TTTY9B
Contents
Annotated Information
Approved Symbol
TTTY9B
Approved Name
testis-specific transcript, Y-linked 9B (non-protein coding)
Previous Symbols
_
Synonyms
NCRNA00132
Chromosome
Yq11.221
RefSeq ID
NR_002159
OMIM ID
_
Ensembl ID
ENSG00000131007
pubmed IDs
12815422
Sequence
>gi|49487493|ref|NR_002159.1| Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 9B (non-protein coding) (TTTY9B), long non-coding RNA
000001 AACAACAGCC CTGCTCTGGT CCCTCCAAAA GCCGACGAAT CCACACAAGA CTAAAGATGA AGAAGAGGAC AACAAGCCCA 000080
000081 GCTCTAATCA CACTCCAGAA GATAACTAGT CTACGCACAG CCAAAACTTA AAAACTCATC AGTCTTTCCC AGAGACAGAT 000160
000161 TGAACTTCAA GGTAAAAGTG AATTTTCAGA TGCGGACAAG CTAACTTCTA AGGATTATGA GTAATTCGAC TCATCTTTTA 000240
000241 AATATCCAGA AAACCTCATT TTTAGTGAAA GAGTGGAGAT AAAAGAATAT TAAGAGTCCA GAAACTGGTG TTCTGGCTGT 000320
000321 GGCCCTGCCT TAGACTGTCT CACTTTGTAG TCACTTTATG CAGGAAACGT GCCCGGGCAT CTTGAAATGG ATGAGTTCTC 000400
000401 TTCTGGAGAT ATGTCTCATG TGTACGCATA TCTGGAGATA TGCCTCTTGT GGGTGCTGCT GCAGCTGCTG TGCCCATCTC 000480
000481 ATATCAATAC CCAAGCTTTT CTCATGACGA ACCAGATGAC TCTTGGTAAC CAGGTTTGCT CCCCAGCTTC TAATTTCAAT 000560
000561 ATGATGAGAA GTTACATAAC ATTTACTCCT TTGTAAAGGT TTCTCTGTCA TCAGACAAAA CTCTGAATAG AAACCGGTGG 000640
000641 GTAATCCAGT GTACTGGTTT TTCCTAATGT ATTTGGTACT ATAGTGTATG AACCGAGAAT AATCGAGTCA AGTGAAACCC 000720
000721 CCTTTTCCAG TCATAAAATG TCTCATTCAT TATACTAAAA GGAGCTGTTC TTTTAAAAAA GCCTTCTTAT TTTTCTACTA 000800
000801 AATTTTTAGA TAAGTATAAC CTACTATATT CCTCAAATCT AGGCTTACAT TTGAGAAGGG TAAGCTGTGT TTTTTCCTCC 000880
000881 GAAGAGTTGG GCTGTGATCT TTACAACGAG ACGTCGTTTT TCCCAGCATA TTTCTGTTTT CTACCTAAAC ATTAAGATAC 000960
000961 ACATTTTTCT AGGCATTAGA AATAGTACAA TATTGCCTGT GGTCTTTCCA TTTGACACCT GTGGCTGGAA TATATGTGTC 001040
001041 GCTCCAGAAT TTATATGTTG GAATTTAAAT GCCCCTGTGT GATAGAATTA AAAAGTGGGG ACTTTGGGAG GAGGTTAAGA 001120
001121 GTGCAATTAG AGACCTTATA AAAGAACTCA ATGGAAGTAG CTAGGCTTTT TAGCCCTTCC ACCATTAGAG GACACTGTAT 001200
001201 TTGTCCTCTC TGGAGAACAC AGCAACAAGG TGCCATCTTG GAAGAAGAGA CCCACCTTCA CCAGACATTG GACCTATTAG 001280
001281 TGCCTTGATC TTGGACTTCC CAGTGTCTAA AACTGTAAGA AATTTATTTC TTTCCAGTTT CATAAGTTAC CCAGTCCAAG 001360
001361 GTACTGTGTT ATAGCATCAG GAACATACTG AGATGGCATA TTTATTGTGG AAATTTTGGT CCTCATACTT AATGAATGGG 001440
001441 CTTCAAGTAT TTCGTTAGTT TTTAAAAACA GGGCTCCTCC TTTACAATTG ATCTCATTTT TATTTTTTAA AAGTTAGCTT 001520
001521 TTACAACATA GAACTGGAAA AAATCTCTAC TCAGACCTCT AGAGTGTCCT AGATTTTGTG GCAGAATCAC TATGGATAAT 001600
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Predicted Small Protein
Name | TTTY9B_smProtein_386:595 |
Length | 69 |
Molecular weight | 7883.1259 |
Aromaticity | 0.115942028986 |
Instability index | 49.5956521739 |
Isoelectric point | 4.72235107422 |
Runs | 10 |
Runs residual | 0.00559621179509 |
Runs probability | 0.0386415827593 |
Amino acid sequence | MDEFSSGDMSHVYAYLEICLLWVLLQLLCPSHINTQAFLMTNQMTLGNQVCSPASNFNMM RSYITFTPL |
Secondary structure | LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLHHHH HHEEEELLL |
PRMN | LLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL LLLLLLLLL |
PiMo | ooooooooooooooTTTTTTTTTTTTTTTTTTiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii iiiiiiiii |