Difference between revisions of "NONHSAT093004"
Line 42: | Line 42: | ||
sequence = <dnaseq>TCTGTTTGTTATTTTTACCACTGTTGAACAGCAAACTGTTGAGGCTAGGGTTGATTATTGATAATTTTTATGTGTTTAGTAATAACCACAGCATCATACGTACAACTGCTTTAATAAATCAAAGTTAAGGACTTTGAGGAGAGCATGTAGCAAGTATTCATTTTAACAAATAATCACAGACAGTTTCCCTGTTCAAAGCTCCACCAAAAAGCAAGCATGCAGCAAAGGCATAGACTGTATTTAGAGATGTGGTTTCATTTATTCTTGAAGTCCTATAACCTTGCATTATTTAAACACAAAATCCCACCTAACATTTGCCAAATCCAAGTTAATCTCAAAAACCTCCGAGGACATTGAGCACAAGCAGATTACTGTAAGGGCACTGGTGGCAGATTGTGGTGGAGAGAGGGCTGAGTGACCCAGAGCAAAGCCTGCCCGGGTTACTCGCTGCCACTTCAGGAGAGGGATTGTATCAGCTCTCATTACCTTTTGTCATGAGGCAGTTCATAAATTAAATATGATATCATGCATTATCTCAAAATATTTCTATATTAATTAGATAATTCACGATGTAAAACGTGTTCATGCAGAAGCAAAGGCGGATGTAATAGTCAAGTATCAGGGAAAAACCCCTTTAGGATACACAGACATTAAAAATGTAAAAAGTAGCTTATAAGAAATGTGGATTATCAGATTTTTACTATATATAGGTTGTGTTTAATAGTAATTTCTGACACCTGCACATAGATGAAGAAAAGGCAGTTGTTACCACTTTTCACCATTCAAAAAATGGGCTTGTCTCTTAGAGTATTGGTTAATGCTTTGCTTATTTGTTAATGAAGACAGCATTTTAATTTTAAAGCTTCCTTTTGTAGGACTGATGGCACGGGCAGAATCACATTTAAGAAAAATGGTTTGGAACACTTTTTAATAAAAAATTGTAAAATCAGTTTCCAGTGTGGTCAAAATTAGAATGTAAAGGAAAGCATTTTTAAGAAAATACAGAAGCCCAAATCAAGGGAGAGTAATATAAAAGGAAATATTTTAAATTAAGAAAAGGAGGTGTTATAGTTTATTACATCATGAATTATGCTTTCTGTACTTACGCTCTTAGTGAAGGAGATAACATTGAAGTGAGAAAATGAACATTCTCAGTTATTTGCGAAGTTAGTAAAATTGCAGTCCCTATTCCATTTTTTTCTGATGAAAATGGATACATGAGATCTCATTTATTGCTCTCCTCAACACCTTTACTGTCCCAGATTCCATTCACGTTCCAAATCGTGGACAGTAAAACTGAAGTCAGGTAAACACAGTCACAGGTACAACTGGGAGCAAGTTTTAACATAGTGGTAATTTTGCAAATGCCAACATGAATACTAGTGAGTACTCAATTTACGACAGACAATTTCACAAAAACCAACCACAGAGTGATTTGATATTCTTGCTTCTTAGAGAGTTTTCTAATCCATATAATGCAATGGGTCAGGTTGCTCATATGATTAAAAAAATTAATCCTGTAGAAATGATGTATTAGACATCTCTAACCCAAGAAAAAGATGTCTTTTGTATAACTTTTAAATTCCCATTTGTCTATCTTAGGACAAATGATGACTTCTTCGTGTAGTAATGAAAACGTCTAAATCCTGCTCTGTGGAGAAAAGCTAGAACCATGGGACATTAAGCAAGAATACTCCTCTGATTTAGGCTCCCAGACTACAACTAACAGTCTTTATGTATTTATCATCTTGGTTATTGTTTTATCTCAAGCATATACAGTGTGCAGAAAGTAGAATAATGAATAAAATATGACCATGGAGAAAACCCATAACTTTTGCTTCTATTATAGAAAGCAGTGTTTGTTCCTTTTAATTTATTACATGTTCACATTGAAACATTAACATCTACAATATTGTCTTTCAGTTTACTCTTCAATTACTAAAGCAAATGATTTTGATTTATAGCACTTACACAACTGCAGTTCAGGTCACAGAATTGAAATCTATTTGATAATGTCTCAGCATTCTCATGGGCAGCCAGGAAAAAAAAAAGAGAGAGAAAGACAAATAGAAATTTTAGTGGGTTCAGATAAATGATTATTCTGACAAACCTGGAAAATAGTAATTAAACAGTTCATTCCAAAAGACCCCAATGTAAACTCTGCTCACATACATAATTTGTATAAGGAAAATGTATGAGTTTTTTTCTTAAAAATAAATAGAAGCATCATTGCATTTATAACAGATTGATCAATCTTATGAACAGATTACATTGGGAAAGTCACTATTATTGCTGTGTGTTTGTATATTTTATTCTTTCCTTTTTTGTGTGAGCATCTACTATGTGCCAGGCAGTGACTGTGTCTGAGTGAATGTATCCATGGTGAGCACTCAGGCGCCATCACTGCCTTCTTGGGGCTTACACCCTATTGGGGTGTCAGAGATATTATAACACTCAATATTGACCCAATGGGATGAAAATTGTTATCTTCATGATTTCTTCCAATGGGCTTAGATTTGTTGGGACAGGGCAGAATTAGAATAATTATTTCTCACATATAAGAGTAAGTGATATGAGATTGGGAATTTCTTGCCAACACTCAAGCAAACTGCAGAAGATAATTACTCCATTTTACTAGCTCACCTAGTTTCTGAAGGATGGGGTGGGGAGTGAGACATGGAGCCTCTGGGGACAAGGATAGGGGGGTGGGACTGTCCCAGTGGAGGGTGCCACTGGAAGCCTCCACCCAAGTGGGCCAGCAGCTGTGCAAGGGTGCAGCAGTAGGCTGGTGAAAGCCAGGTTGTCCAGATCTTTCTAGGGGAAGAGAAGGATTATAGAAAAGGAGAAAAGGGAGGAGCAAGAACATCTCTCCATGGCCTATTTTTATTTTTGTTCCCAAGAGACTAGTGTAATAACCTTATGCCCCCAAAGACAGCCCAGAACTGAGTATCTTCAGTGTTCCTGAGTGTAAATCAGTGAATCTGTTATATAGAAAGTTAACATTTCAGGAGCACAATTATTTCCTGATTTCAAATATGAACAGAAGACTAAATGTCATTTTTTTAAATCATAAATTTGGTATCCATAGTTACTTTACACATTCCAGAGTCTAAGCATGGAATTTAAGTTTTGTATTTTGAACAAAAATAGCAACATCTGTTTTCTGTATGGCAAAGAAAAACTAAATCCCAGACTTTTATTTTTAACCACAGAAACCATCACTTCTTTCTAAATTATTTGCTTGCCTGCTCATTTCCCCTAAACATCTCTGTTTATGCCAATGGCTTTTTAAATCCAAATAATACTAGTTATTGCCAAATTGCATTAGAATCCTATTGAATTAGAATAATTCATATACTTCATATACTAGGCAGTAAATGGTTAGAGACGGTAAAGATCTGATTGTGATCAAAAGTAGGGTTTTTGTTTTGTTTTTAATCATGAGCACATATAAAAGGAAATTCAAATGAAACCAAGCCAATTTCTGATTTAGTAAGATTAAAACCATAGATGGAGCTCAGTTATTAAGGATGGAAAGGAGGAAAGCACAGAGTGAGGAGAGAAAAAGGGGAAGGAAAAAAAGTAGTGTTTTTTTGGGGAACAGTATAATGTCTCAGAAGTTCTTCTCTCTTATCCTGCTGATGTTGAGACAGTGGCTTTGTATAAGCTTTTATTTATACCTATTTCAACATCATGAAAATTTTTCCATCAGCATTTTCTTGCAACTTTAAAAATCACAAGGGATTATTTGTTTATAAAGAGATACAGGATCTATAATTTATTGGCAATACTTTATTTTAGGAATCTTCAAATTGTACTTAATAAATAAATCACAGGTCAAAATGACTGTAAAATCAATCAGGCTTTCTCGTAAGTTATTTCCTGAAAACCATCCATGATAAATACAACAAGGCTTGGCGAAACCTCATTACTCTTGGAAGTCTTCAGAGGTTATTATACCTACTGATCTGTATTTGTCTCTAAGAGACATTTGAAACACAGTTACAATGTCAATTTGGTGTAACATTACCTGTAGTAGAGCTCAGAGTATATGGCAGTGCACGGTCACTCAAGATGCATGGCGTGTCATTTGGGTCGCTTTGATGGGTGCTCGGGTAGAACTAGCCTTGTAGAGACTAATGTGTTCATGCTATCTCTGATCCTGTGGTGTTGTATAAAAATGAACAGCTAAAAATTTACCCATGACAAGATTAAAGCAAAAATAAACACAAAGTTGTTAGACTTTAAAAAAAAAAAAAAAA</dnaseq>| | sequence = <dnaseq>TCTGTTTGTTATTTTTACCACTGTTGAACAGCAAACTGTTGAGGCTAGGGTTGATTATTGATAATTTTTATGTGTTTAGTAATAACCACAGCATCATACGTACAACTGCTTTAATAAATCAAAGTTAAGGACTTTGAGGAGAGCATGTAGCAAGTATTCATTTTAACAAATAATCACAGACAGTTTCCCTGTTCAAAGCTCCACCAAAAAGCAAGCATGCAGCAAAGGCATAGACTGTATTTAGAGATGTGGTTTCATTTATTCTTGAAGTCCTATAACCTTGCATTATTTAAACACAAAATCCCACCTAACATTTGCCAAATCCAAGTTAATCTCAAAAACCTCCGAGGACATTGAGCACAAGCAGATTACTGTAAGGGCACTGGTGGCAGATTGTGGTGGAGAGAGGGCTGAGTGACCCAGAGCAAAGCCTGCCCGGGTTACTCGCTGCCACTTCAGGAGAGGGATTGTATCAGCTCTCATTACCTTTTGTCATGAGGCAGTTCATAAATTAAATATGATATCATGCATTATCTCAAAATATTTCTATATTAATTAGATAATTCACGATGTAAAACGTGTTCATGCAGAAGCAAAGGCGGATGTAATAGTCAAGTATCAGGGAAAAACCCCTTTAGGATACACAGACATTAAAAATGTAAAAAGTAGCTTATAAGAAATGTGGATTATCAGATTTTTACTATATATAGGTTGTGTTTAATAGTAATTTCTGACACCTGCACATAGATGAAGAAAAGGCAGTTGTTACCACTTTTCACCATTCAAAAAATGGGCTTGTCTCTTAGAGTATTGGTTAATGCTTTGCTTATTTGTTAATGAAGACAGCATTTTAATTTTAAAGCTTCCTTTTGTAGGACTGATGGCACGGGCAGAATCACATTTAAGAAAAATGGTTTGGAACACTTTTTAATAAAAAATTGTAAAATCAGTTTCCAGTGTGGTCAAAATTAGAATGTAAAGGAAAGCATTTTTAAGAAAATACAGAAGCCCAAATCAAGGGAGAGTAATATAAAAGGAAATATTTTAAATTAAGAAAAGGAGGTGTTATAGTTTATTACATCATGAATTATGCTTTCTGTACTTACGCTCTTAGTGAAGGAGATAACATTGAAGTGAGAAAATGAACATTCTCAGTTATTTGCGAAGTTAGTAAAATTGCAGTCCCTATTCCATTTTTTTCTGATGAAAATGGATACATGAGATCTCATTTATTGCTCTCCTCAACACCTTTACTGTCCCAGATTCCATTCACGTTCCAAATCGTGGACAGTAAAACTGAAGTCAGGTAAACACAGTCACAGGTACAACTGGGAGCAAGTTTTAACATAGTGGTAATTTTGCAAATGCCAACATGAATACTAGTGAGTACTCAATTTACGACAGACAATTTCACAAAAACCAACCACAGAGTGATTTGATATTCTTGCTTCTTAGAGAGTTTTCTAATCCATATAATGCAATGGGTCAGGTTGCTCATATGATTAAAAAAATTAATCCTGTAGAAATGATGTATTAGACATCTCTAACCCAAGAAAAAGATGTCTTTTGTATAACTTTTAAATTCCCATTTGTCTATCTTAGGACAAATGATGACTTCTTCGTGTAGTAATGAAAACGTCTAAATCCTGCTCTGTGGAGAAAAGCTAGAACCATGGGACATTAAGCAAGAATACTCCTCTGATTTAGGCTCCCAGACTACAACTAACAGTCTTTATGTATTTATCATCTTGGTTATTGTTTTATCTCAAGCATATACAGTGTGCAGAAAGTAGAATAATGAATAAAATATGACCATGGAGAAAACCCATAACTTTTGCTTCTATTATAGAAAGCAGTGTTTGTTCCTTTTAATTTATTACATGTTCACATTGAAACATTAACATCTACAATATTGTCTTTCAGTTTACTCTTCAATTACTAAAGCAAATGATTTTGATTTATAGCACTTACACAACTGCAGTTCAGGTCACAGAATTGAAATCTATTTGATAATGTCTCAGCATTCTCATGGGCAGCCAGGAAAAAAAAAAGAGAGAGAAAGACAAATAGAAATTTTAGTGGGTTCAGATAAATGATTATTCTGACAAACCTGGAAAATAGTAATTAAACAGTTCATTCCAAAAGACCCCAATGTAAACTCTGCTCACATACATAATTTGTATAAGGAAAATGTATGAGTTTTTTTCTTAAAAATAAATAGAAGCATCATTGCATTTATAACAGATTGATCAATCTTATGAACAGATTACATTGGGAAAGTCACTATTATTGCTGTGTGTTTGTATATTTTATTCTTTCCTTTTTTGTGTGAGCATCTACTATGTGCCAGGCAGTGACTGTGTCTGAGTGAATGTATCCATGGTGAGCACTCAGGCGCCATCACTGCCTTCTTGGGGCTTACACCCTATTGGGGTGTCAGAGATATTATAACACTCAATATTGACCCAATGGGATGAAAATTGTTATCTTCATGATTTCTTCCAATGGGCTTAGATTTGTTGGGACAGGGCAGAATTAGAATAATTATTTCTCACATATAAGAGTAAGTGATATGAGATTGGGAATTTCTTGCCAACACTCAAGCAAACTGCAGAAGATAATTACTCCATTTTACTAGCTCACCTAGTTTCTGAAGGATGGGGTGGGGAGTGAGACATGGAGCCTCTGGGGACAAGGATAGGGGGGTGGGACTGTCCCAGTGGAGGGTGCCACTGGAAGCCTCCACCCAAGTGGGCCAGCAGCTGTGCAAGGGTGCAGCAGTAGGCTGGTGAAAGCCAGGTTGTCCAGATCTTTCTAGGGGAAGAGAAGGATTATAGAAAAGGAGAAAAGGGAGGAGCAAGAACATCTCTCCATGGCCTATTTTTATTTTTGTTCCCAAGAGACTAGTGTAATAACCTTATGCCCCCAAAGACAGCCCAGAACTGAGTATCTTCAGTGTTCCTGAGTGTAAATCAGTGAATCTGTTATATAGAAAGTTAACATTTCAGGAGCACAATTATTTCCTGATTTCAAATATGAACAGAAGACTAAATGTCATTTTTTTAAATCATAAATTTGGTATCCATAGTTACTTTACACATTCCAGAGTCTAAGCATGGAATTTAAGTTTTGTATTTTGAACAAAAATAGCAACATCTGTTTTCTGTATGGCAAAGAAAAACTAAATCCCAGACTTTTATTTTTAACCACAGAAACCATCACTTCTTTCTAAATTATTTGCTTGCCTGCTCATTTCCCCTAAACATCTCTGTTTATGCCAATGGCTTTTTAAATCCAAATAATACTAGTTATTGCCAAATTGCATTAGAATCCTATTGAATTAGAATAATTCATATACTTCATATACTAGGCAGTAAATGGTTAGAGACGGTAAAGATCTGATTGTGATCAAAAGTAGGGTTTTTGTTTTGTTTTTAATCATGAGCACATATAAAAGGAAATTCAAATGAAACCAAGCCAATTTCTGATTTAGTAAGATTAAAACCATAGATGGAGCTCAGTTATTAAGGATGGAAAGGAGGAAAGCACAGAGTGAGGAGAGAAAAAGGGGAAGGAAAAAAAGTAGTGTTTTTTTGGGGAACAGTATAATGTCTCAGAAGTTCTTCTCTCTTATCCTGCTGATGTTGAGACAGTGGCTTTGTATAAGCTTTTATTTATACCTATTTCAACATCATGAAAATTTTTCCATCAGCATTTTCTTGCAACTTTAAAAATCACAAGGGATTATTTGTTTATAAAGAGATACAGGATCTATAATTTATTGGCAATACTTTATTTTAGGAATCTTCAAATTGTACTTAATAAATAAATCACAGGTCAAAATGACTGTAAAATCAATCAGGCTTTCTCGTAAGTTATTTCCTGAAAACCATCCATGATAAATACAACAAGGCTTGGCGAAACCTCATTACTCTTGGAAGTCTTCAGAGGTTATTATACCTACTGATCTGTATTTGTCTCTAAGAGACATTTGAAACACAGTTACAATGTCAATTTGGTGTAACATTACCTGTAGTAGAGCTCAGAGTATATGGCAGTGCACGGTCACTCAAGATGCATGGCGTGTCATTTGGGTCGCTTTGATGGGTGCTCGGGTAGAACTAGCCTTGTAGAGACTAATGTGTTCATGCTATCTCTGATCCTGTGGTGTTGTATAAAAATGAACAGCTAAAAATTTACCCATGACAAGATTAAAGCAAAAATAAACACAAAGTTGTTAGACTTTAAAAAAAAAAAAAAAA</dnaseq>| | ||
}} | }} | ||
− | [[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG036539]] | + | [[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG036539]][[Category:Transcripts]] |
Revision as of 09:41, 16 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
Please input transcriptomic nomeclature information here.
Function
Please input function information here.
Regulation
Please input regulation information here.
Expression
Please input expression information here.
Allelic Information and Variation
Please input allelic information and variation information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this lncRNA
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT093004 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
4262 nt |
Genomic location |
chr3+:160792441..160796690 |
Exon number |
1 |
Exons |
160792441..160796690 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 TCTGTTTGTT ATTTTTACCA CTGTTGAACA GCAAACTGTT GAGGCTAGGG TTGATTATTG ATAATTTTTA TGTGTTTAGT 000080
000081 AATAACCACA GCATCATACG TACAACTGCT TTAATAAATC AAAGTTAAGG ACTTTGAGGA GAGCATGTAG CAAGTATTCA 000160 000161 TTTTAACAAA TAATCACAGA CAGTTTCCCT GTTCAAAGCT CCACCAAAAA GCAAGCATGC AGCAAAGGCA TAGACTGTAT 000240 000241 TTAGAGATGT GGTTTCATTT ATTCTTGAAG TCCTATAACC TTGCATTATT TAAACACAAA ATCCCACCTA ACATTTGCCA 000320 000321 AATCCAAGTT AATCTCAAAA ACCTCCGAGG ACATTGAGCA CAAGCAGATT ACTGTAAGGG CACTGGTGGC AGATTGTGGT 000400 000401 GGAGAGAGGG CTGAGTGACC CAGAGCAAAG CCTGCCCGGG TTACTCGCTG CCACTTCAGG AGAGGGATTG TATCAGCTCT 000480 000481 CATTACCTTT TGTCATGAGG CAGTTCATAA ATTAAATATG ATATCATGCA TTATCTCAAA ATATTTCTAT ATTAATTAGA 000560 000561 TAATTCACGA TGTAAAACGT GTTCATGCAG AAGCAAAGGC GGATGTAATA GTCAAGTATC AGGGAAAAAC CCCTTTAGGA 000640 000641 TACACAGACA TTAAAAATGT AAAAAGTAGC TTATAAGAAA TGTGGATTAT CAGATTTTTA CTATATATAG GTTGTGTTTA 000720 000721 ATAGTAATTT CTGACACCTG CACATAGATG AAGAAAAGGC AGTTGTTACC ACTTTTCACC ATTCAAAAAA TGGGCTTGTC 000800 000801 TCTTAGAGTA TTGGTTAATG CTTTGCTTAT TTGTTAATGA AGACAGCATT TTAATTTTAA AGCTTCCTTT TGTAGGACTG 000880 000881 ATGGCACGGG CAGAATCACA TTTAAGAAAA ATGGTTTGGA ACACTTTTTA ATAAAAAATT GTAAAATCAG TTTCCAGTGT 000960 000961 GGTCAAAATT AGAATGTAAA GGAAAGCATT TTTAAGAAAA TACAGAAGCC CAAATCAAGG GAGAGTAATA TAAAAGGAAA 001040 001041 TATTTTAAAT TAAGAAAAGG AGGTGTTATA GTTTATTACA TCATGAATTA TGCTTTCTGT ACTTACGCTC TTAGTGAAGG 001120 001121 AGATAACATT GAAGTGAGAA AATGAACATT CTCAGTTATT TGCGAAGTTA GTAAAATTGC AGTCCCTATT CCATTTTTTT 001200 001201 CTGATGAAAA TGGATACATG AGATCTCATT TATTGCTCTC CTCAACACCT TTACTGTCCC AGATTCCATT CACGTTCCAA 001280 001281 ATCGTGGACA GTAAAACTGA AGTCAGGTAA ACACAGTCAC AGGTACAACT GGGAGCAAGT TTTAACATAG TGGTAATTTT 001360 001361 GCAAATGCCA ACATGAATAC TAGTGAGTAC TCAATTTACG ACAGACAATT TCACAAAAAC CAACCACAGA GTGATTTGAT 001440 001441 ATTCTTGCTT CTTAGAGAGT TTTCTAATCC ATATAATGCA ATGGGTCAGG TTGCTCATAT GATTAAAAAA ATTAATCCTG 001520 001521 TAGAAATGAT GTATTAGACA TCTCTAACCC AAGAAAAAGA TGTCTTTTGT ATAACTTTTA AATTCCCATT TGTCTATCTT 001600 001601 AGGACAAATG ATGACTTCTT CGTGTAGTAA TGAAAACGTC TAAATCCTGC TCTGTGGAGA AAAGCTAGAA CCATGGGACA 001680 001681 TTAAGCAAGA ATACTCCTCT GATTTAGGCT CCCAGACTAC AACTAACAGT CTTTATGTAT TTATCATCTT GGTTATTGTT 001760 001761 TTATCTCAAG CATATACAGT GTGCAGAAAG TAGAATAATG AATAAAATAT GACCATGGAG AAAACCCATA ACTTTTGCTT 001840 001841 CTATTATAGA AAGCAGTGTT TGTTCCTTTT AATTTATTAC ATGTTCACAT TGAAACATTA ACATCTACAA TATTGTCTTT 001920 001921 CAGTTTACTC TTCAATTACT AAAGCAAATG ATTTTGATTT ATAGCACTTA CACAACTGCA GTTCAGGTCA CAGAATTGAA 002000 002001 ATCTATTTGA TAATGTCTCA GCATTCTCAT GGGCAGCCAG GAAAAAAAAA AGAGAGAGAA AGACAAATAG AAATTTTAGT 002080 002081 GGGTTCAGAT AAATGATTAT TCTGACAAAC CTGGAAAATA GTAATTAAAC AGTTCATTCC AAAAGACCCC AATGTAAACT 002160 002161 CTGCTCACAT ACATAATTTG TATAAGGAAA ATGTATGAGT TTTTTTCTTA AAAATAAATA GAAGCATCAT TGCATTTATA 002240 002241 ACAGATTGAT CAATCTTATG AACAGATTAC ATTGGGAAAG TCACTATTAT TGCTGTGTGT TTGTATATTT TATTCTTTCC 002320 002321 TTTTTTGTGT GAGCATCTAC TATGTGCCAG GCAGTGACTG TGTCTGAGTG AATGTATCCA TGGTGAGCAC TCAGGCGCCA 002400 002401 TCACTGCCTT CTTGGGGCTT ACACCCTATT GGGGTGTCAG AGATATTATA ACACTCAATA TTGACCCAAT GGGATGAAAA 002480 002481 TTGTTATCTT CATGATTTCT TCCAATGGGC TTAGATTTGT TGGGACAGGG CAGAATTAGA ATAATTATTT CTCACATATA 002560 002561 AGAGTAAGTG ATATGAGATT GGGAATTTCT TGCCAACACT CAAGCAAACT GCAGAAGATA ATTACTCCAT TTTACTAGCT 002640 002641 CACCTAGTTT CTGAAGGATG GGGTGGGGAG TGAGACATGG AGCCTCTGGG GACAAGGATA GGGGGGTGGG ACTGTCCCAG 002720 002721 TGGAGGGTGC CACTGGAAGC CTCCACCCAA GTGGGCCAGC AGCTGTGCAA GGGTGCAGCA GTAGGCTGGT GAAAGCCAGG 002800 002801 TTGTCCAGAT CTTTCTAGGG GAAGAGAAGG ATTATAGAAA AGGAGAAAAG GGAGGAGCAA GAACATCTCT CCATGGCCTA 002880 002881 TTTTTATTTT TGTTCCCAAG AGACTAGTGT AATAACCTTA TGCCCCCAAA GACAGCCCAG AACTGAGTAT CTTCAGTGTT 002960 002961 CCTGAGTGTA AATCAGTGAA TCTGTTATAT AGAAAGTTAA CATTTCAGGA GCACAATTAT TTCCTGATTT CAAATATGAA 003040 003041 CAGAAGACTA AATGTCATTT TTTTAAATCA TAAATTTGGT ATCCATAGTT ACTTTACACA TTCCAGAGTC TAAGCATGGA 003120 003121 ATTTAAGTTT TGTATTTTGA ACAAAAATAG CAACATCTGT TTTCTGTATG GCAAAGAAAA ACTAAATCCC AGACTTTTAT 003200 003201 TTTTAACCAC AGAAACCATC ACTTCTTTCT AAATTATTTG CTTGCCTGCT CATTTCCCCT AAACATCTCT GTTTATGCCA 003280 003281 ATGGCTTTTT AAATCCAAAT AATACTAGTT ATTGCCAAAT TGCATTAGAA TCCTATTGAA TTAGAATAAT TCATATACTT 003360 003361 CATATACTAG GCAGTAAATG GTTAGAGACG GTAAAGATCT GATTGTGATC AAAAGTAGGG TTTTTGTTTT GTTTTTAATC 003440 003441 ATGAGCACAT ATAAAAGGAA ATTCAAATGA AACCAAGCCA ATTTCTGATT TAGTAAGATT AAAACCATAG ATGGAGCTCA 003520 003521 GTTATTAAGG ATGGAAAGGA GGAAAGCACA GAGTGAGGAG AGAAAAAGGG GAAGGAAAAA AAGTAGTGTT TTTTTGGGGA 003600 003601 ACAGTATAAT GTCTCAGAAG TTCTTCTCTC TTATCCTGCT GATGTTGAGA CAGTGGCTTT GTATAAGCTT TTATTTATAC 003680 003681 CTATTTCAAC ATCATGAAAA TTTTTCCATC AGCATTTTCT TGCAACTTTA AAAATCACAA GGGATTATTT GTTTATAAAG 003760 003761 AGATACAGGA TCTATAATTT ATTGGCAATA CTTTATTTTA GGAATCTTCA AATTGTACTT AATAAATAAA TCACAGGTCA 003840 003841 AAATGACTGT AAAATCAATC AGGCTTTCTC GTAAGTTATT TCCTGAAAAC CATCCATGAT AAATACAACA AGGCTTGGCG 003920 003921 AAACCTCATT ACTCTTGGAA GTCTTCAGAG GTTATTATAC CTACTGATCT GTATTTGTCT CTAAGAGACA TTTGAAACAC 004000 004001 AGTTACAATG TCAATTTGGT GTAACATTAC CTGTAGTAGA GCTCAGAGTA TATGGCAGTG CACGGTCACT CAAGATGCAT 004080 004081 GGCGTGTCAT TTGGGTCGCT TTGATGGGTG CTCGGGTAGA ACTAGCCTTG TAGAGACTAA TGTGTTCATG CTATCTCTGA 004160 004161 TCCTGTGGTG TTGTATAAAA ATGAACAGCT AAAAATTTAC CCATGACAAG ATTAAAGCAA AAATAAACAC AAAGTTGTTA 004240 004241 GACTTTAAAA AAAAAAAAAA AA |
Predicted Small Protein
Name | NONHSAT093004_smProtein_3530:3730 |
Length | 67 |
Molecular weight | 8060.4518 |
Aromaticity | 0.151515151515 |
Instability index | 66.1289393939 |
Isoelectric point | 10.3692016602 |
Runs | 9 |
Runs residual | 0.0142442387951 |
Runs probability | 0.0321203556497 |
Amino acid sequence | MERRKAQSEERKRGRKKSSVFLGNSIMSQKFFSLILLMLRQWLCISFYLYLFQHHENFSI SIFLQL |
Secondary structure | LLHHHHHHHHHHLLLLLLLEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLE EEEEEL |
PRMN | LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLL LLLLLL |
PiMo | iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTToooooooooo oooooo |