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Revision as of 12:40, 13 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

Please input function information here.

Regulation

Please input regulation information here.

Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

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Evolution

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You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT092996

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

sense

Length

4163 nt

Genomic location

chr3-:160212796..160217772

Exon number

2

Exons

160212796..160215639,160216454..160217772

Genome context

Sequence
000001 ACCATCAGTG CTTCAGTTTT CTCTCTATCC AAAGCAAGGT TTTAACTTTC CTTCATTCTC CAGTAAAACA GACCGAGACA 000080
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001761 AGACACAGTC TCGCTCTGTG GCCCAGGCTG GAGTGTAGTG GCGCAATCTC GGCTCACTGC AACCTCTGCC TCAAGGGTTC 001840
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002161 GTATAAGAAA AGTAGATTTA ACATTTTTTT CCCTAAACAC TTAACCCAGA AGTTAACAAT AATCTTGAAA ATTCCTTTTA 002240
002241 AATCCAGGCC CTTTAGGTGA TGGCAGTTTG ACTCAGGATG TCCAAGTCCA GTGTATTTTC AATAAAATTG ACTTGACAGC 002320
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002641 TGATGGATTC CTATCCTAGA CTATGTTACT CTAATATTAC CCAAGATTTT CTCCAGCCTG TTTTTACTCT TACTTTGAAA 002720
002721 CAGCTGTTTA AAATGACTCG TAATCTGCTT AAATCTACAT GCTTTTTGTG GTTCTCAATC CAGTTACCTA CCTTCCAGAT 002800
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003121 CTCCCAAAGT GCTGGGATTG CAGGCGTGAG CCACCGCCTG GCCACCATTT TACTCTTTTT AGGTACAGTA ATCTAATATC 003200
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003281 GGTGGGGGCG GGGAATCAAG ACAACCTTAG TCACTTTGGT ATTACCATAA TTCTTGTCTT TTCAGGGTTG TCCTGTTCAG 003360
003361 CTGCATAAAA CATCATGTAT TCTAGGTATT TCCTACCTTC ACTTACATTT TTACTTGCCG ATGTGCTGCC TTCATAAATG 003440
003441 GGTATATTCC GCCACACATC TAGTAAGCCC CCAATGCAGT ACACAATGTG TATCACTGAT AAAACTCGCA CTTCTGCCAT 003520
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003601 CATATGTTTA TAGAACTCAT ATAGACAAGC TAGTTTTTAA AATCTTCCTT TTAACCAGTT TAGGATGATC TAGGATAGCT 003680
003681 AAGTTACCTA CATGGTGACT GTTCGGTCTA ATTCAGAAAC AGAAGTACTA AAAGAATACT AAAAAGTTTT TACCCATTAT 003760
003761 CTCTATCCCT GTTTTCTTTT TGCAATTCTC AGCTGCAGGG AGCAAGAAAA TACACAGCAG ATAGGAAATG TTTGTTTGCA 003840
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004001 AGTATCTGTT CACTCATTGC TCTATCACAT CTGAGTTTCT CCGTCTTTCT TTCCACTAGA TTGTAAGCTC CTTAAGGGCA 004080
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004161 ATG
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT092996_smProtein_2363:2596
Length 78
Molecular weight 8895.3692
Aromaticity 0.155844155844
Instability index 73.2871428571
Isoelectric point 7.70257568359
Runs 15
Runs residual 0.0587238848108
Runs probability 0.0386857445681
Amino acid sequence MVLQILYDLPPTRGLQYSLVIYIFCPNFCLLHKFYTFCSCLLQITSPFQTISSSTFILHK
ENSNNLFHLGFSITLQA
Secondary structure LEEEEEELLLLLLLEEEEEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLEEEEEE
LLLLLEEELLEEEEEEL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLL
LLLLLLLLLLLLLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTToooooooooooooooo
ooooooooooooooooo