTTAAGT 014000
014001 AGCTCAACAG GTTCTACTGC TAAGATTTTG AATCACAGGA ATAATGTATA TTAAATAGTA AAAATACCCT TGGGACTAGT 014080
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014161 GTGAAATTGT TGTTTTATAA TGTACTAGTA GCTTTGAGAA Gaattaaaat taaaaaaata aaaataCCTT TACATTTTAA 014240
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014401 TGAACATAAC TAAAAGATAA ACTCTATTAT ATATTACAGA TTCCCCCCAT CTTGACTGAC ATTTTTCAAT TACTGAAGTC 014480
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014641 ATTTCAGAAC ATATCCCAAA ATTATCAAAG ACATCCAATT TTACATTATG TTATCTATTA ATACCAAATG GCAATATGGT 014720
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016881 TCAATGTTAA TTGGTTGACA T
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT129263_smProtein_10700:10915
Length 72
Molecular weight 8235.5081
Aromaticity 0.140845070423
Instability index 62.4550704225
Isoelectric point 9.12884521484
Runs 9
Runs residual 0.0217939214233
Runs probability 0.076007379929
Amino acid sequence MNTASCMFNLLHMDIHTRYKFKSQASQHNFRRDFSNITCSILPISNASYLVMFCLFYCSN
IPVQPGPHKAF
Secondary structure LLHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLL
LLLLLLLLLLL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
LLLLLLLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTooo
ooooooooooo