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gtaactaatagatatcttgtgataggatactttgaggccagctaggtaaatgtcttatttctcattaaacgtcccctcactagttttggcaAATGTTtttatgtcacttcaaaattcctatgtagaaatcctaactcccaatatgatggtattagaagatagggcatttgttaggtgattaggtcatgagagtggagacctcatgaatggaattagtgcccttatagcagagactctggagcactcccttgccccttgaggacacataagacatttgaggacacaatgagatatccatctatgaacccaggagcaggccctcagaaaatgctgaatttgcctgcagcttgatcttggccttctcagcctcaaaaactgcaagaaataaatttctgttgttcttagagtccacctagtttatggtattttgttatagcagcctgaacaaactgagacaattggtgatttttgtctcactcctttatcattttgatggttgccaaattatgattttccaattgtatcattctttatacatctaatactacattgtactataagaaagaacatttcttcataattggttgattacttaattaatatttgcatggactcaggtactcctatttaatgggttgtgatttcttatggtcattatattgatgctcaaattgttccagatttaactagtgggagctctttcaaaatacctcttaggattttgtaacgtgtcctcattattatttaagtatgtctttactttcttgcattacagcattacaagatgtttcaTTCACAGGCTTTGAAGTTCGTAGCACAGAACTTCTTGCCCTTTGATGTTACCCATTTATGATACCCTATGTCCGACATTTTGTCTCTACACAGACACCAGAATGCTTACTTGACTTTATCGCCACCAGATTCTTGAGCCTCTTCTATGATTCCAGGACCCCTGATTGGATGTGCTCTATTTCCTCTATTTTTAAACCTGTCAGATATTATCTTTGCTTTTCTTAACTTACCACTCTATAACATGGGGTATGATCCTGTACCCTGTGTGCCTTTGATAAGTATTGGTGGACTGATGGTCATGCACAGAAGAGCTTGCCGCACTATAACCCTCAGGAAGAACAGCAAGCTAAAACATATGACCTAACTTCTACAGTTTTTTAGCATCACAAGAACATGCAGGGCACATTATTTTGAATGAGGACACTCAGACCATTAAATGTCAAAGTAGCCTAATTGTTAACGGGACACATGTAGTGAGAAAAATGTGTTTGTACTTGTTGAACAGAAGACAAATGTAGCCGAAAGTATTTAATATTGAAATACAGCTTAATCAGGTGCTTTAAACAATTAAGCCATATAATTTATTAAAGCATGGCTCTGAGTTTAAGTATCAACACTCTTCCTCTCCCATTCTGTTCATCCTTTGGAAGCCTACCTTCCTATCCCCATTTTGTTTAGTCACCTTTGGCTTGAAGTTGACCAGTATTCAGTGGCTAGTGGCTTCTATCTTATGGCAAGAGAAGGAAAAGAGATGAGAAGTAAAAGACAAAAATAATAGAGAAAATATTTAAAGGATTTGAAGCAAAGCATCTGAGGATATAGGTACTGTTTAGCAAATCTGAATATATTGCAACATTATTGCAAGGAAGGAGAGATATGTTAGGGAATTTCAGCACTAAAGATGGTCTACTTTTAGCAGACACATAAAGATAATTTCATTTGAATTTTTAAATTTCCTTTGGCATACAATATGTTCTTTGCTAAGAGAAAATACCTTTCATATGTCATTCTAGGCATTCTTCAACACAAAGCAGGACAAGATGTATTTTAAGGTaaagagtacagacactggaatcagtaggagttgctgtttccattcattagttttgagaccttgagcaagactatgaatgtcagtttcctcatgttaaaacagggatgataatacttattttgttatgtgctataaagcagaggtctccaacccccggggccatggactggtacaggtctgtggcctgttgggaactgggccacacagcaggaggtgagtgaagcttcatctgtatttacagccactcctcatcactcgcattaccacctgagctctatcgcctgtcacatcagcagcattaggttctcacaggagcacaaaccctatggtgaactgctcatgtgaaggatctagcttatgttctccttgtgagaatctaatgcctgatgatctgtccccatctcccatcgcccccagatgggagcatctagttgcaagaaaagaagctcagggctcccactgaatctacatt</dnaseq>|
 
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gtaactaatagatatcttgtgataggatactttgaggccagctaggtaaatgtcttatttctcattaaacgtcccctcactagttttggcaAATGTTtttatgtcacttcaaaattcctatgtagaaatcctaactcccaatatgatggtattagaagatagggcatttgttaggtgattaggtcatgagagtggagacctcatgaatggaattagtgcccttatagcagagactctggagcactcccttgccccttgaggacacataagacatttgaggacacaatgagatatccatctatgaacccaggagcaggccctcagaaaatgctgaatttgcctgcagcttgatcttggccttctcagcctcaaaaactgcaagaaataaatttctgttgttcttagagtccacctagtttatggtattttgttatagcagcctgaacaaactgagacaattggtgatttttgtctcactcctttatcattttgatggttgccaaattatgattttccaattgtatcattctttatacatctaatactacattgtactataagaaagaacatttcttcataattggttgattacttaattaatatttgcatggactcaggtactcctatttaatgggttgtgatttcttatggtcattatattgatgctcaaattgttccagatttaactagtgggagctctttcaaaatacctcttaggattttgtaacgtgtcctcattattatttaagtatgtctttactttcttgcattacagcattacaagatgtttcaTTCACAGGCTTTGAAGTTCGTAGCACAGAACTTCTTGCCCTTTGATGTTACCCATTTATGATACCCTATGTCCGACATTTTGTCTCTACACAGACACCAGAATGCTTACTTGACTTTATCGCCACCAGATTCTTGAGCCTCTTCTATGATTCCAGGACCCCTGATTGGATGTGCTCTATTTCCTCTATTTTTAAACCTGTCAGATATTATCTTTGCTTTTCTTAACTTACCACTCTATAACATGGGGTATGATCCTGTACCCTGTGTGCCTTTGATAAGTATTGGTGGACTGATGGTCATGCACAGAAGAGCTTGCCGCACTATAACCCTCAGGAAGAACAGCAAGCTAAAACATATGACCTAACTTCTACAGTTTTTTAGCATCACAAGAACATGCAGGGCACATTATTTTGAATGAGGACACTCAGACCATTAAATGTCAAAGTAGCCTAATTGTTAACGGGACACATGTAGTGAGAAAAATGTGTTTGTACTTGTTGAACAGAAGACAAATGTAGCCGAAAGTATTTAATATTGAAATACAGCTTAATCAGGTGCTTTAAACAATTAAGCCATATAATTTATTAAAGCATGGCTCTGAGTTTAAGTATCAACACTCTTCCTCTCCCATTCTGTTCATCCTTTGGAAGCCTACCTTCCTATCCCCATTTTGTTTAGTCACCTTTGGCTTGAAGTTGACCAGTATTCAGTGGCTAGTGGCTTCTATCTTATGGCAAGAGAAGGAAAAGAGATGAGAAGTAAAAGACAAAAATAATAGAGAAAATATTTAAAGGATTTGAAGCAAAGCATCTGAGGATATAGGTACTGTTTAGCAAATCTGAATATATTGCAACATTATTGCAAGGAAGGAGAGATATGTTAGGGAATTTCAGCACTAAAGATGGTCTACTTTTAGCAGACACATAAAGATAATTTCATTTGAATTTTTAAATTTCCTTTGGCATACAATATGTTCTTTGCTAAGAGAAAATACCTTTCATATGTCATTCTAGGCATTCTTCAACACAAAGCAGGACAAGATGTATTTTAAGGTaaagagtacagacactggaatcagtaggagttgctgtttccattcattagttttgagaccttgagcaagactatgaatgtcagtttcctcatgttaaaacagggatgataatacttattttgttatgtgctataaagcagaggtctccaacccccggggccatggactggtacaggtctgtggcctgttgggaactgggccacacagcaggaggtgagtgaagcttcatctgtatttacagccactcctcatcactcgcattaccacctgagctctatcgcctgtcacatcagcagcattaggttctcacaggagcacaaaccctatggtgaactgctcatgtgaaggatctagcttatgttctccttgtgagaatctaatgcctgatgatctgtccccatctcccatcgcccccagatgggagcatctagttgcaagaaaagaagctcagggctcccactgaatctacatt</dnaseq>|
 
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Latest revision as of 06:44, 17 October 2014

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Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT122818

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

7310 nt

Genomic location

chr7+:113109789..113124124

Exon number

2

Exons

113109789..113110137,113117164..113124124

Genome context

Sequence
000001 tacgggctga actgcatccc ccaaaattag tatgttgaag tcttaatccc aagcacatca caaaatgact atgtttggag 000080
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007281 gaagctcagg gctcccactg aatctacatt
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT122818_smProtein_797:952
Length 52
Molecular weight 5776.8137
Aromaticity 0.117647058824
Instability index 49.6764705882
Isoelectric point 9.78216552734
Runs 9
Runs residual 0.0222286934576
Runs probability 0.0358495750652
Amino acid sequence MKIVILRCPVVEWSFPQSVGSFSFISLSTNPSSFAKLRLIMSTHDAIKMQF
Secondary structure LEEEEEELLLEELLLLLLLLEEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
PRMN -
PiMo -