Difference between revisions of "NONHSAT011817"

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Revision as of 10:02, 16 October 2014

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Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT011817

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

2823 nt

Genomic location

chr10-:26213307..26217199

Exon number

2

Exons

26213307..26215945,26217038..26217199

Genome context

Sequence
000001 GTTGCAGTGA GCCAAGATTG TGCCATTGCA CTCCAGCCTG GGTGACAGAG CGAGACTTCG TCTCAGAAAA AAAAAAAAAA 000080
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000961 GTAAACCTTA TGCATGACCT TTGTATTTAC AGAACAAATG AAGCATCCAT TAACTTCGAA TGATCAGATG CTAGGGTGTG 001040
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002161 ATTAGCTATA ATTATTACTG TTGTGTCATC ATTATTATAA TTACCATCAT TTTCTCACAG AAGCATTTCA GGGCTGTTAT 002240
002241 TACAAAACTC TTTCCCTTGT GTTTCCAATA TGCCAACTAT TTCAATCAAG AAAATTAATA GCCTATGGAA AGACAGTGGC 002320
002321 CTTTGTCATC ACTACGATTG ATTCTATTAA ATGTATTAAA AGTAATGGCA AAAACCCCAA TTACTTTTGC ACCAGCATAA 002400
002401 AATCACTAGG TGCATGAATT TTGCATAATT CTTTTAATTT CTCAGAACCT TGATGTTTCT CATTTGTTCA ACCAGGTAGA 002480
002481 TATTATTAAT CCCTTCAAAG AGATGTGAAG AACAAAGTTC AGAAATGTTA AGGACGGTAA ACGATATCAT ATTTAAGGGC 002560
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002721 ATTTTTTACT TTAATTGCCT GGTATTAAGT TTTCTGCAGG AATACAAATA AAATTGCTTG TATGGCTTTG AGAAACTACA 002800
002801 GTTAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT011817_smProtein_1823:1909
Length 29
Molecular weight 3390.9063
Aromaticity 0.178571428571
Instability index 44.0396428571
Isoelectric point 8.24859619141
Runs 5
Runs residual 0.0246478873239
Runs probability 0.000830242006712
Amino acid sequence MFYQLPGYLFSPVKLTHETNHHKTQLLF
Secondary structure LEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLL
PRMN -
PiMo -