Difference between revisions of "NONHSAT131812"

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Latest revision as of 07:19, 17 October 2014

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT131812

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intronic(S)

Length

2707 nt

Genomic location

chr9+:72935053..72937759

Exon number

1

Exons

72935053..72937759

Genome context

Sequence
000001 AGTCACACAA GTGCTTTTCC TTGAAACAAC ATTTATACTT TTGAATATAC TACAAATATT TAATAAGCAC AGCCTGCCCT 000080
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002641 GTGAGCTGAG ATTGTGCTGC TGCACTCCAG CCTAGGCAAA AGAATAAGAC TCCTATCTCA AACAAAC
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT131812_smProtein_308:412
Length 35
Molecular weight 4158.9182
Aromaticity 0.235294117647
Instability index 46.2941176471
Isoelectric point 5.30230712891
Runs 4
Runs residual 0.0685033507074
Runs probability 0.0
Amino acid sequence MDGYVCMEHIQTFFLSLFLKQYNITTIYIAFMLY
Secondary structure LLLEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
PiMo oooooooooooooooTTTTTTTTTTTTTTTTTTi