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− | [[Category:Intergenic]] | + | [[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG025378]] |
Revision as of 10:35, 13 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
Please input transcriptomic nomeclature information here.
Function
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Regulation
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Expression
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Allelic Information and Variation
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Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this lncRNA
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References
Please input cited references here.
Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT063998 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
6041 nt |
Genomic location |
chr19+:28283686..28301979 |
Exon number |
3 |
Exons |
28283686..28284140,28284440..28284558,28296513..28301979 |
Genome context |
|
Sequence |
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ctatggatat tcagttttcc cagcatcatt tacagaaaag accatcattt 005600 005601 atccagtgta tgttattggt gtctttgtca aaaatgagtt cactacaaat gtatgaattt tcttctggat tcactattct 005680 005681 gttctattgg tctacatgtc tgttttaatg tcagtaccat gctgttttgg ttagtatatc tttacagact attttgaagc 005760 005761 caagtagtgt ggtggttcca gttttgtttg gttttgcttt tgcttaagat gcctttgaat attcttttat gtggttttat 005840 005841 ataaatatta gaattttgtt tctacttctg tgaagaatgt cattggtatt ttgatgggat tgcattaaat ctgtaaattg 005920 005921 atttggcagt atgaacattt taacaacatt gattatttta tttcatgcaa tataaaatac cttttcattt tgtttcatct 006000 006001 tctttaattt ctttaattta tattttacag attcattata g |
Predicted Small Protein
Name | NONHSAT063998_smProtein_1094:1267 |
Length | 58 |
Molecular weight | 6942.1101 |
Aromaticity | 0.298245614035 |
Instability index | 57.0684210526 |
Isoelectric point | 5.97808837891 |
Runs | 5 |
Runs residual | 0.0662280701754 |
Runs probability | 0.0171347818407 |
Amino acid sequence | MPGIRWMRVLVQLQLHLHELGGERDADFFFLFLPSFLPSNFLPSFPFLSFFFFFFFF |
Secondary structure | LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEL |
PRMN | LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL |
PiMo | iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTToo |