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样本管理模块用于导入、管理和提交样本进行分析。

1. 点击导航栏"样本管理"进入样本管理页面
2. 点击"导入样本和数据"按钮
3. 上传包含样本信息的CSV/TXT文件（必填字段：样本名称、测序类型、测序文件名称）
4. 上传测序数据压缩包（支持.fastq, .fastq.gz, .fq, .fq.gz等格式）
5. 确认导入信息，系统将自动匹配样本信息与测序文件

详细说明了如何正确导入样本信息和测序数据文件。

选择需要分析的样本并指定分析类型。

1. 在样本列表中勾选需要分析的样本
2. 点击"开始分析"按钮
3. 选择分析类型：病原鉴定、耐药检测或抗性鉴定
4. 确认分析信息，点击"开始分析"启动分析任务

分析进度说明

查看已完成的分析结果和下载报告。

1. 点击导航栏"结果查看"进入结果列表页面
2. 在列表中查看各样本的分析进度和检出结果
3. 点击"结果查看"按钮查看详细的分析报告
4. 点击"报告下载"按钮下载单个样本的HTML报告
5. 勾选多个样本后点击"报告批量下载"进行批量下载

详细解读分析报告中的各个部分。

总体分析结果

展示质控数据和候选病原排序信息

质量控制结果

显示原始reads数和质控后reads数，提供完整的质控报告

病原鉴定结果

列出检出的病原物种及其优先级、评分、reads数等详细信息

耐药检测结果

展示耐药基因与药物类别的对应关系

平台提供多种报告下载方式。

单样本报告下载

在结果列表或详情页下载单个样本的完整分析报告（HTML格式）

批量报告下载

勾选多个样本后，可批量下载所有选中样本的报告，系统会自动打包成ZIP文件

批量报告索引

批量下载的ZIP包中包含index.html索引文件，方便快速浏览所有报告

如果您在使用过程中遇到任何问题，请联系技术支持团队。