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【基因的定位】
Pib 基因定位于水稻第2 染色体长臂近末端区域,与RFLP标记RZ123, C379, C2782B 等连锁(Miyamoto et al., 1996; Monna et al., 1997)。 Pib 基因定位于水稻第2 染色体上RFLP 标记S1916 和G7030 之间,遗传距离分别为0.015 cM 和0.045 cM,并与RFLP 标记G7010, G7021 和 G7023 共分离(Wang et al., 1999)。对应于日本晴测序图谱的位置(5'-3')在35109965 - 35109117 区间(Rice Genome Annotation Project: TIGR version6)。
【基因克隆与生物学功能分析】
Pib 基因属于"NBS-LRR"类抗病基因,包含有4个内含子(164 bp, 810 bp, 1340 bp, 308 bp),全长cDNA由306bp 的5'非翻译区(UTR, untranslated regions)、3753bp 的ORF 和229bp 的3'非翻译区等组成。Pib 编码一个由1251 个氨基酸组成的蛋白产物,该产物包含一个核苷酸 结合位点(nucleotide binding site, NBS)和17个富亮氨酸重复序列(leucine-rich repeats, LRRs),其中,氨基端的NBS区存在激酶1a,2和3a结 构域单位,LRRs中部有8个成簇的半胱氨酸残基(Wang et al., 1999)。 Pib 基因会因环境条件的变化而诱导调控,如温度、光照等条件的改变都将影响该基因的表达(Wang et al., 1999)。
【分子标记辅助选择育种】
利用抗稻瘟病基因Pib 自身序列及其等位的感病基因序列建立的分子标记结合运用,可有效地从水稻种质资源中快速而准确地选择出抗稻瘟病基因 Pib,并能在分离世代群体中选择出含抗稻瘟病基因Pib 的纯合单株(刘洋等, 2008)。