Difference between revisions of "NONHSAT013489"
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Latest revision as of 20:10, 16 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
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Function
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Regulation
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Expression
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Allelic Information and Variation
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Evolution
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Labs working on this lncRNA
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References
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Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT013489 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
6467 nt |
Genomic location |
chr10+:60058915..60065381 |
Exon number |
1 |
Exons |
60058915..60065381 |
Genome context |
|
Sequence |
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catttaaaaa tcagaagatt ttatccaaaa gatggatttc caacttcttt 005600 005601 tgaatgatct ggtaacatgg gactgtagtc tcagaatgga aaaacagctg ACCTTTAAAG ATAAGGTATT AACTCTCACA 005680 005681 TTttttattt taaataaacc tatttcagtt aagaaatgaa ttactttaaa gaaaaataaa ggtaaataac tagacaggca 005760 005761 gtccttggac atggcctaaa aagtgaaggG GCTCTTAAAT GATGGTTCAA GGCCATAGAG AGCAACACAT GGGCCTCCAG 005840 005841 TTTGTCTACC ACTGCCCACC CTATCCCAGT TCCAACTTCC AACATTTTAG TCAAAATGta tacataagtt ggacatatct 005920 005921 gtaaaatcgt tgtgtattgc ttcctttata aagtgccatc tttgtaatta ttttccaaat ttagtctcat ctgatgttta 006000 006001 tattgcaact tctactttcc tgttatttgt attttcttag aatgtctttg ttcattcttt taaagttttc taagtaattt 006080 006081 taatttagtg ctctctctat atacagagta tacaatgtaa atgttctttg ctttataatc caagcagatt attttataat 006160 006161 agataggttt agcatattta catttatgga tataacagat gagtgctagt tctatcattt ttttgatgat ttctttctta 006240 006241 tttttagctt atttttaatg atatttcact atatgttcta tgcttgtttt gtgttgttac attttttctg acaattggaa 006320 006321 aagtttgtat ttttgtttta TCTTTATTGT GAAATATACA TACTCTTCTA tttgttttgt ttgtttgttt gtttgtttgt 006400 006401 ttTTAGATGG CGTctctggc agccaggctg gaacgcggtg ggtgatctcg gctcactgca acctttg |
Predicted Small Protein
Name | NONHSAT013489_smProtein_1745:1876 |
Length | 44 |
Molecular weight | 5094.6986 |
Aromaticity | 0.116279069767 |
Instability index | 59.0906976744 |
Isoelectric point | 6.21942138672 |
Runs | 5 |
Runs residual | 0.0410243010191 |
Runs probability | 0.0224165341812 |
Amino acid sequence | MFEYSPNNRSRAQCDMEFHDNLPSKQIPFNFHPHLITCTISLN |
Secondary structure | LLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEL |
PRMN | - |
PiMo | - |